Haploskupina T (mtDNA)

Haploskupina T  - v populační genetice - haploskupina lidské mitochondriální DNA.

Původ

Haploskupina T je odvozena od haploskupiny JT , z níž je také odvozena haploskupina J .

Paleogenetika

Předpokládá se, že haploskupina T vznikla asi před 33 tisíci lety na Blízkém východě (v Mezopotámii nebo oblasti Úrodného půlměsíce ), poté se rozšířila v Evropě a na východ asi před 15 tisíci lety až do moderního Pákistánu a Indie [1] .

Haploskupina T je v Evropě přítomna méně než 12 000 let, což z ní činí nejmladší z evropských mitochondriálních haploskupin. Webové stránky Genographic Project poznamenávají, že raní nositelé haploskupiny T byli zřejmě prvními nositeli zemědělské plodiny a tvořili skupinu, která přinesla zemědělství do Evropy a způsobila „ neolitickou revoluci “ [2] .

• Větev T2 má poměrně vysokou frekvenci (20-33 %) mezi mitochondriálními haploskupinami neolitických kultur střední Evropy ( lineární pásová keramika a Sakalhat - ten byl hybridem prvků LLK a kultury Vinca ) [3] . Přibližně se stejnou frekvencí se T2 (subklad T2b) nachází u nosičů kultury Trypillia z jeskyně Verteba [4] .
• Subklady T1a a T2b byly nalezeny u zástupců starčevské kultury , kteří žili ca. před 5700 lety [5] . Subklad T2b byl nalezen u člena kultury Cardiac Ware [6] . T2 a T1 subclades se nalézají v členech Yamnaya kultury .
• T1a2, T2, T2g1a byly identifikovány z eneolitických (4500-3900/3800 př. n. l.) exemplářů z izraelské jeskyně Peqi'in [7] .
• T2a1b byl stanoven v eneolitickém vzorku VJ1001 (6242 let před současností ) z lokality Vonyuchka-1 (Vonyuchka 1) na území Stavropol [8] .
• T2a1a byl identifikován u zástupce katakombové kulturně-historické komunity RISE552 (2849–2146 př. n. l.) z lokality Ulan IV v Rostovské oblasti [9] .
• T1a a T2c1d1 byly identifikovány v pozdně trypilských vzorcích Pocrovca ​​​​3 a Pocrovca ​​​​2 (3500–3100 př. n. l.) z Moldávie [10] , T4 [11] a T2b [4]  v trypillianech z jeskyně Verteba (Ternopilská oblast na Ukrajině) .
• T2b, T2b4 byly identifikovány u zástupců kultury Zlota (2900-2500 př. n. l.) z Polska [12] .
• T2c1a2 byl identifikován u zástupce afanasievské kultury doby bronzové [9] .
• Haploskupina T byla stanovena ve vzorku z BMAC ( Bactria-Margiana Archaeological Complex ) [13] .
• U mumií z Abúsíru byly identifikovány T1a, T1a2, T1a5, T1a7, T1a8a, T2, T2c1, T2c1c a T2e [14] .
• T1 byl identifikován u zástupce skytské kultury Pazyryk z doby železné [15] .
• T2c1a byl identifikován ve staroegyptské mumii OM S1 z Art Museum of the University of Tartu, datované do druhé poloviny 1. tisíciletí před naším letopočtem [16] .
• T2 byl identifikován u jednoho z Vikingů z pohanského pohřbu Galgedil (Galgedil) na dánském ostrově Funen (700-1100 n. l.) [17] .
• T1, T1a1j, T2 a T2f1 byly identifikovány mezi obyvateli Sigtuny , kteří žili přibližně v 10.-12. století [18] .
• T2b21b byl stanoven ze vzorku Sk6990 (XVI. století) ze Stříbrného dolu ve Švédsku [19] .
• T2b byl identifikován u válečnice z komorového pohřbu Bj.581 na ostrově Björkö , pohřbené v 10. století v hrobě spolu s bitevní sekerou, nožem, kopím, šípy prorážejícími zbroj, dvěma štíty, hřebcem a klisna [20] .
• T1 byl identifikován u Římana (ERS3189333, QED-2) z hory Qornet ed-Deir v severním Libanonu, který žil kolem 244-400 [21] .
• T2 byl nalezen u křižáka ze Sidonu (ERS3189343, SI-53), který žil kolem 1025-1154 [21] .
• T2d1 identifikoval exemplář z hřbitova Zhenzishan v Shangdu, Čína (XIII. století) [22] .
• T2b1 byl identifikován v pozůstatcích starých asi 700 let, které byly připisovány kromaňonským kromaňoncům 1 [23] .

Moderní distribuce

V současné době byla vysoká koncentrace haploskupiny T nalezena podél východního pobřeží Baltského moře . Podle Oxford Ancestors haploskupina T „tvoří necelých 10 % moderní populace Evropy. Jeho četné dílčí větve jsou rozšířeny v jižní a západní Evropě, s obzvláště vysokou koncentrací v Irsku a západní Británii . Podle webové stránky Genographic Project má „Haploskupina T velmi širokou distribuci a v současné době je distribuována až do údolí Indus v Indii a Pákistánu a až na jih na Arabský poloostrov. Je zastoupen i ve východní a severní Evropě“ [2] . Haploskupina T zaujímá 2-4 místa po H z hlediska prevalence mezi Rusy, spolu s haploskupinami U a J, - cca. 12 % [25] .

Významní představitelé

Genetická analýza ostatků posledního ruského cara Mikuláše II . a jeho příbuzných ukázala, že patřil do haploskupiny T2 [26] [27] [28] . Pokud ve známých genealogiích evropských panovníků není žádná chyba, lze tuto haploskupinu vysledovat až k Barbaře Zilli (1390-1451), manželce císaře Svaté říše římské Zikmunda . Velké množství evropské šlechty patří do stejné linie, včetně: George I (Velká Británie) a Frederick William I (přes Sophii Hannoverské ), Charles I (král Anglie) , George III (král Velké Británie) , George V. (král Velké Británie) Karel X. Gustav ( Švédsko), Gustav II Adolf (Švédsko), Moritz z Nassau , Olaf V (Norsko) a Jiří I. (král Řecka) .

Medicína

Podle jedné ze studií, jejíž výsledky odborníci kritizovali, je mitochondriální haploskupina T spojena se sníženou pohyblivostí spermií u mužů [29] .

Podle publikace z Katedry biochemie a molekulární buněčné biologie Univerzity v Zaragoze představuje haploskupina T slabou genetickou predispozici k astenozoospermii [30] .

Podle některých studií je přítomnost haploskupiny T spojena se zvýšeným rizikem onemocnění koronárních tepen [31] . Podle jiné studie jsou přenašeči T méně náchylní k cukrovce [32] .

Několik pilotních lékařských studií ukázalo, že přítomnost haploskupiny T je spojena se sníženým rizikem Parkinsonovy a Alzheimerovy choroby [33] .

Viz také

Poznámky

1. ↑ Co mi řekl můj genom - výsledky 23andMe očima profesionálního genetika Archivováno 20. srpna 2017 na Wayback Machine , 6. února 2014
2. ↑ 1 2 Atlas of the Human Journey – The Genographic Project Archived 26. července 2011 na Wayback Machine
3. ↑ Starověké důkazy DNA pro homogenní mateřský genofond v šestém tisíciletí před naším letopočtem Maďarsko a středoevropský LBK . Datum přístupu: 26. února 2017. Archivováno z originálu 25. února 2020. (neurčitý)
4. ↑ 1 2 Alexey G. Nikitin, Inna Potekhina, Nadin Rohland, Swapan Mallick, David Reich, Malcolm Lillie. Analýza mitochondriální DNA eneolitických trypiliánů z Ukrajiny odhaluje genetické kořeny neolitického zemědělství  (anglicky)  // PLoS ONE. - 2017. - 24. února ( č. 12(2) ). - doi : 10.1371/journal.pone.0172952 .
5. ↑ Szécsényi-Nagy a kol. (2015), Sledování genetického původu prvních evropských farmářů odhaluje pohledy na jejich sociální organizaci, Proceedings of the Royal Society B, sv. 282, č.p. 1805, 20150339. (Dříve publikováno online 2014 jinde před tiskem) . Získáno 2. září 2015. Archivováno z originálu 1. dubna 2016. (neurčitý)
6. ↑ Společný genetický původ pro rané farmáře ze středomořských kardiálních a středoevropských kultur LBK . Získáno 5. září 2015. Archivováno z originálu 5. září 2015. (neurčitý)
7. ↑ Éadaoin Harney a kol. Starověká DNA z chalkolitického Izraele odhaluje roli populační směsi v kulturní transformaci Archivováno 20. srpna 2018 na Wayback Machine , 2018
8. ↑ Chuan-Chao Wang a kol. Data starověkého lidského genomu z 3000letého intervalu na Kavkaze odpovídají ekogeografickým oblastem Archivováno 15. července 2021 na Wayback Machine , 4. února 2019 (doplňková data 1)
9. ↑ 1 2 Morten E. Allentoft a kol. "Populační genomika z doby bronzové Eurasie" Archivováno 30. dubna 2016 na Wayback Machine , 2015
10. ↑ Alexander Immel a kol. Tok genů ze stepních jedinců do populací spojených s Cucuteni-Trypillia naznačuje dlouhodobé kontakty a postupné přimíchávání Archivováno 8. prosince 2019 na Wayback Machine , 2019
11. ↑ Nikitin A.G. et al. Komplexní chronologie lokalit a analýza starověké mitochondriální DNA z jeskyně Verteba – naleziště trypilské kultury eneolitické Ukrajiny  (anglicky)  // Interdisciplinaria Archaeologica – Přírodní vědy v archeologii. - 2010. - Sv. Já , iss. 1–2 . — S. 9–18 . - doi : 10.24916/iansa.2010.1-2.1 .
12. ↑ Anna Juras a kol. Mateřský genetický původ pozdní a poslední neolitické lidské populace ze současného Polska Archivováno 27. července 2021 na Wayback Machine , 26. července 2021
13. ↑ Genomická formace jižní a střední Asie archivována 1. dubna 2018 na Wayback Machine , 31. března 2018
14. ↑ Verena J. Schuenemann a kol. Genomy staroegyptských mumií naznačují nárůst předků ze subsaharské Afriky v postřímských obdobích Archivováno 30. září 2019 na Wayback Machine , 30. května 2017
15. ↑ Mitochondriální haploskupiny a haploskupiny Y-chromozomu extrahované z historických a prehistorických lidských pozůstatků v Evropě a souvisejících pozůstatků v Asii, uspořádané chronologicky . Získáno 7. února 2016. Archivováno z originálu dne 28. září 2021. (neurčitý)
16. ↑ Ester Oras a kol. Multidisciplinární vyšetřování dvou egyptských dětských mumií kurátorů na Univerzitě v Tartu Art Museum, Estonsko (Pozdní/Řecko-římské období) , 2020
17. ↑ Linea Melchior, Toomas Kivisild, Niels Lynnerup, Jørgen Dissing . Důkazy o autentické DNA z dánských koster z doby Vikingů nedotčených lidmi po dobu 1000 let Archivováno 10. dubna 2022 na Wayback Machine , 28. května 2008
18. ↑ Maja Krzewińska a kol. Variace genomu a izotopu stroncia odhalují imigrační vzorce ve městě doby Vikingů Archivováno 23. dubna 2020 na Wayback Machine , 2018
19. ↑ Maja Krzewińskaa a kol. Objasnění nedávné historie sledováním genetické příbuznosti tří horníků ze Švédska ze 16. století , 2018
20. ↑ Charlotte Hedenstierna-Jonson a kol. Vikingská bojovnice potvrzená genomikou Archivováno 13. dubna 2019 na Wayback Machine , 8. září 2017
21. ↑ 1 2 Marc Haber a kol. Přechodný puls genetické příměsi od křižáků na Blízkém východě identifikovaný ze starověkých genomových sekvencí archivovaných 31. května 2019 na Wayback Machine , 2019
22. ↑ Jiawei Li a kol. Starověké genomy odhalují složitou genetickou historii mezinárodní metropole v Kublajchánově horním hlavním městě (Xanadu) , 14. června 2022
23. ↑ Qiaomei Fu a kol. Revidované časové měřítko pro lidskou evoluci na základě starověkých mitochondriálních genomů Archivováno 5. září 2020 na Wayback Machine , 2013
24. ↑ http://www.oxfordancestors.com/content/view/35/55/ Archivováno 15. července 2017 na Wayback Machine Oxford Ancestors Maternal Ancestry
25. ↑ Claudio Ottoni a kol. Mitochondriální analýza byzantské populace odhaluje rozdílný dopad mnoha historických událostí v Jižní Anatolii, 2011 . Získáno 3. října 2017. Archivováno z originálu dne 26. března 2017. (neurčitý)
26. ↑ Rogaev, (2009), Genomická identifikace v historickém případě královské rodiny Nicholase II., Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, sv. 106, č. 13 (březen 2009), pp. 5258 - 5263. . Získáno 3. října 2017. Archivováno z originálu dne 28. ledna 2022. (neurčitý)
27. ↑ Coble M.D., et al. (2009), Mystery Solved: The Identification of the Two Missing Romanov Children Using DNA Analysis, PLoS ONE, sv. 4, č. 3: e4838. . Získáno 3. října 2017. Archivováno z originálu dne 28. ledna 2022. (neurčitý)
28. ↑ http://isogg.org/famousdna.htm Archivováno 13. června 2006 na Wayback Machine ISOGG's Famous DNA
29. ↑ Přirozený výběr formoval regionální variace mtDNA u lidí . Získáno 25. ledna 2022. Archivováno z originálu dne 25. ledna 2022. (neurčitý)
30. ↑ Ruiz-Pesini E., Lapeña AC, Díez-Sánchez C., et al. Haploskupiny lidské mtDNA spojené s vysokou nebo sníženou pohyblivostí spermií  (anglicky)  // Am. J. Hum. Genet. : deník. - 2000. - září ( roč. 67 , č. 3 ). - S. 682-696 . - doi : 10.1086/303040 . — PMID 10936107 .
31. ↑ ScienceDirect - Mitochondrie : 30 Mitochondriální haploskupina T je spojena s onemocněním koronárních tepen . Získáno 31. května 2009. Archivováno z originálu 31. srpna 2010. (neurčitý)
32. ↑ Nositelé mitochondriální DNA haplotypu 'T' jsou méně náchylní k cukrovce "Mathilda's Anthropology Blog" . Získáno 31. května 2009. Archivováno z originálu 30. března 2009. (neurčitý)
33. ↑ Jinde bylo hlášeno, že členství v haploskupině T může nabídnout určitou ochranu proti Alzheimerově chorobě (Chagnon et al. 1999; Herrnstadt et al. 2002) a také Parkinsonově chorobě (Pyle et al. 2005), ale varovná slova Pereiry a kol. naznačují, že před dosažením pevných závěrů mohou být nutné další studie. . Získáno 31. května 2009. Archivováno z originálu 31. května 2008. (neurčitý)

Odkazy

• T YFull MTree 1.02.00 (ve výstavbě)
• Místo mitochondriální DNA Iana Logana
• Seznam diskuzí na webu Roots
• Rozšíření Haploskupiny T z National Geographic
• Genetická genealogie: Osobní pohled na Taru, Karelians a Kent, Anglie
• Danish Demes Regional DNA Project: mtDNA Haplogroup T
• Analýza sekvence haploskupiny T (T5/T2)
• Fylogenetické sítě pro lidskou mtDNA Haploskupina T
• Fylogenetické sítě pro lidskou mtDNA Haploskupina T
• Genografický projekt Účast veřejnosti Databáze mitochondriální DNA
• Molekulární nestabilita sekvencí mitochondriální haploskupiny T na nukleotidových pozicích 16292 a 16296  (nedostupný odkaz)
• Babalini C., Martinez-Labarga C., Tolk HV a kol. Populační historie chorvatské jazykové menšiny Molise (jižní Itálie): mateřský pohled  (anglicky)  // Eur. J. Hum. Genet. : deník. - 2005. - srpen ( roč. 13 , č. 8 ). - S. 902-912 . - doi : 10.1038/sj.ejhg.5201439 . — PMID 15886710 .
• Abu-Amero KK, Larruga JM, Cabrera VM, González AM Struktura mitochondriální DNA na Arabském poloostrově  //  BioMed Central : deník. - 2008. - Sv. 8 . — S. 45 . - doi : 10.1186/1471-2148-8-45 . — PMID 18269758 .
• Thomas MG, Barnes I., Weale ME, a kol. Nové genetické důkazy podporují izolaci a drift v ladinských komunitách v jihotyrolských Alpách, ale ne starověkého původu na Středním východě   // Eur . J. Hum. Genet. : deník. - 2008. - Leden ( roč. 16 , č. 1 ). - str. 124-134 . - doi : 10.1038/sj.ejhg.5201906 . — PMID 17712356 .
• Mitochondriální haploskupina T je spojena s onemocněním koronárních tepen
• Nositelé mitochondriální DNA haplotypu 'T' jsou méně náchylní k cukrovce