Místně specifická rekombinace

Místně specifická rekombinace  je typ genetické rekombinace , při které během výměny řetězců DNA dochází k reakci mezi specifickými místy [1] [2] [3] . K záměně segmentů DNA dochází rozpoznáním a propojením krátkých sekvencí DNA (míst), ve kterých speciální enzymy štěpí, přeskupují a znovu spojují řetězce DNA. Pro některé rekombinační systémy stačí pouze enzym rekombináza, zatímco jiné vyžadují přítomnost dalších faktorů. V přírodě dochází k místně specifické rekombinaci, když se virus integruje do genomu (tvorba proviru ).

Místně specifické rekombinační systémy jsou vysoce specifické, rychlé a účinné i při práci s komplexními eukaryotickými genomy [4] a z tohoto důvodu jsou široce využívány v genetickém inženýrství [5] Účastní se mnoha buněčných procesů, včetně replikace bakteriálního genomu, patogeneze, pohyb mobilních genetických elementů a tvorba protilátek v lymfoidních buňkách savců .

Rekombinační místa mají obvykle délku 30 až 200 nukleotidů a sestávají ze dvou invertovaných repetic, na které se váže rekombináza, mezi nimiž je umístěna sekvence, ve které dochází k rekombinaci. Obě místa, na kterých dochází k rekombinaci, jsou obvykle totožná, existují však výjimky (například integrační místa fága λattP a attB , viz fág lambda ) [6] .

Viz také

Poznámky

  1. ↑ Bode, J; Schlake, T; asadasasada Iber, M; Schüebeler, D; Seibler, J; Snežkov, E; Nikolaev, L. The transgeneticist's toolbox: nové metody pro cílenou modifikaci eukaryotických genomů   // Biol . Chem. : deník. - 2000. - Sv. 381 , č.p. 9-10 . - S. 801-813 . - doi : 10.1515/BC.2000.103 . — PMID 11076013 .
  2. ↑ Kolb, A. F. Genome Engineering Using Site-Specific Recombinases  //  Cloning & Stem Cells: journal. - 2002. - Sv. 4 , ne. 1 . - str. 65-80 . - doi : 10.1089/153623002753632066 . — PMID 12006158 .
  3. ↑ Coates, CJ; Kaminski, JM; Summers, JB; Segal, DJ; Miller, AD; Kolb, AF Místně řízená modifikace genomu: deriváty enzymů modifikujících DNA jako nástroje cílení  //  Trends in Biotechnology : deník. - Cell Press , 2005. - Vol. 23 , č. 8 . - str. 407-419 . - doi : 10.1016/j.tibtech.2005.06.009 . — PMID 15993503 . Archivováno z originálu 29. srpna 2006.
  4. ↑ Sauer, B. Inducible Gene Targeting in Mice using the Cre/loxSystem  //  Methods: journal. - 1998. - Sv. 14 , č. 4 . - str. 381-392 . - doi : 10.1006/meth.1998.0593 . — PMID 9608509 . Archivováno z originálu 11. června 2011.
  5. ↑ Akopian, A.; Stark, WM Site-Specific DNA Recombinases as Instruments for Genomic Surgery  (anglicky)  // Advances in Genetics: journal. - 2005. - Sv. Pokroky v genetice . - str. 1-23 . — ISBN 978-0-12-017655-7 . - doi : 10.1016/S0065-2660(05)55001-6 .
  6. ↑ Landy A. Dynamické, strukturální a regulační aspekty lambda místně specifické rekombinace   // Annual Review of Biochemistry : deník. - 1989. - Sv. 58 , č. 1 . - S. 913-941 . doi : 10.1146 / annurev.bi.58.070189.004405 . — PMID 2528323 .
  Přejděte na položku Wikidata  Slovníky a encyklopedie