Tetramer

Tetramer  je oligomerní molekula sestávající ze čtyř monomerních podjednotek . Příkladem tetrameru z anorganické chemie je ethoxid titanu s empirickým vzorcem Ti ( OCH3 ) 4 . Tato látka je v pevném stavu tetramerní a tetramer ethoxidu titanu má vzorec Ti 4 (OCH 3 ) 16 [1] . Příkladem tetrameru z organické chemie  je kobofenol A . Tato sloučenina se skládá ze čtyř molekul resveratrolu [2] [3] .

V biochemii je tetramer biomolekula sestávající ze čtyř jednotek. Pokud jsou tyto jednotky stejné, pak hovoří o homotetrameru [4] (například konkavalin A je homotetramer [5] ), jinak se molekula nazývá heterotetramer [6] (například hemoglobin je heterotetramer [7 ] ). Podjednotky v heterotetrameru mohou být podobné, jako v případě hemoglobinu, nebo zcela odlišné, jako v případě imunoglobulinů . Různé podjednotky v heterotetrameru mohou mít různé aktivity, jako v případě podjednotek vázající biotin avidinu [8] , nebo stejné funkční vlastnosti jako v případě hemoglobinu, jehož všechny čtyři podjednotky váží kyslík . Vazbu monomerů v proteinových tetramerech zajišťují nekovalentní interakce : vodíkové vazby , elektrostatické a hydrofobní interakce [9] .

V roce 1996 Altman a Davis navrhli použití tetramerních proteinů k charakterizaci T-lymfocytů za účelem jejich izolace pro další analýzu. Tato metoda se nazývá analýza tetramerů . Tetramery byly úspěšně použity k získání nových poznatků o reakci T-lymfocytů na viry a zhoubné nádory [10] .

Poznámky

  1. Wright DA , Williams DA Krystalová a molekulární struktura tetramethoxidu titanu  //  Acta Crystallographica Sekce B Strukturní krystalografie a krystalová chemie. - 1968. - 15. srpna ( roč. 24 , č. 8 ). - S. 1107-1114 . — ISSN 0567-7408 . - doi : 10.1107/S0567740868003766 .
  2. Shu N. , Zhou H. , Hu C. Simultánní stanovení obsahu tří oligomerů stilbenu v Caragana sinica odebraných v různých ročních obdobích pomocí vylepšené metody HPLC.  (anglicky)  // Biological & Pharmaceutical Bulletin. - 2006. - Duben ( roč. 29 , č. 4 ). - S. 608-612 . doi : 10.1248 /bpb.29.608 . — PMID 16595888 .
  3. Li Liya , Henry Geneive E. , Seeram Navindra P. Identifikace a biologické aktivity resveratrolových oligomerů a flavonoidů ze semen Carex folliculata  //  Journal of Agricultural and Food Chemistry. - 2009. - 26. srpna ( roč. 57 , č. 16 ). - str. 7282-7287 . — ISSN 0021-8561 . - doi : 10.1021/jf901716j .
  4. GO termín: homotetramerizace proteinu (nedostupný odkaz) . Kvasinkový genom. Získáno 14. května 2011. Archivováno z originálu dne 27. září 2011. 
  5. Hardman KD , Ainsworth CF Struktura konkanavalinu A při rozlišení 2,4-A.  (anglicky)  // Biochemie. - 1972. - 19. prosince ( roč. 11 , č. 26 ). - S. 4910-4919 . - doi : 10.1021/bi00776a006 . — PMID 4638345 .
  6. GO termín: proteinová heterotetramerizace (odkaz není k dispozici) . Kvasinkový genom. Získáno 14. května 2011. Archivováno z originálu dne 27. září 2011. 
  7. Hemoglobin (downlink) . Staženo 20. února 2020. Archivováno z originálu 15. března 2017. 
  8. ZELENÁ NM. AVIDIN. 1. POUŽITÍ (14-C)BIOTINU PRO KINETICKÉ STUDIE A PRO TESTY.  (anglicky)  // The Biochemical Journal. - 1963. - prosinec ( sv. 89 ). - S. 585-591 . - doi : 10.1042/bj0890585 . — PMID 14101979 .
  9. Hellgren M. , Kaiser C. , de Haij S. , Norberg A. , Höög JO Síť vodíkových vazeb v savčí sorbitoldehydrogenáze stabilizuje tetramerní stav a je nezbytná pro katalytickou sílu.  (anglicky)  // Cellular And Molecular Life Sciences: CMLS. - 2007. - prosinec ( roč. 64 , č. 23 ). - str. 3129-3138 . - doi : 10.1007/s00018-007-7318-1 . — PMID 17952367 .
  10. ↑ Analýza Lee PP Tetramer  //  Měření imunity. Základní biologie a klinické hodnocení. - 2005. - S. 268-276 . - doi : 10.1016/B978-012455900-4/50284-1 .