Metabolická síť je soubor metabolických a fyzikálních procesů, které určují fyziologické a biochemické vlastnosti buňky . Jako takové tyto sítě zahrnují chemické reakce metabolismu , metabolické dráhy a také regulační interakce, které tyto reakce řídí.
Díky sekvenování celého genomu je nyní možné rekonstruovat síť biochemických reakcí v mnoha organismech, od bakterií po lidi. Některé z těchto sítí jsou dostupné online: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) [1] , EcoCyc [2] , BioCyc [3] a metaTIGER [4] . Metabolické sítě jsou mocnými nástroji pro studium a modelování metabolismu.
Metabolické sítě lze použít k identifikaci vzorců komorbidit u nemocných pacientů [5] . Některá onemocnění, jako je obezita a diabetes, mohou být přítomna u stejného člověka současně, někdy je jedno onemocnění významným rizikovým faktorem pro onemocnění jiné [6] . Samotné fenotypy onemocnění jsou obvykle výsledkem neschopnosti buňky rozložit nebo produkovat potřebný substrát. Defekt enzymu v jedné reakci však může ovlivnit toky dalších následných reakcí. Tyto kaskádové efekty jsou spojeny s metabolickými onemocněními spojenými s následnými reakcemi vedoucími ke komorbidním účinkům. Sítě metabolických chorob lze tedy použít k určení, zda spolu dvě poruchy souvisí v důsledku jejich korelovaných reakcí [5] .
| Metabolismus , katabolismus , anabolismus | |||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Všeobecné |
| ||||||||||||||||||||||||||
výměna energie |
| ||||||||||||||||||||||||||
| Betonové cesty |
| ||||||||||||||||||||||||||