Prozatímní vládnoucí junta Panamy ( španělsky: Junta Provisional de Gobierno de Panamá ) byla prozatímní vláda, která vládla Panamě po získání nezávislosti až do ustavení stálé vlády.
Večer 3. listopadu 1903 bylo v Panama City vyhlášeno odtržení Panamy od Kolumbie . Když se předseda městské rady panamského distriktu Demetrio Brid dozvěděl o tom, co se děje, svolal na 4. listopadu 1903 otevřené zasedání městské rady na náměstí, kde prozatímní vládnoucí junta Panamy , sestávající z Zvoleni byli José Agustín Arango , Federico Boyd a Thomas Arias . Delegace Manuela Amadora , Federica Boyda a Pabla Arosemena byla okamžitě vyslána do Spojených států , aby projednala otázky související s Panamským průplavem , ale po příjezdu zjistila , že Spojené státy právě uzavřely vhodnou smlouvu . Poté byl do Junty představen Manuel Espinosa Batista , který nahradil Boyda od 9. listopadu do 7. prosince.
Vládnoucí Junta jmenovala kabinet ministrů:
V únoru 1904 se v Panamě sešlo Ústavní národní shromáždění pod vedením Pabla Arosemena, který zvolil Manuela Amadora prvním oficiálním prezidentem země.