Rekombinázová polymerázová amplifikace

Rekombinázová polymerázová amplifikace ( anglicky  Recombinase Polymerase Amplification , RPA) je alternativou k polymerázové řetězové reakci . Technologie RPA zajišťuje namnožení genetického materiálu za méně než 15 minut [1] a samotná reakce probíhá za izotermických podmínek . Přidáním reverzní transkriptázy do reakční směsi pomocí RPA je možné detekovat RNA i DNA bez nutnosti samostatného postupu přípravy cDNA . Vzhledem k tomu, že reakce je izotermická, lze pro ni oproti PCR použít levnější a jednodušší zařízení [2] [3] [4] [5] [6] [7] . Optimální teplotní rozsah je 37-42 °C, ale reakce probíhá nízkou rychlostí a při teplotě místnosti. Tato výhoda činí RPA vynikajícím kandidátem pro vývoj levných, rychlých, terénních molekulárních diagnostických testů. Technika RPA byla vyvinuta společností TwistDX LTD, biotechnologickou společností se sídlem v Cambridge ve Velké Británii.

Poznámky

  1. ↑ RYCHLÝ TEST Zjistí VIROVOU DNA BEZ PCR . chemport.ru (04.02.2015). Získáno 6. října 2015. Archivováno z originálu 6. října 2015.
  2. ↑ Zachary Austin Crannell, Brittany Rohrman, Rebecca Richards-Kortum. Kvantifikace DNA HIV-1 pomocí amplifikace rekombinázové polymerázy v reálném čase  // Analytická chemie. — 2014-06-17. - T. 86 , č.p. 12 . - S. 5615-5619 . — ISSN 0003-2700 . - doi : 10.1021/ac5011298 .
  3. ↑ Liu, L., Wang, J., Geng, Y., Wang, J., Li, R., Shi, R., & Yuan, W. (2018). Rekombinázový polymerázový amplifikační test bez vybavení využívající tělesné teplo pro vizuální a rychlou detekci psího parvoviru v místě potřeby 2. Molekulární a buněčné sondy, 39, 41-46. PMID 29705183 PMC 7127419 doi : 10.1016/j.mcp.2018.04.004
  4. ↑ Qin, Z., Xue, L., Cai, W., Gao, J., Jiang, Y., Yang, J., ... & Wu, Q. (2021). Vývoj amplifikačního testu s podporou rekombinázy pro rychlou detekci lidského noroviru GII. 4. BMC Infection Diseases, 21(1), 1-8. PMID 33750333 PMC 7941963 doi : 10.1186/s12879-021-05942-x
  5. ↑ Zhang, W., Feng, Y., Zhao, H., Yan, C., Feng, J., Gan, L., ... & Yuan, J. (2021). Rekombinázou podporovaný amplifikační test pro rychlou detekci genu karbapenemázy Klebsiella pneumoniae a jeho charakteristik u Klebsiella pneumoniae. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 869. PMID 34616692 PMC 8488121 doi : 10.3389/fcimb.2021.746325
  6. ↑ Feng, Y., Xue, G., Feng, J., Yan, C., Cui, J., Gan, L., ... & Yuan, J. (2021). Rychlá detekce genu metalo-β-laktamázy v New Delhi pomocí rekombinázy podporované amplifikace přímo na klinických vzorcích od dětí. Frontiers in microbiology, 2087. PMID 34367092 PMC 8339468 doi : 10.3389/fmicb.2021.691289
  7. ↑ Li, F., He, P., Xiong, D., Lou, Y., Pu, Q., Zhang, H., ... & Yu, J. (2021). Reverzní transkripční metoda amplifikace podporovaná rekombinázou pro rychlou detekci SARS-CoV-2 v místě péče, včetně variant. Viry, 13(9), 1875. PMID 34578456 PMC 8472806 doi : 10.3390/v13091875