Seznam vysokých škol v Baškortostánu zahrnuje vzdělávací instituce vyššího a vyššího odborného vzdělávání, které se nacházejí na území Baškortostánu a mají platnou licenci pro vzdělávací aktivity. Seznam vysokých škol je uveden v souladu s údaji konsolidovaného rejstříku licencí [1] , v seznamu poboček jsou organizace, které se v roce 2017 podílely na monitoringu Ministerstva školství a vědy Ruské federace [2] . K 6. červenci 2017 mělo platnou licenci 11 univerzit a 24 poboček v Baškortostánu.
Pobočky vysokých škol, jejichž ředitelské organizace jsou umístěny v jiných subjektech federace, jsou seskupeny v samostatném seznamu. Pořadí prvků seznamu je abecední.