Kopulační orgány (agregační orgány) jsou orgány reprodukčního systému zvířat s vnitřním oplodněním. U mužů slouží k zavedení spermií do ženského reprodukčního systému a u žen k přijetí samčího kopulačního orgánu a někdy k uložení spermatu. Kopulační orgány se nacházejí u savců , ptáků , plazů , členovců , červů a mnoha dalších zvířat. Někdy funkci kopulačních orgánů plní modifikované končetiny (u korýšů a pavouků ).
Obvykle jsou spermie vstříknuty kopulačními orgány do genitálního otvoru samice, ale některý hmyz, ciliární červi, parazitičtí kroužkovci myzostomidi a některé pijavice a vířníci vstřikují spermie pod kůži perforací stěny jejího těla.