Modelování biologických systémů je směr v biologickém modelování, konkrétně proces vytváření modelů biologických systémů s jejich charakteristickými vlastnostmi. Předmětem modelování se může stát jakýkoli biologický systém . Biologické modelování je důležitým úkolem v systémech a matematické biologii. Biologické výpočetní systémy jsou zaměřeny na vývoj a využití efektivních algoritmů, datových struktur, vizualizačních a komunikačních nástrojů pro počítačovou simulaci biologických systémů. Jedná se o využití počítačových simulací biologických systémů, včetně obou buněčných subsystémů (například sítě metabolitů a enzymů, které obsahují metabolismus, signální dráhy a genové regulační sítě) a analýzu a vizualizaci komplexních vazeb těchto buněčných procesů. Umělý život nebo virtuální evoluce se pokouší pochopit evoluční procesy prostřednictvím počítačových simulací jednoduchých forem života.
Je zřejmé, že neočekávaný výskyt vlastnosti komplexního systému je výsledkem kauzálních interakcí jednoduchých a složitých částí. Biologické systémy vykazují četné důležité příklady utváření vlastností při komplexní interakci složek. Tradiční studium biologických systémů zahrnuje restorativní metody, ve kterých se data shromažďují do kategorií, jako je koncentrace v průběhu času v reakci na konkrétní podnět. Počítače jsou rozhodující pro analýzu a modelování těchto dat. Cílem je vytvořit modely systémů v reálném čase podle prostředí a vnitřních podnětů, jako je model rakovinných buněk pro nalezení slabých míst v jejich signálních drahách nebo model mutace iontových kanálů pro sledování účinků na kardiomyocyty. , práce srdce.