Vlajka Zanzibarské lidové republiky a Pemby je vlajka skládající se ze tří vodorovných čar: modré (nebo světle modré) horní, černé uprostřed a zelené spodní. Barvy vlajky se dají vysvětlit následovně: modrá (modrá) jsou vody Indického oceánu omývající souostroví (kromě Zanzibaru a Pemby jsou v souostroví desítky malých ostrůvků), černá je populace ostrovů, černá je obyvatelstvo ostrovů. protože většinu obyvatel ostrovů tvoří Afričané, zelená je bohatá vegetace ostrovů a islámská víra vyznávaná většinou obyvatel.
Padaly návrhy přidat na vlajku dvě bílé pěticípé hvězdy, které symbolizovaly ostrovy tvořící stát, ale schváleno to nebylo.
Po sjednocení Lidové republiky Zanzibar a Pemba s Republikou Tanganika v říjnu 1964 do Sjednocené republiky Tanzanie byla vlajka změněna: do horního modrého (modrého) pruhu, blíže k vlajce, byla přidána národní vlajka Tanzanie. stožár, který zdůrazňoval vlastnictví ostrovů Tanzanie a podřízenost jí. Tato vlajka existuje dodnes.