Pseudogeny ( anglicky pseudogenes ) jsou nefunkční analogy strukturních genů , které ztratily schopnost kódovat protein a nejsou exprimovány v buňce [1] . Termín „pseudogenní“ byl poprvé navržen v roce 1977 [2] . Některé pseudogeny mohou být zkopírovány z mRNA a začleněny do chromozomů , takové sekvence se nazývají zpracované pseudogeny (retropseudogenes) [1] . Jsou však také nefunkční. Pseudogeny pocházejí z běžných funkčních genů, ale ztrácejí svou schopnost být exprimovány v důsledku mutací (vzhled stop kodonů , posun rámce atd.) [3] .
Počet zpracovaných pseudogenů (retropseudogenů) je v průměru větší než počet funkčních genů předků. Někdy může počet zpracovaných pseudogenů převyšovat počet odpovídajících funkčních genů o několik řádů. Jedním příkladem je rodina opakování Alu obsahující charakteristické restrikční místo endonukleázy Alu1 [1] [3] [4] .
Analýza genetické sekvence pseudogenů a jejich srovnání s geny předků lze využít při studiu rodinných vazeb mezi různými typy živých bytostí a jejich původu [3] .