Ve virologii je koinfekce současná infekce jedné buňky různými typy virů. V parazitologii - porážka těla několika druhy parazitů. Příkladem virové koinfekce je současná infekce jaterních buněk hepatitidou B a hepatitidou D , která může následně vést k superinfekci . Globální prevalence koinfekce není známa, ale je běžná. Souběžná infekce helminty postihuje nejméně 800 milionů lidí na celém světě. Koinfekce je důležitá pro zdraví lidstva, protože interakce různých typů patogenů v těle je velmi různorodá. Koinfekce může mít na patogeny pozitivní i negativní účinky. V případě pozitivní interakce patogenů dochází k urychlení progrese onemocnění a vzniku syndemie (společné šíření dvou a více různých infekčních onemocnění). Negativní interakce patogenů zahrnuje bakteriální poškození těla, při kterém virulence nebo reprodukce jiných typů bakterií, jako je Pseudomonas aeruginosa , inhibuje růst patogenních kmenů Staphylococcus aureus .
Běžným příkladem koinfekce je koinfekce tuberkulózou a HIV . V některých zemích je až 80 % pacientů s TBC také nositeli HIV. Společný vývoj těchto dvou infekčních onemocnění je pozorován již desítky let. Dalším běžným příkladem by byl AIDS , který je výsledkem společné infekce několika kmeny HIV a dalšími infekcemi, včetně polymikrobiálních (například borelióza ).