Senzorický rodopsin II (phoborodopsin) je fotoaktivní sedmišroubovicový transmembránový protein archaea , slouží jim k negativní fototaxi a patří do stejné rodiny proteinů jako bakteriorhodopsin .
Složení senzorického rhodopsinu II archaea Natronomonas pharaonis zahrnuje 239 aminokyselinových zbytků organizovaných do sedmi transmembránových šroubovic a sítnice kovalentně navázané na lysin 205 prostřednictvím Schiffovy báze . [1] [2] Sekvence senzorického rodopsinu II je podobná sekvenci bakteriorhodopsinu z 27 % (až 80 % v oblasti kapsy obsahující sítnici). Prostřednictvím bodových mutací může být senzorický rodopsin přinucen působit jako bakteriorhodopsin a naopak.
V membráně tvoří CPII komplex s transduktorovým proteinem (přenašeč signálu) a komplexy dimerizují. Když je foton absorbován (absorpční maximum SRII padá na 500 nm), je signál z proteinu přenášen do převodníku a poté přes kinázy do bičíku . Bakterie se tak může vyhnout škodlivému blízkému UV záření.
V současné době jsou známy struktury pro základní stav jednotlivé SRII v komplexu s převodníkem a mezistavy pro komplex, přičemž mechanismus fungování proteinu také není zcela objasněn. [1] [2]