Avsunviroidae

Avsunviroidae
vědecká klasifikace
Skupina:Viry [2]Skupina:viroidy [1]Rodina:Avsunviroidae
Mezinárodní vědecký název
Avsunviroidae

Avsunviroidae  (lat.)  je čeleď viroidů . Známí jsou zatím tři zástupci. Skládají se z molekuly RNA , která tvoří viroidní genom o délce 246-375 nukleotidů . Jsou reprezentovány jednořetězcovou kruhovou molekulou RNA a mají intramolekulární párové báze. Všem zástupcům chybí neměnné centrální místo.

Replikace

K replikaci dochází v chloroplastech rostlinných buněk . Klíčovými rysy replikace u zástupců této rodiny jsou absence potřeby pomocného viru a také absence kódování proteinů . Na rozdíl od jiné čeledi viroidů, Pospiviroidae , replikace u Avsunviroidae se řídí symetrickým opakujícím se mechanismem. Předpokládá se, že pozitivní vlákna RNA působí jako templát pro tvorbu negativních vláken enzymem podobným RNA polymeráze II. Negativní řetězec RNA je pak štěpen ribozymem . Při druhém opakování mechanismu se vytvoří pozitivní vlákno, které je také štěpeno ribozymem a poté upevněno a stane se kruhovým. Přesné místo replikace není známo, ale předpokládá se, že k ní dochází v chloroplastech v přítomnosti iontů hořčíku .

Struktura

Předpokládá se, že viroidy této rodiny existují jako tyčinkovité molekuly s oblastmi párovými bázemi, kde tvoří struktury podobné kolíkům nebo mají rozvětvené konfigurace.

Klasifikace

Podle Mezinárodního výboru pro taxonomii virů (ICTV) od května 2016 zahrnuje čeleď Avsunviroidae 3 rody [3] :

Poznámky

  1. ↑ Od roku 1998 není Viroids platným taxonem podle ICTV , ale je jím používán jako běžný název pro skupinu subvirových částic [články 3.26 a 3.27 Mezinárodního kódu klasifikace a nomenklatury virů  (anglicky) ].
  2. ↑ Taxonomie virů  na webu Mezinárodního výboru pro taxonomii virů (ICTV) .
  3. ↑ Taxonomie virů  na webu Mezinárodního výboru pro taxonomii virů (ICTV) . (Přístup: 15. července 2016) .

Odkazy