Virus hepatitidy B
Aktuální verze stránky ještě nebyla zkontrolována zkušenými přispěvateli a může se výrazně lišit od
verze recenzované 1. října 2022; ověření vyžaduje
1 úpravu .
Virus hepatitidy B |
---|
Mikrofotografie TEM zobrazující viriony viru hepatitidy B |
Skupina:Viry [1]Oblast:RiboviriaKrálovství:PararnaviraeTyp:ArtverviricotaTřída:RevtraviricetesObjednat:BluberviralesRodina:HepadnaviryRod:ortohepadnavirusPohled:Virus hepatitidy B |
Virus hepatitidy B |
VII: dsDNA-RT-viry |
|
Virus hepatitidy B (virus hepatitidy b, "b"; anglicky Hepatitis B virus , HBV) je virus obsahující DNA z rodiny hepadnavirů , původce virové hepatitidy B. Ve světě je podle různých odhadů 3 až 6 % lidí infikováno virem hepatitidy B. Přenášení viru nemusí být nutně doprovázeno hepatitidou, ale nosič viru může infikovat další lidi, stejně jako např. zvířat.
Nemoc
Ačkoli existuje vakcína k prevenci hepatitidy B, virus hepatitidy B zůstává globálním problémem veřejného zdraví. Hepatitida B může být akutní a poté se může stát chronickou, což vede k dalším nemocem a zdravotním stavům [2] . Kromě způsobení hepatitidy může infekce virem hepatitidy B vést k cirhóze a hepatocelulárnímu karcinomu [3] .
Bylo také navrženo, že nemoc může zvýšit riziko rakoviny slinivky [4] .
Klasifikace
Virus hepatitidy B je zařazen do rodu Orthohepadnavirus , který obsahuje 11 dalších druhů. Rod je klasifikován jako součást čeledi Hepadnaviridae , která zahrnuje čtyři další rody: Avihepadnavirus , Herpetohepadnavirus , Metahepadnavirus a Parahepadnavirus [5] . Tato rodina virů je jediným členem virového řádu Blubervirales [5] .
Viry podobné hepatitidě B byly nalezeny u všech velkých lidoopů ( orangutani , giboni , gorily a šimpanzi ), opicích Starého světa [6] a vlněných opicích Nového světa (virus hepatitidy B vlněné opice), což naznačuje starověký původ tohoto viru. u primátů.
Virus je klasifikován do čtyř hlavních sérotypů (adr, adw, ayr, ayw) na základě antigenních epitopů přítomných na jeho obalových proteinech . Tyto sérotypy jsou založeny na společném determinantu (a) a dvou vzájemně se vylučujících párech determinantů (d/y a w/r). Virové kmeny byly také rozděleny do deseti genotypů (AJ) a čtyřiceti subgenotypů v souladu s celkovou variací v nukleotidové sekvenci genomu [7] . Genotypy mají jasnou geografickou distribuci a používají se ke sledování evoluce a přenosu viru. Rozdíly mezi genotypy ovlivňují závažnost onemocnění, průběh a pravděpodobnost komplikací a odpověď na léčbu [8] [9] . Sérotypy a genotypy se nemusí nutně shodovat.
Nezařazené druhy
U netopýrů byla izolována řada dosud neklasifikovaných druhů podobných hepatitidě B [10] .
Morfologie
Struktura virové částice
Virus hepatitidy B je členem rodiny hepadnavirů [11] . Virová částice, nazývaná částice Dane [12] ( virion ), se skládá z vnějšího lipidového obalu a ikosaedrického nukleokapsidového jádra , které je složeno z proteinu . Nukleokapsida obsahuje virovou DNA a DNA polymerázu , která má aktivitu reverzní transkriptázy podobnou retrovirům [13] . Vnější obal obsahuje vložené proteiny, které se podílejí na vazbě viru na vnímavé buňky a pronikání do nich. Virus je jedním z nejmenších obalených zvířecích virů s průměrem virionu 42 nm, ale existují i pleomorfní formy, včetně vláknitých a kulovitých tělísek bez jádra. Tyto částice jsou neinfekční a sestávají z lipidu a proteinu, které tvoří část povrchu virionu nazývaného povrchový antigen ( HBsAg ) a jsou produkovány v nadbytku během životního cyklu viru [14] .
Komponenty
Virus se skládá z:
- HBsAg (povrchový antigen hepatitidy B ) byl prvním objeveným proteinem viru hepatitidy B [15] . Skládá se z malého (S), středního (M) a velkého (L) proteinu [16] .
- HBcAg (hlavní antigen hepatitidy B) je hlavním strukturálním proteinem ikosaedrické nukleokapsidy HBV a podílí se na replikaci viru . Tvorba kapsid je hlavním faktorem buněčné infekce [17] . HBcAg podporuje clearance HBV in vivo , ale není známo, zda HBcAg musí být ve formě kapsidy, aby se napomohlo odstranění viru [18] .
- DNA polymeráza viru hepatitidy B je inkorporována do nukleokapsidy spolu s pregenomickou RNA (pgRNA). Uvnitř kapsidy prochází pgRNA reverzní transkripcí za vzniku (-) řetězce DNA. Současně je většina templátu RNA zničena RNázovou aktivitou polymerázy. Následuje syntéza (+) vlákna DNA a polymeráza se nakonec kovalentně váže na (-) vlákno DNA [19] [20] . Polymeráza je odstraněna poté, co virion infikuje novou buňku.
- HBeAg (antigen obalu hepatitidy B) lze nalézt mezi ikosaedrickým jádrem nukleokapsidy a lipidovým obalem, ale je považován za „nezúčastněný“ a je vylučován a hromadí se v séru. HBeAg a HBcAg jsou vyrobeny ze stejného čtecího rámce [21] .
- HBx je malý, 154 aminokyselin dlouhý , nestrukturální a hraje důležitou roli při onemocnění jater souvisejícím s HBV a při replikaci HBV v buňkách HepG2 [22] . S expresí HBx bylo spojeno mnoho aktivit. Molekulární mechanismy mnoha těchto aktivit však nejsou známy [23] . Tento protein je multifunkční, aktivuje buněčné signální dráhy a je nezbytný pro virovou infekci [24] .
Virus hepatitidy D vyžaduje, aby se obalové částice HBV staly virulentními [25] .
Evoluce
Časný vývoj viru hepatitidy B, stejně jako všech ostatních virů, je obtížné zjistit. Identifikace hepadnavirů u širokého spektra obratlovců naznačuje dlouhou koevoluci. Identifikace endogenních prvků hepadnaviridae společných pro různé druhy ptáků ukazuje na přítomnost tohoto viru u ptáků po dobu nejméně 70 milionů let [26] . Ačkoli podobné důkazy u savců chybí, fylogenetická pozice ortohepadnavirů jako sesterského kladu avigepadnavirů naznačuje přítomnost viru u předků amniotů a následnou koevoluci s ptáky i savci poté, co se rozcházeli (před > 300 miliony let). Bylo také navrženo, že Hepadnavirus New World Bat Hepadnavirus může být zdrojem hepadnavirů primátů [27] . Avichepadnavirům chybí protein X, ale genom kachního hepadnaviru má základní rámec čtení X [28] . Protein X může pocházet z DNA glykosylázy.
Rekonstrukce genomů viru hepatitidy B ze starých lidských pozůstatků nedávno umožnila podrobnější studium evoluce tohoto viru u lidí [29] [30] [31] . V roce 2021 studie rekonstruovala 137 starověkých genomů viru hepatitidy B a prokázala přítomnost viru u lidí po dobu nejméně 10 000 let [29] . Nejnovější společný předek všech známých lidských linií viru hepatitidy B byl datován do doby před 20 000 až 12 000 lety. Nelze však říci, zda se virus vyskytoval u lidí dlouho předtím, nebo byl krátce předtím získán od jiného živočišného druhu. Ukázalo se, že vývoj viru hepatitidy B u lidí odráží dobře známé události v historii lidstva, jako je první osídlení Ameriky v pozdním pleistocénu a přechod neolitu v Evropě [29] . Tyto studie také ukázaly, že některé staré kmeny viru hepatitidy B stále infikují lidi, zatímco jiné vymřely [29] [30] [31] . Zdá se, že kmeny HBV nalezené u opic z Afriky a jihovýchodní Asie (šimpanzi, gorily, orangutani a giboni) jsou příbuzné s lidskými kmeny HBV, což může odrážet minulý mezidruhový přenos [32] [29] .
Studie izolátů z cirkumpolární arktické lidské populace ukázala, že předkem je subgenotyp B5 (endemický typ nalezený v této populaci), že tento rodový virus pochází z Asie asi před 2000 lety (95 % HPD 900 př. n. l. - 830 n. l.) [33] . Ke spojení došlo kolem roku 1000 našeho letopočtu. E. Tento subgenotyp se rozšířil z Asie nejprve do Grónska a poté se rozšířil na západ během posledních 400 let.
Struktura genomu
Velikost
Genom viru hepatitidy B je tvořen kruhovou DNA , což je však neobvyklé, protože DNA není plně dvouvláknová. Jeden konec řetězce plné délky je spojen s virovou DNA polymerázou . Délka genomu je 3020–3320 nukleotidů (pro celý řetězec) a 1700–2800 nukleotidů (pro krátký řetězec) [34] .
Kódování
Negativní (nekódující) řetězec je komplementární k virové mRNA. Virová DNA se nachází v jádře krátce po infekci buňky. Částečně dvouvláknová DNA se stává plně dvouvláknovou dokončením (+) sense vlákna buněčnými DNA polymerázami (virová DNA polymeráza se používá v pozdější fázi) a odstraněním virového polymerázového proteinu (P) z (-) sense vlákna a krátká sekvence RNA z (+) sémantického vlákna. Nekódující báze jsou odstraněny z konců (-) sense vlákna a konce jsou spojeny.
Virové geny jsou transkribovány buněčnou RNA polymerázou II v buněčném jádře s kovalentně uzavřenou kruhovou DNA (cccDNA). V genomu HBV byly identifikovány dva zesilovače, označené jako zesilovač I (Enhl) a zesilovač II (EnhII). Oba enhancery jsou vysoce aktivní v buňkách jaterního původu a společně řídí a regulují expresi úplných virových transkriptů [35] [36] [37] .
Existují čtyři známé geny kódované genomem, nazývané C, P, S a X. Jádrový protein je kódován genem C (HBcAg) a jeho startovacímu kodonu předchází startovací kodon AUG, ze kterého je produkován prekoordinační protein . HBeAg se tvoří jako výsledek proteolytického zpracování proteinu předcházejícího jádru. DNA polymeráza je kódována genem P. Gen S je gen, který kóduje povrchový antigen (HBsAg). Gen HBsAg je jeden dlouhý otevřený čtecí rámec, ale obsahuje tři in-frame „start“ (ATG) kodony, které rozdělují gen do tří sekcí: pre-S1, pre-S2 a S. Vzhledem k mnoha startovacím kodonům polypeptidy mají tři různé velikosti, nazývají se velké, střední a malé (pre-S2).-S1 + pre-S2+ S, pre-S2+ S nebo S se vyrábí [38] .
Funkce proteinu kódovaného genem X není plně objasněna [39] , ale některé důkazy naznačují, že může fungovat jako transkripční transaktivátor. Je zajímavé, že fúzní protein X-nucleus o velikosti 40 kDa je kódován dlouhým virovým transkriptem o velikosti 3,9 kb, jehož funkce zůstává nejasná [40] . Syntéza 3,9 kb RNA je zahájena v promotorové oblasti genu X a transkript je polyadenylován až po druhém kole transkripce. Podobné chování je typické pro další typy dlouhých pregenomických/prenukleárních (pg/pc) RNA. Virový transkripční mechanismus tedy musí ignorovat poly(A) signál v prvním kole transkripce.
V genomu HBV bylo identifikováno několik nekódujících prvků RNA . Patří mezi ně: HBV PREalpha , HBV PREbeta a signál enkapsidace HBV epsilon RNA [41] [42] .
Genotypy
Je známo osm genotypů označených od A do H [8] . Byl popsán možný nový genotyp „I“ [43] , ale přijetí tohoto označení není univerzální [44] .
Rozdíly mezi genotypy jsou více než 8 %. Genotypy A a D jsou všudypřítomné; genotypy C a B jsou typické pro jihovýchodní Asii a Japonsko. Genotyp E je distribuován převážně v Africe. Genotyp F byl nalezen mezi původními populacemi Jižní Ameriky a Aljašky. Genotyp G se vyskytuje sporadicky v různých částech světa, zejména ve Spojených státech amerických a ve Francii. Genotypy E a G se vyznačují nízkou variabilitou v sekvenci nukleotidů v genomu ve srovnání s jinými genotypy.
Genotypy viru hepatitidy B mohou mít různé biologické vlastnosti. V poslední době je v klinických aspektech průběhu virové infekce stále důležitější genotyp viru a také citlivost na antivirotika. Dosud bylo zjištěno, že infekce způsobená virem hepatitidy B genotypů B a C koreluje s poškozením jater; a infekce způsobená virem hepatitidy B genotypu A je účinně vyléčena terapeutickými metodami používajícími interferon.
Genotyp D má 10 subgenotypů [45] [7] .
Replikace viru
Životní cyklus viru hepatitidy B je složitý. Hepatitida B je jedním z mála známých neretrovirových virů, které využívají reverzní transkripci jako součást procesu replikace.
Přistoupení
Virus vstupuje do buňky vazbou na receptory na buněčném povrchu a dostává se do ní
endocytózou zprostředkovanou buď
klatrinem nebo
kaveolinem-1 [46] . HBV se zpočátku váže na
proteoglykan heparinsulfát . Pre-S1 segment proteinu HBV L se pak pevně váže na kotransportující polypeptid taurokolátu sodného (NTCP) kódovaný genem slc10a1
[47] . NTCP se nachází hlavně v sinusové membráně
jaterních buněk . Přítomnost NTCP v jaterních buňkách koreluje s tkáňovou specificitou infekce HBV
[46] .
Průnik
Po endocytóze se virová membrána spojí s membránou hostitelské buňky a uvolní nukleokapsidu do cytoplazmy
[48] .
Odstranění krytu
Protože se virus replikuje pomocí RNA produkované hostitelským enzymem, musí být virová genomová DNA přenesena do buněčného jádra. Předpokládá se, že kapsida je transportována přes
mikrotubuly do
jaderného póru . Jádrové proteiny se disociují z částečně dvouvláknové virové DNA, která se pak stane plně dvouvláknovou (pomocí hostitelských DNA polymeráz) a převede se na kovalentně uzavřenou kruhovou DNA ( cccDNA ), která slouží jako transkripční templát pro čtyři virové
mRNA .
replikace
Největší mRNA (která je delší než virový genom) se používá k vytvoření nových kopií genomu ak produkci
kapsidového jádrového proteinu a virové RNA-dependentní
DNA polymerázy .
Shromáždění
Tyto čtyři virové transkripty procházejí dalším zpracováním a pokračují v produkci virionů potomstva, které se uvolňují z buňky nebo se vracejí do jádra a recyklují, aby se vytvořilo ještě více kopií
[38] [49] .
Uvolnění
Dlouhá mRNA je pak transportována zpět do cytoplazmy, kde protein P virion syntetizuje DNA prostřednictvím své aktivity reverzní transkriptázy.
Transaktivované geny
HBV má schopnost transaktivovat FAM46A [50] .
Prevence
Výše zmíněný povrchový antigen HBsAg, umístěný ve vnějším obalu, se používá k výrobě vysoce účinné profylaktické vakcíny .
Viz také
Poznámky
- ↑ Taxonomie virů na webu Mezinárodního výboru pro taxonomii virů (ICTV) .
- ↑ Hu, J.; Protzer, U.; Siddiqui, A. (2019). „Opětovná návštěva viru hepatitidy B: Výzvy léčebných terapií“ . Virologický časopis . 93 (20). DOI : 10.1128/JVI.01032-19 . PMC 6798116 . PMID 31375584 .
- ↑ Schwalbe M, Ohlenschläger O, Marchanka A, Ramachandran R, Häfner S, Heise T, Görlach M (březen 2008). „Struktura roztoku kmenové smyčky alfa post-transkripčního regulačního prvku viru hepatitidy B“ . Výzkum nukleových kyselin . 36 (5): 1681-9. DOI : 10.1093/nar/gkn006 . PMC2275152 . _ PMID 18263618 .
- ↑ Hassan MM, Li D, El-Deeb AS, Wolff RA, Bondy ML, Davila M, Abbruzzese JL (říjen 2008). „Asociace mezi virem hepatitidy B a rakovinou slinivky“ . Journal of Clinical Oncology . 26 (28): 4557-62. DOI : 10.1200/JCO.2008.17.3526 . PMC2562875 . _ PMID 18824707 .
- ↑ 1 2 Zpráva ICTV Hepadnaviridae . (neurčitý)
- ↑ Dupinay T, et al. (Listopad 2013). "Objev přirozeně se vyskytující přenosné chronické infekce virem hepatitidy B mezi Macaca fascicularis z ostrova Mauritius." Hepatologie . 58 (5): 1610-1620. DOI : 10.1002/hep.26428 . PMID 23536484 .
- ↑ 1 2 Hundie GB, Stalin Raj V, Gebre Michael D, Pas SD, Koopmans MP, Osterhaus AD a kol. (únor 2017). „Nový virus hepatitidy B subgenotyp D10 cirkulující v Etiopii“. Journal of Viral Hepatitis . 24 (2): 163-173. DOI : 10.1111/jvh.12631 . PMID27808472 . _ S2CID 23073883 .
- ↑ 1 2 Kramvis A, Kew M, François G (březen 2005). Genotypy viru hepatitidy B. Vakcína . 23 (19): 2409-23. DOI : 10.1016/j.vaccine.2004.10.045 . PMID 15752827 .
- ↑ Magnius LO, Norder H (1995). „Podtypy, genotypy a molekulární epidemiologie viru hepatitidy B, jak se odráží v sekvenční variabilitě S-genu“. Intervirologie . 38 (1-2): 24-34. DOI : 10.1159/000150411 . PMID 8666521 .
- ↑ Drexler JF, Geipel A, König A, Corman VM, van Riel D, Leijten LM a kol. (Říjen 2013). "Netopýři přenášejí patogenní hepadnaviry antigenně příbuzné viru hepatitidy B a schopné infikovat lidské hepatocyty . " Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 110 (40): 16151-6. Bibcode : 2013PNAS..11016151D . DOI : 10.1073/pnas.1308049110 . PMC 3791787 . PMID24043818 . _
- ↑ Zuckerman AJ. Kapitola 70: Viry hepatitidy // Baronova lékařská mikrobiologie / Baron S. - 4. - Univ of Texas Medical Branch, 1996. - ISBN 978-0-9631172-1-2 .
- ↑ KDO | Hepatitida b . www.who.int . Získáno 12. července 2015. Archivováno z originálu 10. července 2015. (neurčitý)
- ↑ Locarnini S (2004). „Molekulární virologie viru hepatitidy B“ . Semináře z onemocnění jater . 24 Suppl 1 (Suppl 1): 3-10. CiteSeerX 10.1.1.618.7033 . DOI : 10.1055/s-2004-828672 . PMID 15192795 .
- ↑ Howard ČR (červenec 1986). „Biologie hepadnavirů“ . The Journal of General Virology . 67 (7): 1215-35. DOI : 10.1099/0022-1317-67-7-1215 . PMID 3014045 .
- ↑ Jaroszewicz J, Calle Serrano B, Wursthorn K, Deterding K, Schlue J, Raupach R, et al. (duben 2010). „Hladiny povrchového antigenu hepatitidy B (HBsAg) v přirozené historii infekce virem hepatitidy B (HBV): evropská perspektiva“. Journal of Hepatology . 52 (4): 514-22. DOI : 10.1016/j.jhep.2010.01.014 . PMID20207438 . _
- ↑ Seeger C, Mason W.S. (březen 2000). Biologie viru hepatitidy B. Recenze mikrobiologie a molekulární biologie . 64 (1): 51-68. DOI : 10.1128/mmbr.64.1.51-68.2000 . PMC 98986 . PMID 10704474 .
- ↑ Lin YJ, Huang LR, Yang HC, Tzeng HT, Hsu PN, Wu HL a kol. (květen 2010). „Jádrový antigen viru hepatitidy B určuje perzistenci viru na myším modelu C57BL/6“ . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 107 (20): 9340-5. Bibcode : 2010PNAS..107.9340L . DOI : 10.1073/pnas.1004762107 . PMC2889105 . _ PMID20439715 . _
- ↑ Bourne ČR, Katen SP, Fulz MR, Packianathan C, Zlotnick A (březen 2009). „Mutantní jádrový protein viru hepatitidy B napodobuje inhibitory samouspořádání ikosaedrické kapsidy“ . biochemie . 48 (8): 1736-42. DOI : 10.1021/bi801814y . PMC2880625 . _ PMID 19196007 .
- ↑ Menéndez-Arias L, Álvarez M, Pacheco B (říjen 2014). „Nukleosidové/nukleotidové analogové inhibitory polymerázy viru hepatitidy B: mechanismus účinku a rezistence“. Aktuální názor ve virologii . 8 :1-9. DOI : 10.1016/j.coviro.2014.04.005 . PMID24814823 . _
- ↑ Yang HC, Kao JH (září 2014). „Přetrvávání kovalentně uzavřené kruhové DNA viru hepatitidy B v hepatocytech: molekulární mechanismy a klinický význam“ . Vznikající mikroby a infekce . 3 (9): e64. DOI : 10.1038/emi.2014.64 . PMC 4185362 . PMID26038757 . _
- ↑ TSRI - Novinky a publikace . Staženo: 3. ledna 2009. (neurčitý)
- ↑ Tang H, Oishi N, Kaneko S, Murakami S (říjen 2006). „Molekulární funkce a biologické role viru hepatitidy B x protein“. věda o rakovině . 97 (10): 977-83. DOI : 10.1111/j.1349-7006.2006.00299.x . PMID 16984372 .
- ↑ McClain SL, Clippinger AJ, Lizzano R, Bouchard MJ (listopad 2007). „Replikace viru hepatitidy B je spojena se zvýšením hladiny cytosolického vápníku regulovaným mitochondriemi závislými na HBx“ . Virologický časopis . 81 (21): 12061-5. DOI : 10.1128/JVI.00740-07 . PMC2168786 . _ PMID 17699583 .
- ↑ Bouchard MJ, Puro RJ, Wang L, Schneider RJ (červenec 2003). „Aktivace a inhibice signálních drah buněčného vápníku a tyrosinkinázy identifikuje cíle proteinu HBx zapojeného do replikace viru hepatitidy B“ . Virologický časopis . 77 (14): 7713-9. DOI : 10.1128/JVI.77.14.7713-7719.2003 . PMC 161925 . PMID 12829810 .
- ↑ Chai N, Chang HE, Nicolas E, Han Z, Jarnik M, Taylor J (srpen 2008). „Vlastnosti subvirových částic viru hepatitidy B“ . Virologický časopis . 82 (16): 7812-7. DOI : 10.1128/JVI.00561-08 . PMC2519590 . _ PMID 18524834 .
- ↑ Suh, Alexander; Brosius, Jurgen; Schmitz, Jürgen; Kriegs, Jan Ole (2013-04-30). "Genom druhohorního paleoviru odhaluje vývoj virů hepatitidy B. " Nature Communications _ ]. 4 (1): 1791. Bibcode : 2013NatCo...4.1791S . DOI : 10.1038/ncomms2798 . ISSN 2041-1723 . PMID 23653203 .
- ↑ Rasche A, Souza BF, Drexler JF (únor 2016). „Netopýří hepadnaviry a původ virů hepatitidy B primátů“. Aktuální názor ve virologii . 16 :86-94. DOI : 10.1016/j.coviro.2016.01.015 . PMID26897577 . _
- ↑ Lin B, Anderson D.A. (2000). "Zbytkový X otevřený čtecí rámec u kachního viru hepatitidy B." Intervirologie . 43 (3): 185-90. DOI : 10.1159/000025037 . PMID 11044813 . S2CID 22542029 .
- ↑ 1 2 3 4 5 Kocher, Arthur; Papac, Luca; Barquera, Rodrigo; Key, Felix M.; Spyrou, Maria A.; Hubler, Ron; Rohrlach, Adam B.; Aron, Franziska; Stahl, Raphaela; Wissgott, Antje; Bömmel, Florian van (2021-10-08). „Deset tisíc let vývoje viru hepatitidy B“ . věda []. 374 (6564): 182-188. Bibcode : 2021Sci...374..182K . doi : 10.1126/science.abi5658 . PMID 34618559 . S2CID 238475573 .
- ↑ 1 2 Mühlemann B, Jones TC, Damgaard PB, Allentoft ME, Shevnina I, Logvin A, et al. (květen 2018). „Starověké viry hepatitidy B od doby bronzové do středověku“ . příroda . 557 (7705): 418-423. Bibcode : 2018Natur.557..418M . DOI : 10.1038/s41586-018-0097-z . PMID 29743673 . S2CID 13684815 .
- ↑ 1 2 Krause-Kyora, Ben; Susat, Julian; Klíč, Felix M; Kühnert, Denise; Bosse, Esther; Immel, Alexander; Rinne, Christoph; Kornell, Sabin-Christin; Ano, Diego; Franzenburg, Soren; Heyne, Henrike O (2018-05-10). Locarnini, Stephen, ed. „Neolitické a středověké genomy virů odhalují komplexní vývoj hepatitidy B“ . eLife . 7 : e36666. DOI : 10.7554/eLife.36666 . ISSN 2050-084X . PMC 6008052 . PMID 29745896 .
- ↑ Paraskevis D, Magiorkinis G, Magiorkinis E, Ho SY, Belshaw R, Allain JP, Hatzakis A (březen 2013). „Datování původu a šíření infekce virem hepatitidy B u lidí a primátů“. Hepatologie . 57 (3): 908-16. DOI : 10.1002/hep.26079 . PMID 22987324 .
- ↑ Bouckaert R, Simons BC, Krarup H, Friesen TM, Osiowy C (2017). „Sledování evoluční historie viru hepatitidy B (HBV) genotypu B5 (dříve B6) v cirkumpolární Arktidě prostřednictvím fylogeografického modelování“ . PeerJ . 5 : e3757. doi : 10.7717/ peerj.3757 . PMC 5581946 . PMID28875087 . _
- ↑ Kay A, Zoulim F (srpen 2007). „Genetická variabilita a evoluce viru hepatitidy B“ . výzkum virů . 127 (2): 164-76. DOI : 10.1016/j.virusres.2007.02.021 . PMID 17383765 .
- ↑ Doitsh G, Shaul Y (únor 2004). „Převaha zesilovače I v genové expresi viru hepatitidy B“ . Molekulární a buněčná biologie . 24 (4): 1799-808. DOI : 10.1128/mcb.24.4.1799-1808.2004 . PMC 344184 . PMID 14749394 .
- ↑ Antonucci TK, Rutter WJ (únor 1989). "Promotory viru hepatitidy B (HBV) jsou regulovány zesilovačem HBV tkáňově specifickým způsobem . " Virologický časopis . 63 (2): 579-83. DOI : 10.1128/JVI.63.2.579-583.1989 . PMC 247726 . PMID 2536093 .
- ↑ Huan B, Siddiqui A (1993). „Regulace genové exprese viru hepatitidy B“. Journal of Hepatology . 17 Suppl 3: S20–3. DOI : 10.1016/s0168-8278(05)80419-2 . PMID 8509635 .
- ↑ 1 2 Beck J, Nassal M (leden 2007). "Replikace viru hepatitidy B" . World Journal of Gastroenterology . 13 (1): 48-64. doi : 10.3748/ wjg.v13.i1.48 . PMC 4065876 . PMID 17206754 .
- ↑ Bouchard MJ, Schneider RJ (prosinec 2004). „Záhadný gen X viru hepatitidy B“ . Virologický časopis . 78 (23): 12725-34. DOI : 10.1128/JVI.78.23.12725-12734.2004 . PMC 524990 . PMID 15542625 .
- ↑ Doitsh, Gilad; Shaul, Yosef (květen 2003). „Dlouhý transkript HBV kódující pX je neefektivně exportován z jádra“ . virologie [ anglicky ] ]. 309 (2): 339-349. DOI : 10.1016/S0042-6822(03)00156-9 . PMID 12758180 .
- ↑ Smith GJ, Donello JE, Lück R, Steger G, Hope TJ (listopad 1998). Posttranskripční regulační prvek viru hepatitidy B obsahuje dvě konzervované smyčky RNA, které jsou nezbytné pro fungování . Výzkum nukleových kyselin . 26 (21): 4818-27. DOI : 10.1093/nar/26.21.4818 . PMC 147918 . PMID 9776740 .
- ↑ Flodell S, Schleucher J, Cromsigt J, Ippel H, Kidd-Ljunggren K, Wijmenga S (listopad 2002). „Apikální stopka-smyčka signálu enkapsidace viru hepatitidy B se složí do stabilní trojsmyčky se dvěma spodními pyrimidinovými vybouleninami“ . Výzkum nukleových kyselin . 30 (21): 4803-11. doi : 10.1093/nar/ gkf603 . PMC 135823 . PMID 12409471 .
- ↑ Olinger CM, Jutavijittum P, Hübschen JM, Yousukh A, Samountry B, Thammavong T, et al. (listopad 2008). „Možný nový genotyp viru hepatitidy B, jihovýchodní Asie“ . Vznikající infekční onemocnění . 14 (11): 1777-80. DOI : 10.3201/eid1411.080437 . PMC2630741 . _ PMID 18976569 .
- ↑ Kurbanov F, Tanaka Y, Kramvis A, Simmonds P, Mizokami M (srpen 2008). "Kdy bych měl uvažovat o novém genotypu viru hepatitidy B?" . Virologický časopis . 82 (16): 8241-2. DOI : 10.1128/JVI.00793-08 . PMC2519592 . _ PMID 18663008 .
- ↑ Ghosh S, Banerjee P, Deny P, Mondal RK, Nandi M, Roychoudhury A, et al. (březen 2013). „Nový subgenotyp HBV D9, nový D/C rekombinant, identifikovaný u pacientů s chronickou HBeAg-negativní infekcí ve východní Indii“. Journal of Viral Hepatitis . 20 (3): 209-18. DOI : 10.1111/j.1365-2893.2012.01655.x . PMID 23383660 . S2CID 205356299 .
- ↑ 1 2 Zhang Z, Zehnder B, Damrau C, Urban S (červenec 2016). „Vizualizace vstupu viru hepatitidy B – nové nástroje a přístupy k přímému sledování vstupu viru do hepatocytů“. FEBS dopisy . 590 (13): 1915-26. DOI : 10.1002/1873-3468.12202 . PMID27149321 . _
- ↑ Yan H, Liu Y, Sui J, Li W (září 2015). "NTCP otevírá dveře pro infekci virem hepatitidy B." Antivirový výzkum . 121 : 24-30. DOI : 10.1016/j.antiviral.2015.06.002 . PMID 26071008 .
- ↑ Watashi K, Wakita T (srpen 2015). „Vstup viru hepatitidy B a viru hepatitidy D, druhová specificita a tkáňový tropismus“ . Perspektivy Cold Spring Harbor v medicíně . 5 (8): a021378. doi : 10.1101/cshperspect.a021378 . PMC 4526719 . PMID 26238794 .
- ↑ Bruss V (leden 2007). "Morfogeneze viru hepatitidy B" . World Journal of Gastroenterology . 13 (1): 65-73. doi : 10.3748/ wjg.v13.i1.65 . PMC 4065877 . PMID 17206755 .
- ↑ Fam46A (kódování proteinů) . GeneCards . Genecards. Staženo: 18. února 2015. (neurčitý)
Klasifikace virů podle Baltimoru |
---|
DNA | I: viry |
---|
Adnaviria | |
---|
Duplodnaviria | |
---|
Monodnaviria | |
---|
Varidnaviria | Bamfordvirae | Nukleocytovirikota | Pokkesviricetes | |
---|
Megaviricetes | Algavirales |
|
---|
Imitervirales |
|
---|
Pimascovirales |
|
---|
|
---|
|
---|
Preplasmiviricota | |
---|
|
---|
Helvetiavirae | Dividoviricota | Laserviricetes | Halopanivirales |
- Matshushitaviridae
- Simuloviridae
- Sphaerolipoviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Nezařazeno | Naldaviricetes | |
---|
Nezařazeno |
- čeleď : Ampullaviridae
- Bicaudaviridae
- Clavaviridae
- Fuselloviridae
- Globuloviridae
- Guttaviridae
- Halspiviridae
- Ovaliviridae
- Plasmaviridae
- Polydnaviridae
- Portogloboviridae
- Thaspiviridae
- Rod : Dinodnavirus
- Rhizidiovirus
|
---|
|
---|
|
| II: DNA viry |
---|
Monodnaviria | Loebvirae | Hofneiviricota | Faserviricetes | Tubulavirales |
- Inoviridae
- Paulinoviridae
- Plectroviridae }
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Sangervirae | |
---|
Shotokuvirae | Cossaviricota | |
---|
Cressdnaviricota | Arfiviricetes | Baphyvirales |
|
---|
Cirlivirales |
|
---|
Cremevirales |
|
---|
Mulpavirales |
- Metaxyviridae
- Nanoviridae
|
---|
Recrevirales |
|
---|
|
---|
Repensiviricetes | Geplafuvirales |
- Geminiviridae
- Genomoviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Trapavirae | |
---|
|
---|
Nezařazeno |
|
---|
|
|
|
---|
RNA | | IV: (+) RNA viry |
---|
Riboviria | Orthornavirae | Kitrinoviricota | Alsuviricetes | Hepelivirales |
- Alphatetraviridae
- Benyviridae
- Hepeviridae
- Matonaviridae
|
---|
Martellivirales |
|
---|
tymovirály |
- Alphaflexiviridae
- Betaflexiviridae
- Deltaflexiviridae
- Gammaflexiviridae
- Tymoviridae
|
---|
|
---|
Flasuviricetes | |
---|
Magsaviricetes | Nodamuvirales |
- Nodaviridae
- Sinhaliviridae
|
---|
|
---|
tolucaviricetes | Tolivirales |
- Carmotetraviridae
- Luteoviridae
- Tombusviridae
|
---|
|
---|
|
---|
Lenarviricota | Leviviricetes | Norzivirales |
- Atkinsviridae
- Duinviridae
- Fiersviridae
- Solspiviridae
|
---|
Timlovirales |
- Blumeviridae
- Steitzviridae
|
---|
|
---|
Amabiliviricetes | |
---|
Howeltoviricetes | |
---|
miaviricetes | |
---|
|
---|
Pisuviricota | Pisoniviricetes | Nidovirales |
- Abyssoviridae
- Arteriviridae
- Cremegaviridae
- Coronaviridae
- Euroniviridae
- Gresnaviridae
- Medioniviridae
- Mesoniviridae
- Mononiviridae
- Nanghoshaviridae
- Nanhypoviridae
- Olifoviridae
- Roniviridae
- Tobaniviridae
|
---|
Picornavirales |
- Picornaviridae
- Marnaviridae
- Solinviviridae
- Caliciviridae
- Flaviridae
- Secoviridae
- Dicistroviridae
- Polycipiviridae
|
---|
Sobelivirales |
- Alvernaviridae
- Barnaviridae
- Solemoviridae
|
---|
|
---|
Stelpaviricetes | |
---|
|
---|
Nezařazeno |
- Čeleď : Permutotetraviridae
- Sarthroviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
| |
|
---|
Z | |
---|