Treponema
| Treponema | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| | ||||||||||
| vědecká klasifikace | ||||||||||
| Doména:bakterieTyp:Spirochaetae Cavalier-Smith 2002Třída:Spirochaetes Cavalier-Smith 2002Objednat:SpirochetyRodina:SpirochaetaceaeRod:Treponema | ||||||||||
| Mezinárodní vědecký název | ||||||||||
| Treponema (Schaudinn 1905) Abt, Göker a Klenk 2013 [1] | ||||||||||
| Synonyma | ||||||||||
| ||||||||||
Treponema [2] ( lat. Treponema ) je rod svinutých bakterií z čeledi Spirochaetaceae z řádu spirochet ( Spirochaetales ) [3] .
Patogenita
Původci lidských treponematóz [4] [5] :
| Poddruh nebo druh bakterií | Choroba | Geografické rozložení | Věk pacientů | Cesta infekce | vrozené formy |
|---|---|---|---|---|---|
| Treponema pallidum subsp. pallidum | Syfilis | Všude | Dospělí, teenageři | Sexuální | Ano |
| Treponema pallidum subsp. karateum | Pinta | Teplé klimatické polopouště: Severní Amerika | Děti, teenageři | kožní kontakt | Ne |
| Treponema pallidum subsp. endemikum | Bejel | Pouště: Severní Afrika, Střední východ | Děti, teenageři, dospělí | Kontakt se sliznicemi | Zřídka |
| Treponema pertenue | Yaws | Tropy: Afrika, Indonésie, Karibik | Děti | kožní kontakt | Ne |
Treponema paraluiscuniculi způsobuje syfilis u králíků [6] .
Fylogeneze
Na základě analýzy 16s-ribozomální RNA podjednotky byl v projektu LTP (vydání 123) vybudován fylogenetický strom všech druhů [7] .
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Taxonomie
V současnosti přijímaná klasifikace je založena na nomenklatuře prokaryotických názvů (LPSN) [8] a Národním centru pro biotechnologické informace (NBCI) [9] :
- Candidatus Treponema suis Molbak et al. 2006
- ? Treponema calligyrum ♠ Noguchi
- ? Treponema carateum ♥ (pinta způsobující Treponema )
- ? Treponema minutum ♦ Dobell 1912
- ? Treponema pallidum ♦ (Schaudinn a Hoffmann 1905) Schaudinn 1905
- ? Treponema paraluisleporis ♠ Lumeij et al. 1994
- ? Treponema paraluiscuniculi ♦ (Jacobsthal 1920) Smibert 1974
- ? Treponema pertenue ♦ (Castellani 1905) Castellani & Chalmers 1910
- ? Treponema phagedenis ♠
- T.p. phagedenis ♠ (Noguchi 1912) Brumpt
- T.p. vaccae ♠ Evans et al. 2006
- ? Treponema refringens ♠ (Schaudinn a Hofmann 1905) Castellani a Chalmers
- ? Treponema vincentii ♠ Smibert 1984
- ? Treponema zioleckii ♠ Piknová et al. 2008
- Treponema amylovorum Wyss a kol. 1997
- Treponema azotonutricium Graber et al. 2004
- Treponema berlinense Nordhoff a kol. 2005
- Treponema brennaborense Schrank et al. 1999
- Treponema bryantii Stanton a Canale-Parola 1980
- Treponema caldarium (Pohlschroeder et al. 1995) Abt, Göker & Klenk 2013
- Treponema denticola (ex Flügge 1886) Chan et al. 1993
- Treponema isoptericolens Dröge et al. 2008
- Treponema lecitinolyticum Wyss et al. 1999
- Treponema maltophilum Wyss et al. 1996
- Treponema medium ♦ Umemoto et al. 1997
- T.m. bovis ♠ Evans a kol. 2006
- T.m. střední ♠ Umemoto et al. 1997
- Treponema parvum Wyss a kol. 2001
- Treponema pectinovorum Smibert a Burmeister 1983
- Treponema pedis Evans a kol. 2009
- Treponema porcinum Nordhoff et al. 2005
- Treponema primitia Graber a kol. 2004
- Treponema putidum Wyss et al. 2004
- Treponema saccharophilum Paster a Canale-Parola 1986
- Treponema socranskii Smibert a kol. 1984
- T. s. paredis Smibert a kol. 1984
- T. s. buccale Smibert a kol. 1984
- T. s. socranskii Smibert a kol. 1984
- Treponema stenostreptum (Zuelzer 1912) Abt, Göker & Klenk 2013
- Treponema succinifaciens Cwyk a Canale-Parola 1981
- Treponema zuelzerae (ex Veldkamp 1960) Canale-Parola 1980 emend. Abt, Göker & Klenk 2013
Poznámky:
♦ Typové napětí ztraceno nebo nedostupné ♠ Kmen je v NCBI, ale ne v LSPN ♥ Kmen nebyl předložen NCBI, ale uveden v seznamu LPSNPoznámky
- ↑ 1 2 3 Rod Treponema : [ angl. ] // LPSN. (Přístup: 17. září 2017) .
- ↑ Atlas lékařské mikrobiologie, virologie a imunologie: Učebnice pro studenty medicíny / Ed. A. A. Vorobieva , A. S. Bykova . - M . : Lékařská informační agentura, 2003. - S. 78. - 236 s. — ISBN 5-89481-136-8 .
- ↑ Klasifikace domén a kmenů - Hierarchická klasifikace prokaryot (bakterií) : Verze 2.0 : [ eng. ] // LPSN. - 2016. - 2. října.
- ↑ Lékařská a sanitární mikrobiologie / A. A. Vorobyov, Yu. S. Krivoshein, V. P. Shirobokov. - M . : Akademie, 2003. - S. 52. - ISBN 5-7695-1292-X .
- ↑ The endemic treponematosis (neopr.) // Microbes Infect .. - 2002. - Leden ( vol. 4 , no. 1 ). - S. 83-94 . - doi : 10.1016/S1286-4579(01)01513-1 . — PMID 11825779 . Archivováno z originálu 19. září 2019.
- ↑ Sekvence genu kyselého repetitivního proteinu (arp) odlišuje venerický poddruh Treponema pallidum od nevenerického a gen se vyvinul pod silnou pozitivní selekcí u poddruhu, který způsobuje syfilis // FEMS Immunol. Med. microbiol. : deník. - 2008. - Srpen ( roč. 53 , č. 3 ). - str. 322-332 . - doi : 10.1111/j.1574-695X.2008.00427.x . — PMID 18554302 . Archivováno z originálu 5. ledna 2013.
- ↑ Projekt „Všedruhový živý strom“ . 16S verze LTP na bázi rRNA 123 (úplný strom) . Komplexní databáze ribozomální RNA Silva . Získáno 20. března 2013. Archivováno z originálu 7. června 2019.
- ↑ JP Euzéby Treponema . Seznam prokaryotických jmen se stálou nomenklaturou (LPSN). Získáno 20. března 2016. Archivováno z originálu 4. srpna 2020.
- ↑ Sayers Treponema . Databáze taxonomie Národního centra pro biotechnologické informace (NCBI). Získáno 20. března 2016. Archivováno z originálu 24. října 2017.
 Slovníky a encyklopedie | |
|---|---|
| Taxonomie |