Mořské bakteriofágy

Mořské bakteriofágy jsou viry , které žijí v mořských bakteriích , jako jsou sinice [1] . Jejich existence byla stanovena pomocí elektronové mikroskopie a epifluorescenční mikroskopie vzorků vody a následného metagenomického vyšetření vzorků nekultivovaných virů [1] [2] . Ocasní bakteriofágy dominují v mořských společenstvech z hlediska početnosti a diverzity zástupců [1] . Viry patřící do čeledí Corticoviridae [3] , Inoviridae [4] a Microviridae [5] jsou však také známé tím, že infikují mořské bakterie. Podle metagenomických dat mikroviry (ikosahedrální ssDNA fágy) dominují ve vodním prostředí pouze částečně [5] .

Bakteriofágy - viry, které infikují bakterie - byly objeveny na začátku dvacátého století . V současné době se vědci shodují, že jejich význam v ekosystémech , zejména v mořských ekosystémech, byl podceňován [6] .

Mořské fágy

Mořské bakteriofágy se zdají být nejhojnější a nejrozmanitější formou replikace molekul DNA na planetě. Existuje 5 × 10 7 fágů na mililitr mořské vody [7] . HTVC010P infikuje jednu z nejběžnějších mořských bakterií, Pelagibacter ubique , z kladu SAR11 . Mohou globálně ovlivňovat biochemické cykly, regulovat mikrobiální biodiverzitu , koloběh uhlíku v mořských potravinových řetězcích a hrát důležitou roli v prevenci přemnožení bakterií [8] . Vědci zkoumají možnou roli cyanofágů v prevenci a zastavení eutrofizace .

Ve spodních sedimentech

Mořské bakteriofágy tvoří důležitou součást hlubokomořských ekosystémů. Existuje od 5 × 10 12 do 1 × 10 13 fágů na metr čtvereční hlubokého mořského dna a jejich množství souvisí s množstvím prokaryot ve spodních sedimentech. Způsobují smrt téměř 80 % prokaryot žijících ve spodních sedimentech a téměř ve všech případech je příčinou smrti rozpad buněk . Z tohoto důvodu hrají bakteriofágy důležitou roli při přenosu živin z živých organismů do rozložené organické hmoty a dalších produktů. To vysvětluje vysoký obrat živin na dně oceánu. Uvolňování živin z infikovaných bakterií způsobuje růst neinfikovaných bakterií, které se pak také infikují bakteriofágem. Vzhledem k významu dnových sedimentů v biochemických cyklech ovlivňují mořské bakteriofágy cykly uhlíku, dusíku a fosforu , ale jak přesně svůj vliv uplatňují, není zatím jasné [7] .

Cyklus uhlíku

Mořské viry mohou hrát důležitou roli v uhlíkovém cyklu zvýšením účinnosti biologických pump. Lýza uvolňuje nestabilní sloučeniny, jako jsou aminokyseliny a nukleové kyseliny , které se rychle rozkládají blízko hladiny vody; avšak obtížněji rozložitelný uhlíkatý materiál, jako je ten, který vstupuje do buněčných stěn, je pravděpodobně poslán na dno oceánu. Proto je materiál, který viry posílají ke dnu, bohatší na uhlík než ten, ze kterého byl získán. To může zlepšit účinnost biologické pumpy [9] .

Poznámky

  1. 1 2 3 Mann, NH [7885/3/5/pdf/10.1371_journal.pbio.0030182-S.pdf Třetí věk fága]  (neopr.)  // PloS Biol. - Spojené státy americké: Public Library of Science, 2005. - 17. květen ( díl 3 , č. 5 ). - S. 753-755 . - doi : 10.1371/journal.pbio.0030182 . — PMID 15884981 .
  2. Wommack, K. Eric; Russell T. Hill, Terri A. Muller a Rita R. Colwell. Účinky slunečního záření na životaschopnost a strukturu bakteriofágů  //  Aplikovaná a environmentální mikrobiologie : deník. - Spojené státy americké: Americká společnost pro mikrobiologii, 1996. - duben ( vol. 62 , č. 4 ). - S. 1336-1341 . — PMID 8919794 .
  3. Krupovic M., Bamford DH Předpokládané profágy související s lytickým bezocasým mořským dsDNA fágem PM2 jsou rozšířené v genomech vodních bakterií  //  BMC Genomics : deník. - 2007. - Sv. 8 . — S. 236 . - doi : 10.1186/1471-2164-8-236 . — PMID 17634101 .
  4. Xue H., Xu Y., Boucher Y., Polz MF Vysoká frekvence nového vláknitého fága, VCY φ, v rámci environmentální populace Vibrio cholerae  (Angl.)  // Appl Environ Microbiol : deník. - 2012. - Sv. 78 , č. 1 . - str. 28-33 . - doi : 10.1128/AEM.06297-11 . — PMID 22020507 .
  5. 1 2 Roux S., Krupovic M., Poulet A., Debroas D., Enault F. Evoluce a diverzita virové rodiny Microviridae prostřednictvím kolekce 81 nových kompletních genomů sestavených z viromových čtení  (anglicky)  // PLoS One  : časopis. - 2012. - Sv. 7 , č. 7 . — P.e40418 . - doi : 10.1371/journal.pone.0040418 . — PMID 22808158 .
  6. Kellogg, CA; JB Rose, SC Jiang a JM Thurmond a JH Paul. Genetická rozmanitost příbuzných vibriofágů izolovaných z mořského prostředí kolem Floridy a Havaje, USA  //  Marine Ecology Progress Series : deník. - Německo: Inter-Research Science Center, 1995. - Sv. 120 , č. 1-3 . - str. 89-98 . - doi : 10.3354/meps120089 .
  7. 1 2 Danovaro, Roberto; Antonio Dell'Anno1, Cinzia Corinaldesi1, Mirko Magagnini, Rachel Noble, Christian Tamburini & Markus Weinbauer. Hlavní virový dopad na fungování bentických hlubokomořských ekosystémů  (anglicky)  // Nature : journal. - 2008. - 28. srpna ( roč. 454 , č. 7208 ). - S. 1084-1087 . - doi : 10.1038/nature07268 . — PMID 18756250 .
  8. Waldor, M; D Friedman S Adhya, redakce. Fágy : jejich role v bakteriální patogenezi a biotechnologii  . -Washington DC: ASM Press, 2005. - str  . 450 . — ISBN 978-1-55581-307-9 .
  9. ↑ Mořské viry Suttle CA – hlavní hráči v globálním ekosystému  // Nature Reviews  . Mikrobiologie  : časopis. - 2007. - říjen ( ročník 5 , č. 10 ). - S. 801-812 . - doi : 10.1038/nrmicro1750 . — PMID 17853907 .