Mikrobiální smyčka je trofická dráha pro transformaci rozpuštěné organické hmoty (DOM) za účasti bakteriální biomasy. DOM je nejprve přijímán bakteriemi , které jsou přijímány prvoky , které jsou zase přijímány zooplanktonem . V tomto okamžiku se mikrobiální smyčka připojí k hlavnímu potravnímu řetězci.
Tento termín zavedl F. Ezem se spoluautory ve svém zásadním článku, ve kterém bylo ukázáno, že bakterie využívající část produkce fytoplanktonu tvoří mikrobiální trofickou síť nebo mikrobiální smyčku založenou na lineárním trofickém řetězci ( fytoplankton - zooplankton - nekton ).
Podstata konceptu spočívá v tom, že většina organických látek tvořených primárními producenty ve vodních útvarech přechází v procesech intravitální extracelulární izolace a rozkladu buněk fytoplanktonu do rozpustné formy . Rozpustná organická hmota není dostupná pro metazoální plankton , a proto nevstupuje do lineárního potravního řetězce . Jejich hlavními konzumenty jsou heterotrofní bakterie , které se živí fagotrofními protisty, především heterotrofními nanoflageláty. Heterotrofní nanoflageláty jsou potravou nálevníků a dalších zástupců mikroplanktonu. Jednobuněčný plankton je požírán mnohobuněčným planktonem. Významná část primární produkce je tedy nejprve asimilována v mikrobiálním potravním řetězci a teprve poté je asimilována metazoárním planktonem .
Zooplankton se tak vyvíjí na úkor velkého fytoplanktonu , složky potravních řetězců pastvin, a na úkor heterotrofních prvoků , složky mikrobiálních potravních řetězců.
| Skupiny organismů | Spustitelná funkce |
|---|---|
| Heterotrofní bakterie | Mineralizace autochtonní a alochtonní organické hmoty |
| Heterotrofní nanoflageláty | Konzumace heterotrofních bakterií a pikoplanktonu |
| nálevníky | Konzumace fytoplanktonu, bičíkovců a bakterií. Schopný fotosyntézy |
| Heterotrofní dinoflageláty | Konzumace fytoplanktonu, prvoků a bakterií |
| Sarcode | Konzumace bakterií, řas, sinic a vířníků. Řídit biomasu sinic při jejich hromadném rozvoji v eutrofních nádržích |
| Mixotrofní prvoci | Schopný fotosyntézy a také konzumovat bakterie |
| Houby a kvasnice | Soutěžte s bakteriemi a archaeami o rozpuštěnou organickou hmotu |