Mikrospora (řecky micros - malý, spora - semeno) - haploidní zárodečná buňka rostliny, která vzniká jako výsledek meiózy buněk v pylových hnízdech prašníků ( sporangia ). Z mikrospory se vyvine samčí gametofyt , pylové zrno [1] .
Každá mikrospora se mitózou dělí dvakrát . V důsledku prvního dělení vznikají dvě buňky: vegetativní a generativní. Generativní buňka se rozdělí na dvě spermie, když narazí na stigma pestíku ( angiospermy ). Zralý samčí gametofyt (pylové zrno) se tedy skládá ze tří buněk: vegetativní buňky a dvou spermií.
Mikrospora v nahosemenných vypadá trochu jinak: pylové zrno (pyl) se již skládá z vegetativní buňky a dvou spermií. Všechny tři buňky dopadají na samičí šišku, na rozdíl od krytosemenných rostlin, kde na pestík dopadají pouze 2 buňky (vegetativní a generativní).