KARTA (doména)

Náborová doména kaspázy

Struktura RAID KARTY. [jeden]
Identifikátory
Symbol KARTU
Pfam PF00619
Interpro IPR001315
CHYTRÝ SM00114
PROSITE PS50209
SCOP 3
NADRODINĚ 3
CDD cd01671
Dostupné proteinové struktury
Pfam struktur
PNR RCSB PNR ; PDBe ; PDBj
PDB součet 3D model

CARD (zkratka z anglického  Caspase recruitment domains nebo Caspase integration and recruitment domains ) - domény aktivace a náboru kaspáz jsou interakční motivy nacházející se v široké škále proteinů, které se obvykle účastní procesů spojených se zánětem a apoptózou . Tyto domény zprostředkovávají tvorbu větších proteinových komplexů prostřednictvím přímých interakcí mezi jednotlivými proteiny obsahujícími CARD. Domény CARD se nacházejí v pozoruhodně široké škále proteinů, včetně helikáz , kináz , mitochondriálních proteinů, kaspáz a dalších cytoplazmatických faktorů.

Klíčové vlastnosti

Domény CARD jsou podtřídou proteinového motivu známého jako záhyb smrti, který obsahuje šest až sedm antiparalelních alfa helixů s hydrofobním jádrem (jádrem) a vnějším povrchem složeným z nabitých aminokyselinových zbytků . Další motivy v této třídě zahrnují pyrinovou doménu (PYD), smrtící doménu (DD) a smrtící efektorovou doménu (DED), z nichž všechny se také primárně podílejí na regulaci apoptózy a zánětlivých reakcí.

Účast na apoptóze

Domény CARD byly dříve charakterizovány aktivací kaspázy a apoptózou [2] . Zdá se, že základní šestišroubovicová struktura oblasti je zachována již u genů ced-3 a ced-4 v C. elegans , organismu, ve kterém bylo poprvé popsáno několik složek apoptotického aparátu. Motivy CARD jsou přítomny v řadě proteinů, které podporují apoptózu, zejména v savčích kaspázách 1, 2, 4, 5 , 9 a 15 .

Účast na zánětech

Seznam proteinů obsahujících CARD

Poznámky

  1. Chou JJ, Matsuo H., Duan H., Wagner G. Struktura řešení karty RAIDD CARD a model interakce CARD/CARD při získávání kaspázy-2 a kaspázy-9  // Cell  :  journal. - Cell Press , 1998. - Červenec ( roč. 94 , č. 2 ). - S. 171-180 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)81417-8 . — PMID 9695946 .
  2. Hofmann K., Bucher P., Tschopp J.  Doména CARD: nový apoptotický signální motiv  // Trends Biochem Sci : deník. - 1997. - Sv. 22 , č. 5 . - S. 155-156 . - doi : 10.1016/S0968-0004(97)01043-8 . — PMID 9175472 .