Koeficient příbuzenské plemenitby

Aktuální verze stránky ještě nebyla zkontrolována zkušenými přispěvateli a může se výrazně lišit od verze recenzované 30. června 2018; kontroly vyžadují 9 úprav .

Koeficient vztahu je mírou stupně pokrevnosti (nebo biologického vztahu) mezi dvěma lidmi.

Koeficient příbuzenské plemenitby lze vypočítat pro jedince a je měřítkem míry redukce předků v rodokmenu konkrétního jedince.

Samotný pojem koeficient příbuznosti definoval Sewell Wright v roce 1922 a byl odvozen z definice pojmu koeficient příbuzenské plemenitby formulované v roce 1921. Tato míra se nejčastěji používá v genetice a genealogii .

Obecně platí, že čím vyšší je stupeň příbuzenské plemenitby, tím se poměrový koeficient blíží jedné, vyjádřený v procentech [1] , a v případě osob se vzdálenými společnými předky má tendenci k nule.

Koeficient příbuzenské plemenitby

Koeficient příbuzenské plemenitby („f“) je mírou pravděpodobnosti genetických (patogenetických) účinků, které mohou vzniknout v důsledku příbuzenské plemenitby organismů, navíc by se měl vypočítat na základě předem známých rodokmenů (tj. údajů o úplnosti v dokumentující genealogii obou zkřížených organismů (např. s a priori daným a nezměněným systémem křížení.) [2] Tato míra vyjadřuje očekávané procento homozygotnosti vyplývající z konkrétního systému křížení.

Pro jakýkoli gen se stejně společnými dominantními a recesivními znaky A a a bude výsledkem náhodného křížení 50 % homozygotních znaků (25 % typu AA a 25 % typu aa ) a v úzce inbrední populaci bude tato hodnota 100 % (100 % typ AA nebo 100 % typ aa ). Koeficient příbuzenské plemenitby f je číslo od 0 (v případě 50% homozygotnosti) do 1 (v případě 100% homozygotnosti), kde f = 2h -1, kde h  je pravděpodobnost homozygotnosti pouze pro daný gen .

Je třeba poznamenat, že f je matematické očekávání v přítomnosti pravděpodobnostního Mendelova zákona o dědičnosti dotyčného genu. Koeficient není určen pouze z jednoho organismu. Koeficient příbuzenské plemenitby je statistická hodnota určená z parametrů krevních linií obou organismů a tento koeficient nelze vypočítat z genotypů pouze těchto dvou organismů.

Poměrový koeficient ("r") mezi dvěma jedinci B a C je určen součtem koeficientů vypočtených pro každou linii, ke které jsou příbuzní, podle jejich společných předků. Každá taková čára spojuje dva lidi přes nějakého společného předka, procházející oddělenými lidmi, kteří nejsou příbuzní více než jednou. Poměrový koeficient mezi předkem A a potomkem O, oddělený n generacemi, je definován jako:

p AO = 2 −n ⋅((1+ f A )/(1+ f O )) ½

kde f B a f O jsou koeficienty příbuzenské plemenitby pro A a O, v daném pořadí.

Poměrový koeficient r BC se aktuálně vypočítává sečtením všech koeficientů dráhy:

r BC = Σ p AB ⋅ p AC .

Za předpokladu, že lze rodokmen vysledovat v dosti vzdálených (od daného uvažovaného genu) úsecích linie ( f A = 0), lze definici r zjednodušit na

r BC = Σ p 2 − L ( p ) ,

kde p uvádí všechny možné cesty spojující B a C s liniemi s jedinečnými společnými předky (tj. všechny cesty narazí na společného předka dvou dotyčných rodokmenů a nemusí procházet společným předkem předka nebo společným předkem nějakého společný předek, pouze zahrnout do dané cesty jednoho společného předka, a L(p) je délka cesty p .

Příklad řešení nejjednoduššího problému: Za předpokladu, že dva lidé sdílejí (mají) jednoho z 32 předků n = 5 generací, ale nemají žádné společné předky před čtyřmi nebo méně generacemi, pak se jejich poměrový koeficient r vypočítá jako následuje:

r = 2 n ⋅2 −2 n = 2 − n , což je, protože n = 5, r = 2 5 • 2 −10 = 2 −5 = 1/32 přibližně 0,0313 nebo 3 %.

Pro jedince, u kterých se stejná situace vyvinula ve vztahu k jejich 1024 předkům například před deseti generacemi, bude mít r hodnotu r = 2 −10 = 0,1 %. Požadovanou hodnotu r lze vypočítat s přesností několika procent (pokud jsou známy rodokmenové linie obou jedinců, například v hloubce až pěti generací, čtyř generací a dalších generací zpět), a přesnost na desetiny procenta (pokud je hloubka uvažovaných rodokmenů alespoň pro deset generací). Pokud se uvažuje požadovaná hodnota r od společných předků před 20 generacemi (což může odpovídat intervalu přibližně 500 let v rámci lidského genealogického stromu), pak se do výpočtu již zapojí jednotlivé geny lidí, kteří žili ve středověku ) , a hodnota koeficientu r klesne pod jednu část na milion).

Mezilidské vztahy

Poměrový faktor se někdy používá k vyjádření číselného ekvivalentu stupně pokrevnosti v lidské genealogii .

V mezilidských vztazích se hodnota poměrového koeficientu vypočítává na základě informací z rodokmenu pokrývajícího relativně malý počet generací – asi tři až čtyři. Jak již bylo uvedeno výše, hodnota poměrového koeficientu se počítá jako dolní mez, která může být o několik procent nižší než skutečná hodnota. Koeficienty lze určit s přesností na 1% za předpokladu, že rodokmen obou osob je znám sedmé generaci. [3]

Stupeň

vztahy

Vztahy Součinitel

vztahy (r)

Grafické schéma
0 identická dvojčata; klony 100 % [4] (1)
jeden rodič-dítě [5] 50 % (2 −1 )
2 sourozenci/sestry 50 % (2 −2 +2 −2 )
2 3/4 bratrů/sester; 37,5 % (2 −2 +2⋅2 −4 )
2 dědeček/babička a vnuk/vnučka 25 % (2 −2 )
2 nevlastní bratři/sestry 25 % (2 −2 )
3 teta/strýc a synovec/neteř 25 % ( 2⋅2–3 )
čtyři dvakrát sestřenice/sestry 25 % (2 -3 +2 -3 )
GaryGlenda
AdameAgáta
BettyBeneHelenHugh
DavideIrene
3 pradědeček/prababička a pravnuk/pravnučka 12,5 % (2 −3 )
čtyři sestřenice/sestry 12,5 % (2⋅2 −4 )
AdameAnna
ÚčtovatBettyCharlesiCaroline
DavideEmma
6 čtyřikrát druhý bratranec 12,5 % (8⋅2 −6 )
6 třikrát druhý bratranec 9,38 % (6⋅2 −6 )
čtyři nevlastní sestřenice/sestry 6,25 % (2 −4 )
5 velcí synovci/neteře nebo prastrýcové/tety 6,25 % (2⋅2 −5 )
AdameAnna
ÚčtovatBettyCharlesiCaroline
DianaDavideEmma
Upřímný
6 dvakrát druhý bratranec 6,25 % (4⋅2 −6 )
6 druhé sestřenice/sestry 3,13 % (2⋅2 −6 )
AdameAnna
ÚčtovatBettyCharlesiCaroline
DianaDavideEmmaEric
UpřímnýGloria
osm sestřenice/sestřenice ze čtvrtého kolena 0,78 % (2⋅2 −8 )
AdameAnna
ÚčtovatBettyCharlesiCaroline
DianaDavideEmmaEric
UpřímnýŠtěstíJiříGloria
HarryIsabelle
deset páté sestřenice/sestry 0,20 % (2⋅2 −10 ) [6]

Zákony incestu nejčastěji ovlivňují vztahy, kde r = 25 % nebo vyšší, ačkoli mnozí ignorují spíše vzácný případ dvojitých bratranců. V některých zemích jsou zakázány sexuální vztahy nebo manželství mezi sestřenicemi různého stupně nebo osobami spojenými pouze adopcí nebo dědictvím . Existence jakékoli možnosti početí je obecně ignorována.

Viz také

Reference

  1. přísně vzato, r=1 pro klony a jednovaječná dvojčata, ale protože definice r je obvykle určena k odhadu vhodnosti dvou jedinců pro chov, jsou obvykle považováni za opačné pohlaví.
  2. "Koeficient příbuzenské plemenitby, který má největší hodnotu, by měl co nejpříměji měřit účinky, které lze očekávat v průměru ze systému páření v daném rodokmenu."
  3. Úplný rodokmen sedmi generací (128 cest k předkům 7. stupně) je nerozumný i pro příslušníky vysoké šlechty.
  4. Nahrazením v definici pojmu "generace" meiózou ".
  5. Výběr příbuzných . Benjamin/Cummings. Získáno 25. listopadu 2007. Archivováno z originálu 17. května 2015.
  6. Tento stupeň vztahu je obvykle k nerozeznání od vztahu k náhodnému jedinci v rámci stejné populace (kmen, země, etnická skupina).

Bibliografie