Střevní mikrobiota – mikroorganismy , které žijí v gastrointestinálním traktu v symbióze s hostitelem.
Lidské střevo obsahuje v průměru asi 50 bilionů mikroorganismů, což je asi 1,3krát více než celkový počet buněk v těle [1] [2] . Bakterie tvoří převážnou většinu mikrobioty v konečníku [3] a až 60 % suché hmotnosti stolice [4] . Ve střevě žije někde mezi 300 [5] a 1000 [6] různých druhů, přičemž většina odhadů se pohybuje kolem 500 [7] [8] . Je však pravděpodobné, že 99 % bakterií patří k 30–40 druhům [9] . Kvasinky jsou také součástí střevní mikroflóry, ale o jejich aktivitě je známo jen málo.
Výzkumy ukazují, že vztah mezi střevem a mikrobiotou není jen komenzalismus (tj. neškodné soužití), ale spíše forma mutualismu , tedy oboustranně výhodného vztahu [6] . Ačkoli lidé mohou přežít bez střevní mikroflóry [7] , mikroorganismy plní řadu prospěšných funkcí pro hostitele, jako je anaerobní trávení nevyužitého materiálu pro energii, trénink imunitního systému a zabránění růstu škodlivých druhů [4 ] . Střevní mikroflóra však není vždy výjimečně prospěšná: má se za to, že některé mikroorganismy mohou v určitých případech způsobit onemocnění. Je také schopen biotransformovat léky a ovlivňovat expresi lidských genů, které regulují metabolismus , což způsobuje nežádoucí vedlejší účinky [10] .
Normálně se přemnožení bakterií v tenkém střevě brání:
Bifido- a laktobacily mají výraznou antagonistickou aktivitu proti patogenním bakteriím a regulují kvantitativní a kvalitativní složení střevní mikrobioty v normě, zpomalují růst a reprodukci patogenních a oportunních mikrobů v ní.
Střevní saprofyti oproti patogenním bakteriím obsahují velké množství enzymů , aktivněji se množí, takže snadněji využívají živiny a kyslík. Produkují různé baktericidní a bakteriostatické látky, včetně látek podobných antibiotikům.
| Bakterie, které lze nalézt v lidském střevě [11] | |
| Bakterie | Výskyt (%) |
|---|---|
| Bacteroides fragilis | 100 |
| Bacteroides melaninogenicus | 100 |
| Bacteroides oralis | 100 |
| Enterococcus faecalis | 100 |
| Escherichia coli | 100 |
| Enterobacter sp. | 40-80 |
| Klebsiella sp. | 40-80 |
| Bifidobacterium bifidum | 30-70 |
| Staphylococcus aureus | 30-50 |
| Lactobacillus | 20-60 |
| Clostridium perfringens | 25-35 |
| Proteus mirabilis | 5-55 |
| Clostridium tetani | 1-35 |
| Clostridium septicum | 5-25 |
| Pseudomonas aeruginosa | 3-11 |
| Salmonella enterica | 3-7 |
| Faecalibacterium prausnitzii | ?často |
| Peptostreptococcus sp. | ?často |
| Peptococcus sp. | ?často |
Druhy mikroorganismů ve střevě:
V žaludku je díky kyselému prostředí počet mikrobů nepatrný (laktobacily, streptokoky, sarciny ). Duodenum a proximální tenké střevo u zdravých lidí jsou sterilní kvůli přítomnosti agresivních trávicích enzymů v nich. V distální části tenkého střeva je v 1 ml obsahu 10 7 −10 8 mikrobů, ve stejném počtu aerobních a anaerobních. V 1 ml obsahu distálního tračníku je 10 9 −10 12 mikrobů asi 400 druhů. Největší hustota kontaminace je pozorována v konečníku. Fekální mikrofauna je vlastně mikrofauna distálního tlustého střeva.
Normálně je více než 95 % fekální mikroflóry anaeroby: laktobacily, bifidobakterie a bakteroidy. Aerobní mikroflóru reprezentují (četností izolace a množstvím) Escherichia coli, Enterococcus. Méně často se v malém množství vyskytují stafylokoky, streptokoky, Klebsiella, Proteus, klostridie a kvasinkám podobné houby.
Všechny mikroorganismy, které normálně obývají tlusté střevo, se dělí do tří skupin: