In silico je termín označující počítačové modelování (simulace) experimentu, častěji biologického. Tato fráze byla vytvořena analogií s frázemi in vivo (v živém organismu) a in vitro (ve zkumavce), které se často používají v biologii a nejsou sama o sobě latinská. Termín je blízký latinskému výrazu in silicio - "v křemíku", protože křemík jako polovodičový materiál hraje důležitou roli při výrobě počítačového vybavení. Stejně jako podobné fráze je psán kurzívou .
Výraz in silico byl poprvé vytvořen v roce 1989 na workshopu „Cellular Automata: Theory and Applications“ v Los Alamos v Novém Mexiku . Pedro Miramontes, matematik z Národní autonomní univerzity v Mexiku , představil článek „ DNA a RNA Physicochemical Constraints, Cellular Automata and Molecular Evolution“. Miramontes ve své zprávě použil výraz „ in silico “ k označení biologických experimentů prováděných výhradně na počítači. Později tato práce tvořila základ jeho disertační práce [1] .
In silico bylo použito v dokumentech napsaných na podporu vytvoření programů pro studium bakteriálních genomů Komisí Evropské unie . První vědecký článek, ve kterém byl tento výraz použit, napsali francouzští badatelé [2] . První zmínku v knize uvádí Hans B. Sieburg (1990) v kapitole založené na přednášce na Letní škole komplexních systémů v Santa Fe Institute [3] .
Od roku 1998 je vydáván speciální časopis „ In silico Biology“.