Openbabel

openbabel
Typ Chemoinformatika
Zapsáno v C++
Operační systém Multiplatformní software
Nejnovější verze 2.3.2 ( 17. října 2011 )
Čitelné formáty souborů CML [1] [2] , International Chemical Identifier [3] [2] , MDL Molfile [d] [4] [2] , Protein Data Bank [5] , FASTA (formát) [6] , Alchemy Format [d] [7] , Soubor Gaussovy krychle [d] [8] , Formát CDX [d] [9] , CIF [10] , Formát souboru XYZ [d] [11] , Formát Free Form Fractional [d] [12 ] a formát MCDL [d]
Vygenerované formáty souborů SMILES [13] [2] , CML [1] [2] , International Chemical Identifier [3] [2] , InChIKey [d] [14] [2] , MDL Molfile [d] [4] [2] , Víceúrovňový Neighborhoods of Atoms format [d] [15] , Free Form Fractional format [d] [12] , MCDL formát [d] [16] a CAChe MolStruct [d] [17]
Licence GNU General Public License
webová stránka openbabel.sourceforge.net/…

OpenBabel je bezplatný chemický expertní systém primárně používaný pro konverzi formátů souborů. Tento program je dostupný pro UNIX a Windows a je distribuován za podmínek GNU GPL .

OpenBabel, stejně jako JOELib , je založen na knihovně OELib , která zase využívá nápady z programu Babel .

Klíčové vlastnosti

Viz také

Poznámky

  1. 1 2 Chemical Markup Language (cml, mrv)
  2. 1 2 3 4 5 6 7 8 Podporované formáty souborů a možnosti
  3. 1 2 Formát InChI (inchi)
  4. 1 2 MDL formát MOL (mol, mdl, sdf, sd)
  5. http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Protein_Data_Bank_format.html
  6. http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/FASTA_format.html
  7. http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Alchemy_format.html
  8. http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Gaussian_cube_format.html
  9. http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/ChemDraw_binary_format.html
  10. http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Crystallographic_Information_File.html
  11. http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/XYZ_cartesian_coordinates_format.html
  12. 1 2 http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Free_Form_Fracional_format.html
  13. Formát SMILES (úsměv, úsměv)
  14. InChIKey (inchikey)
  15. http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Multilevel_Neighborhoods_of_Atoms_(MNA).html
  16. http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/MCDL_format.html
  17. http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/CAChe_MolStruct_format.html

Odkazy