5S rRNA (5S ribozomální ribonukleová kyselina) je strukturální a funkční složka velké podjednotky ribozomu , která působí jako lešení pro ribozomální proteiny a je klíčovou katalytickou složkou peptidyltransferázy. Byl nalezen téměř ve všech ribozomech ( bakterie , archaea a eukaryota ), s výjimkou mitochondrií hub , vyšších živočichů a většiny protistů . Označení 5S je způsobeno sedimentačním faktorem 5 Svedbergových jednotek v ultracentrifugaci , odkazuje na rychlost sedimentace molekuly v ultracentrifuze, která se měří v jednotkách Svedberg (S). Je přibližně 120 nukleotidů dlouhý a má molekulovou hmotnost 40 kDa . [1] .
Sekundární struktura 5S rRNA se skládá z pěti helixů (I-V), dvou vlásenkových smyček (C a D), dvou vnitřních smyček (B a E) a pantové oblasti (smyčka A) tvořící spojení tří šroubovic [1] .
Původně se předpokládalo, že 5S rRNA hraje pouze strukturální roli jako skelet pro ribozomální proteiny, ale nedávno se také ukázalo, že je klíčovou katalytickou složkou peptidyltransferázového centra ribozomu. U Escherichia coli delece genu 5S rRNA snižují rychlost syntézy proteinů. Existuje také řada interakcí mezi 5S rRNA a L5 ribozomálními proteiny. V eukaryotických buňkách se ribozomální protein L5 váže a stabilizuje 5S rRNA za vzniku pre-ribozomální ribonukleoproteinové částice (RNP), která sídlí jak v cytosolu, tak v jádře. Nedostatek L5 brání transportu 5S rRNA do jádra a vede ke sníženému skládání ribozomů. Existuje pouze jedna přímá interakce mezi 5S RNA y doménou a 38 23S ribozomální RNA šroubovicí [2] .