Hypsibius dujardini

Hypsibius dujardini  je druh bezobratlých z třídy pravých tardigradů. Konkrétní název je uveden na počest francouzského zoologa Felixe Dujardina (1801-1860).

Délka těla je 220-300 mikronů. Tento druh tardigrade je kosmopolitní . Žije na povrchu půdy, preferuje vlhká, stinná místa porostlá mechem. Živí se hlavně bakteriemi.

Stejně jako ostatní druhy tardigradů patří k extrémofilům  - zvířatům, která dokážou snést extrémní podmínky existence. Zejména snáší velmi vysoké teploty – více než 100 °C, i velmi nízké teploty – dokonce blízké absolutní nule. Odolné vůči rentgenovému záření až do úrovně blízké 570 000 rentgenovým paprskům. Může tolerovat téměř úplnou dehydrataci. V extrémních podmínkách tvoří endosporové stadium, při kterém se metabolismus snižuje. Rozmnožuje se partenogenezí . V experimentu bylo získáno několik partenogenetických generací Hypsibius dujardini , které se vyvíjely a žily normálně.

Genom Hypsibius dujardini byl dešifrován sekvenováním [1] . Ukázalo se, že tato zvířata mají kompaktní genom a dobu rozmnožování asi 13-14 dní při pokojové teplotě. Hypsibius dujardini může být kultivován nepřetržitě po mnoho desetiletí a může být kryokonzervován . Bylo zjištěno, že genom tohoto zvířete je vhodným modelem pro studium evoluce mechanismů embryogeneze [2] .

Nějakou dobu se věřilo, že 6 500 z 38 000 genů ve svém genomu tyto organismy obdržely od jiných organismů v procesu horizontálního přenosu genů. To tvoří více než 17 % genomu – nejvyšší procento vypůjčených genů mezi zvířaty. Zároveň se předpokládalo, že množina dárců je velmi různorodá: její genom obsahuje geny 1300 druhů bakterií, 40 druhů archeí, 91 druhů hub, 45 druhů rostlin a 6 virů [3] . Tak vysoké procento bylo vysvětleno schopností Hypsibius dujardini snášet nepříznivé podmínky - údajně když je jejich tělo vysušeno, DNA se rozpadne na velké fragmenty. Když extrémní podmínky skončí a jejich tělo se naplní vodou, proteiny opraví poškozenou DNA. Věřilo se, že v tomto okamžiku mohou do buňky vstoupit fragmenty cizí DNA, které jsou integrovány do genomu tardigrade.

Bylo také naznačeno, že důvodem závěrů o masivní výpůjčce cizích genů byla kontaminace ( kontaminace ) vzorků DNA Hypsibius dujardini cizí bakteriální DNA během výzkumu [4] [5] .

Nedávné studie ukazují, že pouze 1,2 % tardigrade genů je vypůjčeno horizontálním přenosem z jiných království živých bytostí [5] [6] [7] .

Poznámky

1. ↑ Projekty genomu pro Hypsibius dujardini .  (neurčitý) (Angličtina)
2. ↑ Gabriel, W. a kol. Tardigrade Hypsibius dujardini , nový model pro studium evoluce vývoje  //  Developmental Biology: journal. - 2007. - Sv. 312 . - str. 545-559 . - doi : 10.1016/j.ydbio.2007.09.055 . — PMID 17996863 .  (Angličtina)
3. ↑ Boothbya Th.C., Tenlena JR, Smith FW a kol. Důkaz pro rozsáhlý horizontální přenos genů z návrhu genomu tardigrade   // Proc . Národní akademie věd USA: časopis. - 2015. - doi : 10.1073/pnas.1510461112 .  (Angličtina)
4. ↑ Tardigrades zproštěn obvinění z masivního „plagiátorství“ Archivováno 1. srpna 2017 na Wayback Machine .
5. ↑ 1 2 Georgios Koutsovoulos, Sujai Kumar, Dominik R. Laetsch, Lewis Stevens, Jennifer Daub. Žádný důkaz pro rozsáhlý horizontální přenos genů v genomu tardigrade Hypsibius dujardini  // Proceedings of the National Academy of Sciences  . - Národní akademie věd , 2016-05-03. — Sv. 113 , iss. 18 . - S. 5053-5058 . - ISSN 1091-6490 0027-8424, 1091-6490 . - doi : 10.1073/pnas.1600338113 . Archivováno z originálu 20. července 2017.
6. ↑ Oleg Lischuk. Byly nalezeny genetické důvody pro nezranitelnost tardigradů . nplus1.ru. Získáno 27. července 2017. Archivováno z originálu 1. srpna 2017. (neurčitý)
7. ↑ Takuma Hashimoto, Daiki D. Horikawa, Yuki Saito, Hirokazu Kuwahara, Hiroko Kozuka-Hata. Extremotolerantní genom tardigrade a zlepšená radiotolerance lidských kultivovaných buněk díky proteinu jedinečnému pro tardigrade  //  Nature Communications. — 20.09.2016. — Sv. 7 . — P. ncomms12808 . - doi : 10.1038/ncomms12808 . Archivováno z originálu 10. července 2017.

Odkazy

• Tardigrada  Newsletter
• Tardigrades - obrázky a videa
•  Projekt Edinburgh Tardigrade
• Tardigrades  (anglicky)