Erwinia
Erwinia [2] ( lat. Erwinia ) je rod bakterií z čeledi Erwiniaceae z řádu Enterobacterales [3] , obsahující především fytopatogenní druhy, který je pojmenován po fytopatologovi Erwinu Frinku Smithovi (1854–1927). Gram-negativní tyčinky 1-3 µm dlouhé a 0,5-1 µm v průměru. Pohyblivé, peritrichózní bičování (kromě E. stewartii ). Heterotrofní , fakultativní anaeroby .
Patogeneze
Souvisí s rostlinami: epifyty , saprotrofy , fytopatogeny . Erwinia carotovora ( syn. Pectobacterium carotovorum ) způsobuje choroby brambor a dalších rostlin nazývané černá noha ( subsp. E. c. subsp. carotovora ) a měkkou hnilobu ( subsp. E. c. subsp. atroseptica ). E.c. subsp. carotovora se vyvíjí při teplotách pod 18 °C a způsobuje symptom černého inkoustu, zatímco E.c. subsp. atroseptica - nad 18 ° C a nezpůsobuje tento příznak. Rozvoj choroby podporuje zvýšená vlhkost půdy. Bakterie infikují nadzemní i podzemní části rostliny, včetně hlíz , způsobují tmavnutí a rozpad pletiv, kroucení a žloutnutí listů [4] [5] .
Systematika
Několik druhů Ervinia bylo někdy izolováno jako samostatný rod Pectobacterium , ale koncem devadesátých let se tento rod přestal používat, ačkoli byl schválen [1] . V roce 1998 Hauben et al. na základě studia 16S rRNA navrhli její obnovu a přiřadili k rodu Pectobacterium řadu poddruhů E. carotovora (jako P. carotovorum ), E. cacticida , E. chrysanthemi a E. cypripedii ( P. cacticidum , P. chrysanthemi a P. cypripedii, v tomto pořadí). Kromě toho byly do nového rodu Brenneria přesunuty E. alni , E. nigrifluens , E. paradisiaca , E. quercina , E. rubrifaciens a E. salicis [6] . Odůvodnění pro izolaci rodu Pectobacterium však většina vědecké komunity nepovažovala za přesvědčivá [7] . V současné době se pro druhy se spornou taxonomickou pozicí používají obě synonyma [8] a klasifikace rodu Erwinia se nadále reviduje. Navrhuje se tedy, aby poddruh P. carotovorum (syn. E. carotovora ) dostal hodnost druhů ( P. atrosepticum , P. betavasculorum a P. wasabiae ) [9] a P. chrysanthemi (syn. E. chrysanthemi ) a Brenneria paradisiaca (syn . E. paradisiaca ) převést do rodu Dickeya [10] .
Viz také
Poznámky
- ↑ 1 2 Burgeyův bakteriální klíč. Ve 2 svazcích. z angličtiny / Ed. J. Holt, N. Krieg, P. Sneath, J. Staley, S. Williams. — M.: Mir, 1997.
- ↑ Atlas lékařské mikrobiologie, virologie a imunologie: Učebnice pro studenty medicíny / Ed. A. A. Vorobieva , A. S. Bykova . - M . : Lékařská informační agentura, 2003. - S. 47. - 236 s. — ISBN 5-89481-136-8 .
- ↑ Klasifikace domén a kmenů - Hierarchická klasifikace prokaryot (bakterií) : Verze 2.2 : [ eng. ] // LPSN. - 2019. - 22. června.
- ↑ Černá noha a měkká hniloba brambor Archivní kopie z 5. března 2016 na Wayback Machine , materiály z webu VNIIKH pojmenované po A. G. Lorchovi.
- ↑ Černá noha archivována 19. dubna 2008 na Wayback Machine .
- ↑ Hauben L., Moore ERB, Vauterin L., Steenackers M., Mergaert J., Verdonck L., and Swings J. 1998. Fylogenetické postavení fytopatogenů v rámci Enterobacteriaceae Archived 26. ledna 2018 na Wayback Machine . Syst. Appl. microbiol. 21 : 384-397.
- ↑ Mee-Ngan Yap, Jeri D. Barak a Amy O. Charkowski Genomická diverzita Erwinia carotovora subsp. carotovora a její korelace s virulencí Archivováno 23. března 2008 na Wayback Machine // Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. - Květen 2004. - Sv. 70, č. 5. - S. 3013-3023.
- ↑ Waleron M., Waleron K., Podhajska AJ a Lojkowska E. 2002. Genotypizace bakterií patřících do bývalého rodu Erwinia pomocí PCR-RFLP analýzy fragmentu genu recA Archivováno 22. července 2009 na Wayback Machine . Microbiology 148 : 583-595.
- ↑ Louis Gardan, Cécile Gouy, Richard Christen a Regine Samson Povýšení tří poddruhů Pectobacterium carotovorum na druhovou úroveň: Pectobacterium atrosepticum sp. nov., Pectobacterium betavasculorum sp. listopad. a Pectobacterium wasabiae sp. listopad. Archivováno 29. srpna 2008 na Wayback Machine // Int J Syst Evol Microbiol. - 2003. - Sv. 53. - S. 381-391.
- ↑ Regine Samson, Jean Bernard Legendre, Richard Christen, Marion Fischer-Le Saux, Wafa Achouak a Louis Gardan . Přenos Pectobacterium chrysanthemi (Burkholder a kol. 1953) Brenner a kol. 1973 a Brenneria paradisiaca do rodu Dickeya gen. listopad. jako hřeben Dickeya chrysanthemi. listopad. a Dickeya paradisiaca comb. listopad. a vymezení čtyř nových druhů, Dickeya dadantii sp. nov., Dickeya dianthicola sp. nov., Dickeya dieffenbachiae sp. listopad. a Dickeya zeae sp. listopad. Archivováno 5. září 2008 na Wayback Machine // Int J Syst Evol Microbiol. - 2005. - Sv. 55. - S. 1415-1427.
Literatura
- Charkowski AO 2007. Měkká hniloba Erwinia . Bakterie Gnanamanickam spojené s rostlinami. Samuel S. (eds). Kluwer Academic Publishers .
- Ma B., Hibbing ME, Kim H.-S., Reedy RM, Yedidia I., Breuer J., Breuer J., Glasner JD, Perna NT a Kelman A. 2007. Hostitelský rozsah a molekulární fylogenie měkké roty Enterobakteriální rody Pectobacterium a Dickeya. Phytopathology 97 : 1150. doi : 10.1094/PHYTO-97-9-1150 .
- Waleron M., Waleron K., Podhajska AJ a Lojkowska E. 2002. Genotypizace bakterií patřících do bývalého rodu Erwinia pomocí PCR-RFLP genové analýzy fragmentu recA . Microbiology 148 : 583-595.