Mongolská státní univerzita byla založena v roce 1942. Zpočátku měla Mongolská státní univerzita pouze 3 fakulty. V roce 1958 se Fakulta zoologie a veterinárního lékařství stala samostatnou vzdělávací institucí s názvem Agrární univerzita Mongolska. V roce 1961 se z lékařské fakulty stala lékařská univerzita Mongolska. V roce 1969 se Fakulta inženýrství a technologie stala Polytechnickým institutem Mongolska. V roce 1979 byla založena Fakulta humanitních a sociálních věd.
Mongolská státní univerzita hraje klíčovou roli ve vzdělávání odborného personálu země. Má 12 fakult. Počet studentů je 10,5 tisíce.
V roce 1969 byl v hlavním městě Mongolska založen Polytechnický institut. Předtím byla tato vzdělávací instituce součástí Mongolské státní univerzity. Od svého vzniku ústav okamžitě otevřel několik fakult, např. Fakultu architektury, Energetickou fakultu, Geologickou fakultu a Technickou fakultu. V roce 1990 byl ústav rozhodnutím mongolské vlády přejmenován. Univerzita má 15 fakult a 21 tisíc studentů.
Lékařská univerzita byla otevřena v roce 1961. Předtím se budoucí lékaři vzdělávali na lékařské fakultě Mongolské státní univerzity. Lékařská univerzita má tyto fakulty:
Celkový počet studentů je 4700.
Vzdělávací instituce Mongolska byla otevřena v roce 1924 jako dočasná škola obchodu. Ústav vychovává budoucí odborníky v oblasti ekonomiky a obchodu. Počet studentů je 2500.
Tato vzdělávací instituce byla založena v roce 1951 jako Pedagogický institut Mongolska. Původně byly otevřeny 4 fakulty. V roce 2004 byl Pedagogický institut přejmenován na „mongolskou pedagogickou univerzitu“. Vychovává budoucí středoškolské učitele. Počet studentů je 6900.
Mongolian International University je soukromá instituce vysokoškolského vzdělávání se sídlem v Ulánbátaru. Univerzita byla založena v roce 2002 a má 100% zahraniční účast s podporou mongolské vlády. Všechna školení jsou vedena pouze v angličtině. Mongolian International University školí bakaláře v pěti specializacích – „Mezinárodní obchod a management“ (IM), „ Informační technologie “ (IT), „Biotechnologie“ (BT), „Anglický jazyk“ (EE), „Móda a design“ (FD ) . Kromě toho je pro studenty otevřen jeden magisterský kurz - Výuka angličtiny pro mluvčí jiných jazyků (TESOL).