| doména F box | |
|---|---|
| Struktura proteinového komplexu Skp1-Skp2 (Skp2 obsahuje F-box) [1] . | |
| Identifikátory | |
| Symbol | doména F-box |
| Pfam | PF00646 |
| klan Pfam | CL0271 |
| Interpro | IPR001810 |
| CHYTRÝ | SM00256 |
| PROSITE | PS50181 |
| SCOP | 1fs2 |
| NADRODINĚ | 1fs2 |
| Dostupné proteinové struktury | |
| Pfam | struktur |
| PNR | RCSB PNR ; PDBe ; PDBj |
| PDB součet | 3D model |
| Mediální soubory na Wikimedia Commons | |
Proteiny F-boxu jsou proteiny , které mají alespoň jednu doménu F-boxu. První objevený protein F-boxu byl jednou ze tří složek komplexu SCF , který ubikvitinuje proteiny, které jsou pak degradovány v proteazomu . F-boxy se také podílejí na procesech, jako je přenos signálu a regulace buněčného cyklu [2] . V rostlinách se mnoho proteinů F-boxu účastní regulace genové exprese a umlčování genů prostřednictvím interference RNA s miRNA [3]. V lidských buňkách za podmínek vysokého obsahu železa dva atomy železa stabilizují protein F-Box FBXL5 . Výsledný komplex zprostředkovává ubikvitinaci proteinu IRP2 , což vede ke snížení hladiny železa v buňce.
Doména F-boxu je strukturní motiv přibližně 50 aminokyselin, který slouží k interakci s jinými proteiny. Poprvé byl objeven v cyklinu F , od kterého tento motiv dostal své jméno. Motiv F-boxu přímo interaguje s proteinem Skp1 komplexu SCF [4] a domény F-boxu jsou obvykle umístěny v proteinech v těsné blízkosti jiných motivů interakce protein-protein, jako jsou repetice bohaté na leucin a repetice WD . o kterých se předpokládá, že provádějí vazbu cílového proteinu, který je ubikvitinován komplexem SCF [5] .