Faktory translačního prodloužení

Translační elongační faktory (EF, elongation factor) jsou proteiny , které podporují syntézu peptidů v ribozomu ve fázi prodlužování translace . Elongační faktory zajišťují kontinuální polymeraci proteinu , počínaje okamžikem, kdy iniciátor tRNA vstoupí do P-místa ribozomu. Eukaryotické , eubakteriální a archaální elongační faktory mají nejvyšší stupeň podobnosti ve srovnání s faktory iniciace translace a faktory terminace translace [1] [2] . Mezi elongační faktory u prokaryot patří EF-Tu , EF-Ts , EF-G , EF-P [3] . Mitochondrie a plastidy eukaryot mají svůj vlastní soubor elongačních faktorů podobných těm u bakterií [4] [5] .

Nomenklatura homologních elongačních faktorů

Archeální Bakteriální eukaryotické Funkce
Cytoplazmatický Mitochondriální
aEF1A EF Tu eEF1A mtEFTu Zprostředkovává vstup nabité aminoacyl-tRNA do volného A-místa ribozomu [6]
aEF1B EF-Ts eEF1B mtEFT Slouží jako výměnný faktor guanylnukleotidů pro EF-Tu, katalyzuje uvolňování GDP z EF-Tu [2]
aEF2 EF-G eEF2 mtEFG1 Katalyzuje translokaci peptidyl-tRNA a mRNA na konci každého cyklu prodlužování peptidu, přičemž dochází k významným konformačním změnám v ribozomu [7]
aIF5A* EF-P eIF5A* - Stimuluje tvorbu peptidové vazby a obnovuje translaci po nuceném zastavení ribozomu v oblastech mRNA kódujících dva nebo více prolinů v sekvenci [8] [9] .
* — Je třeba poznamenat, že eukaryotický faktor eIF5A a archaální faktor aIF5A, které jsou homology bakteriálního faktoru EF-P, byly pojmenovány jako iniciační faktory, ale tyto proteiny jsou nyní uznávány jako elongační faktory [8]

Poznámky

  1. ↑ Nukleové kyseliny: od A do Z / B. Appel [et al.]. - M. : Binom: Knowledge Laboratory, 2013. - 413 s. - 700 výtisků.  - ISBN 978-5-9963-0376-2 .
  2. ↑ 1 2 Sasikumar, Arjun N.; Perez, Winder B.; Kinzy, Terri Goss (červenec 2012). „Mnoho rolí eukaryotického komplexu elongačního faktoru 1“ . Mezioborové recenze Wiley. RNA . 3 (4): 543-555. DOI : 10.1002/wrna.1118 . ISSN  1757-7004 . PMC  3374885 . PMID22555874  . _
  3. ↑ Parker, J. (2001), Elongační faktory; Překlad , Encyklopedie genetiky , str. 610–611, ISBN 9780122270802 , DOI 10.1006/rwgn.2001.0402 . 
  4. ↑ Manuell, Andrea L; Quispe, Joel; Mayfield, Stephen P; Petsko, Gregory A (7. srpna 2007). „Struktura chloroplastového ribozomu: nové domény pro regulaci překladu“ . PLoS biologie . 5 (8): e209. doi : 10.1371/journal.pbio.0050209 . PMC  1939882 . PMID  17683199 .
  5. ↑ G. C. Atkinson; S. L. Baldauf (2011). „Evoluce elongačního faktoru G a původ mitochondriálních a chloroplastových forem“ . Molekulární biologie a evoluce . 28 (3): 1281-92. doi : 10.1093/molbev/ msq316 . PMID 21097998 . 
  6. ↑ Weijland A, Harmark K, Cool RH, Anborgh PH, Parmeggiani A (březen 1992). „Elongační faktor Tu: molekulární přepínač v biosyntéze proteinů“ . Molekulární mikrobiologie . 6 (6): 683-8. DOI : 10.1111/j.1365-2958.1992.tb01516.x . PMID  1573997 .
  7. ↑ Jørgensen, R; Ortiz, P.A.; Carr-Schmid, A; Nissen, P; Kinzy, T. G.; Andersen, G. R. (květen 2003). "Dvě krystalové struktury demonstrují velké konformační změny v eukaryotické ribozomální translokáze." Strukturální biologie přírody . 10 (5): 379-85. DOI : 10.1038/nsb923 . PMID  12692531 .
  8. ↑ 12 Rossi , D; Kuroshu, R; Zanelli, C. F.; Valentini, S. R. (2013). „eIF5A a EF-P: dva jedinečné faktory překladu nyní cestují stejnou cestou“. Mezioborové recenze Wiley. RNA . 5 (2): 209-22. DOI : 10.1002/wrna.1211 . PMID  24402910 .
  9. ↑ Doerfel LK a kol. EF-P je nezbytný pro rychlou syntézu proteinů obsahujících po sobě jdoucí zbytky prolinu   // Věda . - 2013. - Sv. 339 , č.p. 6115 . - str. 85-88 . - doi : 10.1126/science.1229017 .