Náborová doména kaspázy | |
---|---|
| |
Identifikátory | |
Symbol | KARTU |
Pfam | PF00619 |
Interpro | IPR001315 |
CHYTRÝ | SM00114 |
PROSITE | PS50209 |
SCOP | 3 |
NADRODINĚ | 3 |
CDD | cd01671 |
Dostupné proteinové struktury | |
Pfam | struktur |
PNR | RCSB PNR ; PDBe ; PDBj |
PDB součet | 3D model |
CARD (zkratka z anglického Caspase recruitment domains nebo Caspase integration and recruitment domains ) - domény aktivace a náboru kaspáz jsou interakční motivy nacházející se v široké škále proteinů, které se obvykle účastní procesů spojených se zánětem a apoptózou . Tyto domény zprostředkovávají tvorbu větších proteinových komplexů prostřednictvím přímých interakcí mezi jednotlivými proteiny obsahujícími CARD. Domény CARD se nacházejí v pozoruhodně široké škále proteinů, včetně helikáz , kináz , mitochondriálních proteinů, kaspáz a dalších cytoplazmatických faktorů.
Domény CARD jsou podtřídou proteinového motivu známého jako záhyb smrti, který obsahuje šest až sedm antiparalelních alfa helixů s hydrofobním jádrem (jádrem) a vnějším povrchem složeným z nabitých aminokyselinových zbytků . Další motivy v této třídě zahrnují pyrinovou doménu (PYD), smrtící doménu (DD) a smrtící efektorovou doménu (DED), z nichž všechny se také primárně podílejí na regulaci apoptózy a zánětlivých reakcí.
Domény CARD byly dříve charakterizovány aktivací kaspázy a apoptózou [2] . Zdá se, že základní šestišroubovicová struktura oblasti je zachována již u genů ced-3 a ced-4 v C. elegans , organismu, ve kterém bylo poprvé popsáno několik složek apoptotického aparátu. Motivy CARD jsou přítomny v řadě proteinů, které podporují apoptózu, zejména v savčích kaspázách 1, 2, 4, 5 , 9 a 15 .