Diftamid

Aktuální verze stránky ještě nebyla zkontrolována zkušenými přispěvateli a může se výrazně lišit od verze recenzované 1. února 2021; kontroly vyžadují 2 úpravy .
diftamid
Všeobecné
Systematický
název
​(2S)​2-​amino-​3-[2-[​(3S)​-​4-​amino-​4-​oxo-​3-​​(trimethylazaniumyl)​butyl] -​1H-​imidazol-​5-​yl]propanoát
Tradiční jména 2-(3-Karboxamido-3(trimethylamonio)propyl)histidin
Chem. vzorec C13H23N5O3 _ _ _ _ _ _ _
Fyzikální vlastnosti
Stát bezbarvé krystaly
Molární hmotnost 297,353 g/ mol
Klasifikace
Reg. Číslo CAS 75645-22-6
PubChem
ÚSMĚVY   C[N+](C)(C)C(CCC1=NC=C(N1)CC(C(=O)[O-])N)C(=O)N
InChI   InChI=1S/C13H23N5O3/cl-18(2.3)10(12(15)19)4-5-11-16-7-8(17-11)6-9(14)13(20)21/ h7, 9-10H,4-6,14H2,1-3H3,(H3-,15,16,17,19,20,21)/p+1/t9-,10-/m0/s1FOOBQHKMWYGHCE-UWVGGRQHSA-O
CHEBI 15949
ChemSpider
Bezpečnost
Stručný charakter. nebezpečí (H) H201 , H202 , H235+H410
preventivní opatření. (P) P201
piktogramy GHS Piktogram "Plynová láhev" systému ČGSPiktogram "Explodující bomba" systému ČGS
NFPA 704 NFPA 704 čtyřbarevný diamant 0 0 0
Údaje jsou založeny na standardních podmínkách (25 °C, 100 kPa), pokud není uvedeno jinak.

Diftamid je nekódující aminokyselina odvozená od histidinu , nacházející se výhradně v eukaryotickém elongačním faktoru eEF -2 a některých archaea . Je syntetizován během posttranslační modifikace a je cílem pro mono -ADP-ribosylaci v procesu regulace syntézy ribozomálních proteinů .

Diftamid byl objeven při studiu mechanismu účinku difterického toxinu, díky kterému dostal své jméno. Je známo, že nejméně pět ADP-ribosylujících toxinů (toxiny černého kašle, cholery a difterie, LT-toxin E. coli a exotoxin A Pseudomonas) má společné vazebné místo NAD, tři z nich (záškrt, cholera, exotoxin A) jsou diftamidy -závislý [ 1] , [2] .

Biosyntéza

Přestože je diftamid znám již více než dvě desetiletí, podrobnosti o počátečních krocích jeho biosyntézy zůstávají nejasné.

Prvním krokem v biosyntéze diftamidu je přenos 3-karboxy-3-aminopropylového zbytku na histidinový zbytek proteinového řetězce eEF-2 [3] . Donorem zbytku je S-adenosylmethionin (SAM) a dochází k nukleofilnímu ataku imidazolového fragmentu histidinu na uhlík SAM aktivovaný sulfoniovým centrem. Na rozdíl od většiny těchto reakcí zahrnujících SAM, které probíhají jako nukleofilní útoky na uhlík methylové skupiny a vedou k jeho přenosu na nukleofilní substrát, během biosyntézy diftamidu se nepřenáší methylová skupina, ale 3-karboxy-3. -aminopropylový zbytek na atom uhlíku v poloze 2 imidazolového kruhu histidinu za vzniku 2-(3-karboxy-3-aminopropyl)-L-histidinu.

V dalším stupni aminoskupina 3-aminopropylového fragmentu 2-(3-karboxy-3-aminopropyl)-L-histidinového zbytku podléhá úplné methylaci za vzniku difninového zbytku (2-[3-karboxy- 3-(trimethylamonio)propyl]-L-histidin ), tato reakce je katalyzována enzymem diftinsyntázou (EC 2.1.1.98), S-adenosylmethionin působí jako donor methylové skupiny [4] .

V poslední fázi se karboxylová skupina diftinu při interakci s amoniakem katalyzovaným diftin-amoniakovou ligázou (EC 6.3.1.14) mění na amidovou skupinu za vzniku diftamidu [5].

Poznámky

  1. Informace o EC 2.4.2.36 - NAD+-diftamid ADP-ribosyltransferáza // BRENDA . Získáno 4. července 2013. Archivováno z originálu 10. července 2013.
  2. Supotnitsky , M.V. Bakteriální toxiny. Jejich povaha, mechanismy účinku, možnosti konstrukce hybridních a modifikovaných toxinů (nedostupný odkaz) . Biologie . Získáno 4. července 2013. Archivováno z originálu 18. července 2013. 
  3. u savců - v poloze 715, u kvasinek - 699, u Pyrococcus horikoshii  - 600
  4. EC 2.1.1.98 // Nomenklatura enzymů IUBMB . Získáno 14. 5. 2013. Archivováno z originálu 23. 5. 2013.
  5. EC 6.3.1.14 // Nomenklatura enzymů IUBMB . Získáno 14. května 2013. Archivováno z originálu dne 20. října 2012.