Integrase
Aktuální verze stránky ještě nebyla zkontrolována zkušenými přispěvateli a může se výrazně lišit od verze recenzované 29. září 2018; kontroly vyžadují 2 úpravy .| Doména integrázy vázající zinek | |
|---|---|
| Struktura N-koncové domény vázající zinek hiv-1 integrázy | |
| Identifikátory | |
| Symbol | Integrase Zn |
| Pfam | PF02022 |
| InterPro | IPR003308 |
| SCOP | 1wjb |
| NADRODINĚ | 1wjb |
| Dostupné proteinové struktury | |
| Pfam | struktur |
| PNR | RCSB PNR ; PDBe ; PDBj |
| PDB součet | 3D model |
| Mediální soubory na Wikimedia Commons | |
| Integrase jádro | |
|---|---|
| Identifikátory | |
| Symbol | rve |
| Pfam | PF00665 |
| klan Pfam | CL0219 |
| InterPro | IPR001584 |
| SCOP | 2itg |
| NADRODINĚ | 2itg |
| Dostupné proteinové struktury | |
| Pfam | struktur |
| PNR | RCSB PNR ; PDBe ; PDBj |
| PDB součet | 3D model |
| Mediální soubory na Wikimedia Commons | |
| Integrázová doména vázající DNA | |
|---|---|
| Identifikátory | |
| Symbol | V DBD C |
| Pfam | PF00552 |
| InterPro | IPR001037 |
| SCOP | 1ihw |
| NADRODINĚ | 1ihw |
| Dostupné proteinové struktury | |
| Pfam | struktur |
| PNR | RCSB PNR ; PDBe ; PDBj |
| PDB součet | 3D model |
| Mediální soubory na Wikimedia Commons | |
Integrase ( IN ) je enzym , který katalyzuje integraci (inkluzi) DNA viru ( retroviru , zejména HIV [1] [2] ) do chromozomu hostitelské buňky . Před integrací jsou lineární molekuly DNA viru nejprve uzavřeny do kruhu a poté integrovány.
Retrovirové integrázy jsou klíčovou složkou preintegračního komplexu ( PIC ).
Podobné fágové enzymy jsou fágová integráza , jako je A fágová integráza (Int).
Struktura
Všechny retrovirové integrázy se skládají ze tří kanonických domén:
- N-koncová doména vázající zinek s motivem HHCC (např. His12 His16 Cys40 Cys43 v HIV-1);
- katalytická doména (RNázaH);
- C-terminální doména vázající DNA (SH3).
Byla studována struktura integrázových domén virů HIV-1, HIV-2, SIV, Rous Sarcoma Virus (RSV), první výsledky byly publikovány v roce 1994. Existují důkazy, že integráza funguje jako tetramer. Několik buněčných proteinů interaguje s integrázou, zejména s lidským chromatinem asociovaným LEDGF.
Integrase HIV
Virus lidské imunodeficience obsahuje integrázu 32 kDa v genu Pol . Tento enzym je slibným cílem pro HAART . Používají se tři inhibitory HIV integrázy : Raltegravir (RAL, Isentress, od roku 2007), Dolutegravir (DTG, Tivicay), Elvitegravir (EVG, od roku 2012) [3]
Poznámky
- ↑ HIV integráza, stručný přehled od chemie k terapii . Získáno 20. srpna 2016. Archivováno z originálu 15. listopadu 2016.
- ↑ STRUKTURA A FUNKCE INTEGRACE HIV-1 Archivováno 1. října 2008 na Wayback Machine , Advances in Biological Chemistry, vol. 45, 2005, str. 87-122
- ↑ HIV Integrase Inhibitors: 20-Year Landmark and Challenges Archived 11. September 2016 at Wayback Machine / Adv Pharmacol. 2013;67:75-105. ISSN 1054-3589, doi:10.1016/B978-0-12-405880-4.00003-2 PMID 23885999 .
Odkazy
- Struktura retrovirové integrázy a mechanismus rekombinace DNA. / Microbiol Spectr. 2014;2(6):1-22.
- Retrovirové integrázové proteiny a HIV-1 DNA integrace. / J Biol Chem. 30. listopadu 2012;287(49):40858-66. doi : 10.1074/jbc.R112.397760
- Retroviral Integrase, Putting the Pieces Together / The American Society for Biochemistry and Molecular Biology, 1996
 Slovníky a encyklopedie |
|---|