Genotypy viru hepatitidy C

Virus hepatitidy C se dělí na 8 genotypů a ty zase na více než 100 podtypů. Genotypy viru hepatitidy C se od sebe liší ve variabilitě úrovně nukleotidů o více než 30 %; podtypy v rámci genotypu viru se mezi sebou liší asi o 15 %. [jeden]

Všechny genotypy viru jsou schopny vést k cirhóze a hepatocelulárnímu karcinomu , ale genotyp 3 je faktorem rychlejší progrese onemocnění. [2] 

Genotypy 1-4 jsou geograficky nejčastější. V Severní Americe a západní Evropě je nejběžnější podtyp 1a [3] , který představuje až 70 % všech případů. Ve střední a východní Evropě je nejčastější podtyp 1b. Na území bývalého SSSR se nejčastěji vyskytuje podtyp 1b a genotyp 3. Genotyp 4 je nejčastější na Středním východě a v Africe : v Egyptě tvoří až 90 % všech infekcí. [čtyři]

Nejobtížněji se léčí podtyp 1a a genotyp 3. Vzhledem k velké genetické diverzitě genotypu 2, který často vstupuje do rekombinant s jinými genotypy, existují jednotlivé kmeny genotypu 2, které jsou vůči terapii odolnější.

Nejrozvinutější pro léčbu je podtyp 1b.

Podle provedené evoluční analýzy existoval nejbližší společný předek viru genotypu 3a přibližně před 200 lety. [5]

Geografické rozšíření podtypů viru hepatitidy C
Genotypy Podmnožiny Zeměpisná distribuce [6]
Genotyp 1 1a, 1b... 1n - celkem 13 pojmenovaných a 7 nepojmenovaných podtypů Severní Amerika, Eurasie, střední Afrika
Genotyp 2 2a, 2b... 2u —

celkem 15 pojmenovaných a 8 nepojmenovaných podtypů

Západní Afrika, Itálie
Genotyp 3 3a, 3b... 3k - celkem 8 pojmenovaných podtypů a 1 nepojmenovaný Hindustan, jihovýchodní Asie, republiky bývalého SSSR
Genotyp 4 4a, 4b... 4w - celkem 18 pojmenovaných a 10 nepojmenovaných podtypů Střední Afrika, Egypt
Genotyp 5 5a Jižní Afrika a Asie
Genotyp 6 6a, 6b... 6xf - celkem 29 pojmenovaných podtypů a 21 nepojmenovaných Jihovýchodní Asie
Genotyp 7 Demokratická republika Kongo [7]
Genotyp 8 stát Paňdžáb (Indie)
Rekombinantní genotypy 1a/1c, 1b/1a, 2/5, 2b/1a, 2b/6w, 2k/1b, 4d/4a, 6n/6o a další [8]

Metody stanovení

Hlavní metody používané k diagnostice genotypu HCV jsou následující:

Odkazy

  1. ↑ Identifikace nového genotypu a podtypů HCV u pacientů léčených režimy založenými na sofosbuviru . www.natap.org (8. listopadu 2017). Získáno 10. listopadu 2017. Archivováno z originálu 10. listopadu 2017.
  2. ↑ Hepatitida C genotyp 3 může být faktorem rychlejší progrese jaterní fibrózy . www.hv-info.ru (28. října 2009). Získáno 10. listopadu 2017. Archivováno z originálu dne 20. října 2017.
  3. ↑ Archivovaná kopie . Získáno 11. dubna 2017. Archivováno z originálu 22. března 2017. [ bude upřesněno ]
  4. ↑ Nouroz, Faisal. Přehled genotypů viru hepatitidy C a jeho kontroly  (anglicky)  // Egyptian Journal of Medical Human Genetics: journal. - 2015. - Sv. 16 , č. 4 . - str. 291-298 . - doi : 10.1016/j.ejmhg.2015.05.003 .
  5. ↑ Akkarathamrongsin S, Hacharoen P, Tangkijvanich P, et al. Molekulární epidemiologie a genetická historie infekce virem hepatitidy C podtypu 3a v Thajsku. Intervirologie 2013; 56:284–94.
  6. ↑ Nový pohled na vývoj vakcíny proti hepatitidě C  //  Journal of Biomedicine & Biotechnology : deník. - 2010. - Sv. 2010 . — S. 548280 . - doi : 10.1155/2010/548280 . — PMID 20625493 .
  7. ↑ Donald G. Murphy, Erwin Sablon, Jasmine Chamberland, Eric Fournier, Raymond Dandavino. Genotyp 7 viru hepatitidy C, nový genotyp pocházející ze střední Afriky  (anglicky)  // Journal of Clinical Microbiology. — 2015-03-01. — Sv. 53 , iss. 3 . - str. 967-972 . — ISSN 1098-660X 0095-1137, 1098-660X . - doi : 10.1128/JCM.02831-14 . Archivováno z originálu 27. května 2018.
  8. ↑ Andrea Galli, Jens Bukh. Srovnávací analýza molekulárních mechanismů rekombinace u viru hepatitidy C  (anglicky)  // Trends in Microbiology. - Cell Press , 2014-06-01. — Sv. 22 , iss. 6 . - str. 354-364 . — ISSN 1878-4380 0966-842X, 1878-4380 . - doi : 10.1016/j.tim.2014.02.005 .