Plastocyaninová rodina proteinů vázajících měď

Rodina plastocyanin/azurinových proteinů vázajících měď (nebo modrá proteinová doména typu 1)  je rodina malých proteinů schopných vázat jeden atom mědi a vyznačujících se silnou absorpcí s maximem kolem 600 nm, díky čemuž je v redukovaném stavu obvykle jsou zbarveny jasně modře (viz proteiny obsahující měď). proteiny ) [2] [3] . Nejznámějšími členy této třídy proteinů jsou rostlinné plastocyaniny , malé, ve vodě rozpustné chloroplastové proteiny, které přenášejí elektron z cytochromu f a jsou vzdáleně příbuzné bakteriálním proteinům azurinům., které si vyměňují elektrony s cytochromem c551. Tato rodina také zahrnuje protein amycyanin z bakterií, jako je Methylobacterium extorquens nebo Paracoccus versutus ( Thiobacillus versutus ), které mohou růst na methylaminu ; auracyaniny A a B z Chloroflexus aurantiacus ; [4] protein modré mědi z Alcaligenes faecalis ; cupredoxin z peelingů Cucumis sativus (okurka); [5] Cusacyanin (základní modrý protein) z okurky; halocyanin, membránově vázaný protein z Natronomonas pharaonis ( Natronobacterium pharaonis ), [6] pseudoazurin z Pseudomonas ; rusticyanin z Thiobacillus ferrooxidans ; [7] stellacyanin z Rhus vernicifera (japonský lakovník); umecyanin z kořenů Armoracia rusticana (křen); a Ra3 alergen z ambrózie . Tento pylový protein je evolučně blízký výše uvedeným polypeptidům, ale zdá se, že ztratil schopnost vázat měď. Ačkoli existuje výrazná divergence v primární struktuře všech těchto proteinů, vazebné místo pro měď zůstává vysoce konzervované.

Poznámky

1. ↑ Guss JM, Bartunik HD, Freeman HC . Přesnost a přesnost v analýze struktury proteinů: omezené zpřesňování struktury topolového plastocyaninu metodou nejmenších čtverců při rozlišení 1,33 A   // Acta Cryst . B : deník. - International Union of Crystallography , 1992. - Prosinec ( roč. 48 , č. 6 ). - S. 790-811 . - doi : 10.1107/S0108768192004270 . — PMID 1492962 .
2. ↑ Clingeleffer DJ, Guss JM, Rogers SJ, Freeman HC, Garrett TP Krystalová struktura topolového apoplastocyaninu při rozlišení 1,8-A. Geometrie místa vázajícího měď je vytvořena polypeptidem  //  J. Biol. Chem.  : deník. - 1984. - Sv. 259 , č.p. 5 . - str. 2822-2825 . — PMID 6698995 .
3. ↑ Hunt LT, Ryden LG Evoluce proteinové komplexity: modré oxidázy obsahující měď a příbuzné proteiny  //  J. Mol. Evol. : deník. - 1993. - Sv. 36 , č. 1 . - str. 41-66 . - doi : 10.1007/BF02407305 . — PMID 8433378 .
4. ↑ Meyer TE, Han J., McManus JD, Brune DC, Sanders-Loehr J., Cusanovich MA, Tollin G., Blankenship RE Izolace, charakterizace a aminokyselinové sekvence auracyaninů, modrých měděných proteinů ze zelené fotosyntetické bakterie Chloroflexus aurantiacus  (anglicky)  // J. Biol. Chem.  : deník. - 1992. - Sv. 267 , č.p. 10 . - S. 6531-6540 . — PMID 1313011 .
5. ↑ Messerschmidt A., Mann K., Thoenes U., Mehrabian Z., Nalbandyan R., Schafer W. Aminokyselinová sekvence měděného proteinu typu I s neobvyklou C-terminální doménou bohatou na serin a hydroxyprolin izolovanou z okurky peelingy  (anglicky)  // FEBS Lett. : deník. - 1992. - Sv. 314 , č.p. 3 . - str. 220-223 . - doi : 10.1016/0014-5793(92)81475-2 . — PMID 1468551 .
6. ↑ Oesterhelt D., Mattar S., Scharf B., Rodewald K., Engelhard M., Kent SB Primární struktura halocyaninu, proteinu archaální modré mědi, předpovídá kotevní lipid pro  fixaci membrány  J.// Chem.  : deník. - 1994. - Sv. 269 , č.p. 21 . - S. 14939-14945 . — PMID 8195126 .
7. ↑ Yano T., Fukumori Y., Yamanaka T. Aminokyselinová sekvence rusticyaninu izolovaného z Thiobacillus ferrooxidans  // FEBS Lett  . : deník. - 1991. - Sv. 288 , č.p. 1 . - S. 159-162 . - doi : 10.1016/0014-5793(91)81025-4 . — PMID 1879547 .