Haploskupina H1 (mtDNA)

Aktuální verze stránky ještě nebyla zkontrolována zkušenými přispěvateli a může se výrazně lišit od verze recenzované 3. srpna 2019; kontroly vyžadují 8 úprav .
Haploskupina H1
Typ mtDNA
Doba vzhledu před 8,4-14,8 tisíci lety [1]
Umístění spawn Ibérie nebo jižní Francie
Čas na BOP 12 500 let
Rodová skupina H
Podklady H1a , H1 - a , H1bc , H1f , H1g , H1k , H1q , H1c , H1e , H1h , H1i , H1j , H1m , H1n , H1o , H1p , H1r , H1s , H1 , H1 , H1x _ _
Markerové mutace 3010A [2]

Haploskupina H1  je haploskupina lidské mitochondriální DNA. Je to potomek haploskupiny H.

Původ

V období posledního glaciálního maxima (posledního zalednění) před 20-13 tisíci lety vymřela většina paleolitických sídlišť severní a střední Evropy, a proto zástupci haploskupiny H přežívali ve větší míře pouze na severu novověku. Španělsko. Mezi moderními národy Evropy je haploskupina mtDNA H1 nejčastější mezi Basky Španělska (27,8 %), Portugalci (25,8 %) a obyvateli Andalusie (24,3 %) [3] . Molekulárně genetická data naznačují, že francouzsko-kantábrijská oblast byla kolébkou většiny populace Evropy, alespoň v ženské linii (prostřednictvím haploskupiny H) [4] . Šíření haploskupiny H1 z francouzsko-kantábrijské oblasti po celé Evropě po posledním glaciálním maximu souvisí s expanzí Madeleine asi před 13 tisíci lety [5] [6] .

Distribuce

Haploskupina H1 tvoří významnou část západoevropské mitochondriální DNA, přičemž vrcholná distribuce v Evropě připadá na Basky ze Španělska (27,8 %), Portugalce (25,8 %), obyvatele Andalusie (24,3 %) a etnografickou skupinu Pasiego. v Kantábrii (23,5 %). [3] . V severní Africe je mezi Tuaregy z Libye neobvykle vysoký podíl haploskupiny H1 (61 %). [3] . Haploskupina mtDNA H1 je také běžná mezi ostatními obyvateli Pyrenejského poloostrova, severní Afriky a Sardinie . Je to více než 10 % v mnoha dalších regionech Evropy (Francie, Britské ostrovy, Alpy, mnoho regionů východní Evropy) a nejméně 5 % v ostatních částech Evropy. [6]

Podklady mtDNA haploskupiny H1

H1a

Haploskupina mtDNA H1a je charakterizována dalšími mutacemi 73G a 16162G. Podle Eva-Liis Loogväli et al. (2004) haploskupina H1a se nachází mezi Finy (5,1 %), Slováky (3,4 %), ugrofinskými národy z Povolží (2,4 %), Francouzi (1,9 %), Estonci (1,8 %), východními Slovany (1,7 %) ) a Turky (1 %) a nenachází se mezi národy Blízkého a Středního východu a v Asii. [7] Při zkoumání populací Středního východu a Kavkazu Roostalu et al. (2007) našli haploskupinu H1a pouze u Karačajců (5,5 %) a Turků (0,6 %). [8] Stáří haploskupiny H1a je 4,5–9,9 tisíce let. [jeden]

H1b

Haploskupina mtDNA Hlb je charakterizována dalšími mutacemi 3796G, 16189C a 16356C. Přitom podle Mannise van Ovena přítomnost 16356C již stačí k tomu, aby bylo určeno jako H1b (i když 3796G neexistuje).

MtDNA haploskupina H1b je nejběžnější ve východní Evropě (7 % celé haploskupiny H), na severu střední Evropy (5 % haploskupiny H) a na severozápadní Sibiři (5 % haploskupiny H mezi lidmi Mansi ). [7] Vrcholné rozšíření haploskupiny H1b ve východní Evropě se nachází na hranici moderního Lotyšska a Litvy, jižně od Rigy [9] a shoduje se s oblastí osídlení baltského kmene Semigale ve středověku.

Podle Eva-Liis Loogväli et al. (2004) haploskupina H1b se nachází mezi Estonci (5,3 %), východními Slovany (2,8 %), balkánskými národy (1,8 %) a Slováky (1,7 %) a nenachází se mezi ugrofinskými národy v oblasti Volhy, Turky, národy Blízkého a Středního východu a Asie. [7]

Přes převahu haploskupiny H1b mezi národy východní Evropy se vyskytuje také na Západě ( Španělé , Baskové , Francouzi , Němci ), ale v mnohem menším poměru. V populacích ze Středního východu a Kavkazu Roostalu et al. (2007) našli haploskupinu H1b u Karačajců (4,1 %), Adygů (1,1 %), Balkarů (1 %), Osetinců (0,3 %) a Turků (0,3 %). [8] Stáří haploskupiny H1b je 7,2-14 tisíc let. [jeden]

Pravděpodobně haploskupina H1b vznikla v jižní Francii nebo v Ibérii krátce po skončení doby ledové. Ženy nesoucí H1b cestovaly na východ z dnešní Francie, prošly severně od italských Alp a vstoupily na území dnešního Slovenska. Odtud se H1b šířila na sever.

Možná, že na severu střední Evropy byla haploskupina H1b spojena se sviderskou kulturou posledního paleolitu, běžnou v 10.-9. tisíciletí před naším letopočtem. E. na území moderního Polska, Litvy a západního Běloruska. Nositelé kultury Svider, migrující na severovýchod a jihovýchod, v 8. tisíciletí př. Kr. E. mohla přinést haploskupinu H1b ze severu střední Evropy na území moderního Estonska, jižního Finska a středního Ruska ( butovská mezolitická kultura meziříčí Volha-Oka VIII-VI tisíciletí př. n. l. a kundská mezolitická kultura východního Baltu VIII-VI tisíciletí př. n. l. e.).

V mitochondriální haploskupině H1b je mitochondriální sekvence syna Euphrosyna Mstislavna maďarského krále Bela III nejblíže příbuzná osobě ze skupiny KL-VI karpatské kotliny [10] .

H1f

Podle Eva-Liis Loogväli et al. (2004) haploskupina H1f je nejčastější mezi Finy (10,3 %), byla nalezena také mezi Estonci (1 %) a východními Slovany (0,2 %) a nebyla zjištěna u Slováků, Francouzů, Turků, ugrofinských národů v oblasti Volhy, národy Velké Británie, USA, Blízkého a Středního východu a Asie. [7] Stáří haploskupiny H1f je asi 1000 let. [jeden]


H1c

Haploskupina mtDNA H1c je charakterizována další mutací 477C. Při studiu populací Středního východu a Kavkazu Roostalu et al. (2007) našli haploskupinu H1c pouze u dvou Adygů, což je asi 2,3 % této populace. [8] Stáří haploskupiny H1c je asi 9,4 tisíce let. [jeden]

H1d

Haploskupina mtDNA H1d je charakterizována další mutací 456T, ale tato podtřída byla vyloučena z verze 3 stromu Mannis van Oven. V populacích ze Středního východu a Kavkazu Roostalu et al. (2007) zjistili haploskupinu H1d pouze u dvou Arabů z Kuvajtu, což je asi 1,2 % studované populace. [osm]

Výsledky PaleoDNA

Nikitin a kol. (Unpub) v jeskyni Verteba (Late Trypillia) v Ternopilské oblasti na Ukrajině byly nalezeny 2 vzorky mtDNA haploskupiny H1 datované 4300-3100 lety. před naším letopočtem E. [9] Lacan a kol. (2011), zkoumající Treilles (jižní Francie), z 29 vzorků identifikovali 3 mtDNA haploskupinu H1 datovanou do roku 3000 před naším letopočtem. E. [jedenáct]

Nilsson a kol. v roce 2010 zkoumali údajné ostatky katolické světice ze 14. století Brigid Švédské . [12] Identita ostatků světice je předmětem jistých pochybností kvůli jejich radiokarbonovému datování: je možné, že ostatky pocházejí ze 13. století, zatímco svatá Brigid žila ve 14. století. Haplotyp mtDNA pozůstatků (263G, 315.1C, 3010A, 16189C, 16519C) patří do haploskupiny H1b, f, g, k, q , charakterizované mutací 16189C.

Podle genetiků byla mitochondriální haploskupina H1b identifikována u syna Euphrosyna maďarského krále Bela III [13] .

Fylogenetický strom

Níže uvedený fylogenetický strom je založen na publikaci Van Ovena [2] a následně publikovaných studiích.

Poznámky

  1. 1 2 3 4 5 V. Zaporozhchenko (2011), Haplogroup Ages Archived 30. srpna 2011 na Wayback Machine , "Human mtDNA", Data sestavil V. Zaporozhchenko pro Gentis Company, Build 4, 08/1105/2008
  2. 12 van Oven, Mannis ; Manfred Kaiser. Aktualizovaný komplexní fylogenetický strom globální variace lidské mitochondriální DNA  // Human  Mutation : deník. - 2008. - 13. října ( roč. 30 , č. 2 ). -P.E386 - E394 . Archivováno z originálu 4. prosince 2012.
  3. 1 2 3 Ottoni a kol. 2010, mitochondriální haploskupina H1 v severní příletové Africe: raný holocén z Iberie archivováno 13. srpna 2011 na Wayback Machine
  4. Molekulární pitva mtDNA Haploskupina H potvrzuje, že francouzsko-kantábrijský ledovcový úkryt byl hlavním zdrojem evropského genofondu
  5. Pereira L., Richards M., Goios A., et al. Důkaz mtDNA s vysokým rozlišením pro pozdní zalednění přesídlení Evropy z iberského útočiště   // Výzkum genomu : deník. - 2005. - Leden ( roč. 15 , č. 1 ). - S. 19-24 . - doi : 10.1101/gr.3182305 . — PMID 15632086 .
  6. 1 2 A. Achilli et al., Molekulární disekce mtDNA haploskupiny H potvrzuje, že francouzsko-kantábrijský ledovcový úkryt byl hlavním zdrojem evropského genofondu . AJHG, 2004 . Získáno 11. září 2011. Archivováno z originálu 4. července 2008.
  7. 1 2 3 4 Eva-Liis Loogväli et al., Disuniting Uniformity: A Pied Cladistic Canvas of mtDNA Haplogroup H in Eurasia . Společnost pro molekulární biologii a evoluci, 2004 . Získáno 11. září 2011. Archivováno z originálu 19. srpna 2009.
  8. 1 2 3 4 U. Roostalu et al, Původ a expanze haploskupiny H, dominantní linie lidské mitochondriální DNA v západní Eurasii: perspektiva Blízkého východu a Kavkazu . Molekulární biologie a evoluce, sv. 24, č. 2 (2007), str. 436-448. . Získáno 12. září 2011. Archivováno z originálu 23. září 2011.
  9. 1 2 Haplogroup H1 Archivováno 10. května 2012 na Wayback Machine , Data z webových stránek společnosti Gentis Company
  10. Bea Szeifert et al. Sledování genetických spojení starých Maďarů s populací oblasti Volha-Ural ze 6. až 14. století Archivováno 12. února 2022 na Wayback Machine , 8. února 2022
  11. Lacan et al., Starověká DNA odhaluje mužskou difúzi cestou neolitického Středomoří . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2011. . Získáno 11. září 2011. Archivováno z originálu 18. září 2011.
  12. Nilsson et al., Analýza domnělých pozůstatků evropského patrona Saint-St. Birgitt . PLoS ONE, 2010. . Získáno 11. září 2011. Archivováno z originálu 11. června 2012.
  13. Judith Olasz . Profilování DNA maďarského krále Bély III a dalších kosterních pozůstatků pocházejících z královské baziliky Székesfehérvár Archivováno 29. září 2018 na Wayback Machine , 2018
  14. Název této podtřídy je podle Alvarez-Iglesias (Alvarez-Iglesias 2009)
  15. Tato podtřída byla odstraněna z verze 3 stromu Van Oven.

Odkazy

Strom haploskupin lidské mtDNA

Mitochondriální Eva
|
L0 L1 L2 L3 L4 L5 L6 L7
|
M N
| |
cz D E G Q R Ó A S X Y N1 N2
| | | |
C Z B F R0 před JT P Spojené království N1a W
| | |
HV JT U K
| |
H PROTI J T Starší klastry IWX