Protomer v biologii je strukturní jednotka oligomerních proteinů. Je to nejmenší jednotka, sestávající z alespoň dvou různých proteinových řetězců, které tvoří větší hetero-oligomer spojením dvou nebo více kopií této jednotky. Termín zavedl Chetverin [1] , aby vytvořil jednoznačnou nomenklaturu v enzymu Na/K-At fáze . Tento enzym se skládá ze dvou podjednotek, velké katalytické podjednotky α a menší podjednotky glykoproteinu β (plus proteolipid , nazývaný γ podjednotka). Pak nebylo jasné, jak se vzájemně ovlivňují a v jakých sekvencích se nacházejí. Také, když lidé mluvili o dimeru, měli na mysli αβ nebo (αβ) 2 ? Chetverin navrhl nazývat αβ protomer a (αβ) 2 diprotomer.
Protomery jsou obvykle uspořádány v cyklické symetrii , aby vytvořily symetrii uzavřené skupiny
Hemoglobin je heterotetramer skládající se ze čtyř podjednotek (dvě α a dvě β). Hemoglobin je však strukturně a funkčně lépe popsán jako (αβ) 2 , lze jej tedy nazvat dimerem dvou αβ protomerů, tedy diprotomerem.
Aspartát-karbamoyltransferáza se skládá z a6p6 podjednotky . Šest αβ protomerů je uspořádáno v D3 symetrii.