Kaspáza

Struktura domény kaspázy

Struktura kaspázy 1 (CASP1), původně nazývaná beta-konvertující enzym interleukin-1 (ICE), je první lidskou kaspázou, která byla identifikována. [jeden]
Identifikátory
Symbol Peptidase_C14
Pfam PF00656
klan Pfam CL0093
Interpro IPR002398
PROSITE PS50208
MEROPS C14
SCOP 1 led
NADRODINĚ 1 led
Dostupné proteinové struktury
Pfam struktur
PNR RCSB PNR ; PDBe ; PDBj
PDB součet 3D model

Kaspázy ( anglicky  caspase ; zkr. z angl .  c ysteine ​​dependent asp artate specific prote ase ) jsou proteolytické enzymy patřící do rodiny cysteinových proteáz , které štěpí proteiny výhradně po aspartátu . Kaspázy hrají důležitou roli v procesech apoptózy , nekrózy a zánětu .

Kaspázy se dělí na iniciační, zánětlivé a efektorové (výkonné). Všechny kaspázy jsou zpočátku syntetizovány v neaktivní formě a jsou aktivovány podle potřeby iniciátorovými kaspázami oříznutím malé oblasti. Iniciátorové kaspázy jsou aktivovány složitějším způsobem - speciálními proteinovými komplexy: apoptosomy , PIDD-somy , DISC . Od roku 2009 existuje 11 nebo 12 potvrzených kaspáz u lidí a 10 u myší [poznámka 1] , které vykonávají různé buněčné funkce.

Role těchto enzymů v programované buněčné smrti byla poprvé identifikována v roce 1993 a jejich funkce v apoptóze jsou dobře charakterizovány. Tato forma programované buněčné smrti, která je rozšířená během vývoje a po celý život, slouží k udržení buněčné homeostázy. Aktivace kaspáz zajišťuje řízenou destrukci buněčných komponent, což vede k buněčné smrti s minimálním dopadem na okolní tkáně (bez jejich zapojení do procesu) [3] .

Kaspázy hrají další specifické role v programované buněčné smrti, jako je pyroptóza a nekroptóza. Tyto formy buněčné smrti jsou důležité při ochraně těla před buněčnými stresovými signály a útoky patogenů . Kaspázy také hrají roli při zánětu, přičemž přímo zvyšují zpracování prozánětlivých cytokinů, jako je pro-IL1p. Jsou to signální molekuly, které umožňují nábor imunitních buněk, které napadají infikované buňky nebo tkáně. Existují i ​​další identifikované role kaspáz, jako je buněčná proliferace , suprese nádoru, buněčná diferenciace , neurovývoj , vedení axonů a stárnutí [4] .

Deficit kaspázy byl identifikován jako jedna z příčin rozvoje novotvaru . Růst nádoru může nastat prostřednictvím kombinace faktorů, včetně mutací v genech buněčného cyklu , které odstraňují omezení růstu buněk, v kombinaci s mutacemi v apoptotických proteinech, jako jsou kaspázy, které jsou aktivovány a způsobují smrt abnormálně rostoucích buněk [5] . Naopak nadměrná aktivace některých kaspáz, jako je kaspáza 3, může vést k nadměrné programované buněčné smrti. Tento jev je pozorován u některých neurodegenerativních onemocnění , kdy dochází k nevratnému úbytku nervových buněk, příkladem je Alzheimerova choroba [5] . Kaspázy spojené se zpracováním zánětlivých signálů se také účastní mnoha onemocnění. Nedostatečná aktivace těchto kaspáz může zvýšit náchylnost hostitele k infekci, protože nemusí dojít k odpovídající imunitní odpovědi [5] . Nedílná role kaspáz při buněčné smrti a onemocnění vedla k výzkumu využití enzymů jako cílených léků ( cílená terapie ). Například zánětlivá kaspáza 1 se účastní patogeneze autoimunitních onemocnění; léky, které blokují aktivaci kaspázy 1, byly použity ke zlepšení zdraví pacientů. Kromě toho vědci použili kaspázy jako terapii rakoviny k zabíjení nežádoucích buněk v blastomogenních tkáních [6] .

Funkční klasifikace kaspáz

Většina kaspáz hraje roli v programované buněčné smrti. Jsou shrnuty v tabulce níže. Enzymy se dělí do tří typů: iniciační, efektorové nebo prováděcí a zánětlivé [7] .

Programovaná buněčná smrt Typ kaspázy Enzym Organismus, ve kterém se nacházejí kaspázy
apoptóza iniciační kaspáza 2 muž a myš
kaspáza 8 muž a myš
Kaspáza 9 muž a myš
Kaspáza 10 jen člověk [8]
Provedení kaspáza 3 muž a myš
kaspáza 6 muž a myš
Kaspáza 7 muž a myš
pyroptóza Zánětlivé Kaspáza 1 muž a myš
kaspáza 4 muž [poznámka 2]
kaspáza 5 muž [poznámka 2]
Kaspáza 11 myš [poznámka 2]
Kaspáza 12 myš a někteří lidé [poznámka 1]
Kaspáza 13 jen krávy [10]
Jiná role jiný Caspaza 14 muž a myš

Všimněte si, že kromě apoptózy je kaspáza 8 také nutná k inhibici jiné formy programované buněčné smrti zvané nekroptóza [11] . Kaspáza 14 hraje roli v diferenciaci epiteliálních keratinocytů a může tvořit epidermální bariéru, která chrání před dehydratací (dehydratací) a ultrafialovým zářením [12] .

Aktivace kaspázy

Kaspázy jsou syntetizovány jako neaktivní zymogeny (prokaspázy), které se aktivují pouze po vhodném stimulu. Tato posttranslační úroveň kontroly umožňuje rychlou a pevnou regulaci enzymu.

Aktivace zahrnuje dimerizaci a často oligomerizaci prokaspáz s následným štěpením na dvě podjednotky různých velikostí, velkou a malou. Velká a malá podjednotka se na sebe vážou za vzniku aktivní heterodimerní kaspázy. Aktivní enzym v přírodě často existuje jako heterotetramer, kde se dimer prokaspázy štěpí dohromady za vzniku heterotetrameru [13] .

Dimerizace

Aktivace iniciačních kaspáz a zánětlivých kaspáz je iniciována dimerizací vazbou na adaptorové proteiny s motivy interakce protein-protein, tzv. záhyby smrti . Smrtící záhyby se nacházejí ve strukturální doméně kaspázy známé jako prodoména, která je hojnější v těch kaspázách, které obsahují záhyby smrti, než v těch, které je neobsahují. Prodoména vnitřních iniciačních kaspáz a zánětlivých kaspáz obsahuje jeden záhyb smrti známý jako doména aktivace a náboru kaspázy (zkr. CARD ), zatímco prodoména externích iniciátorových kaspáz obsahuje dva záhyby smrti známé jako doména smrti efektorové domény (zkr. DED).) [14] [15] .

Často se při aktivaci kaspáz tvoří multiproteinové komplexy [13] . Některé aktivované multiproteinové komplexy zahrnují:

Dělení

Po vhodném dimerizačním procesu se kaspázy štěpí v mezidoménových linkerových oblastech za vzniku velké a malé podjednotky. Toto štěpení umožňuje smyčkám aktivního místa zaujmout konformaci příznivou pro enzymatickou aktivitu [16] . Štěpení iniciátorových a efektorových ( exekutorských ) kaspáz probíhá různými způsoby, které jsou popsány v tabulce níže.

iniciátor kaspázy

kaspáza 8

Exekutorská kaspasa

Kaspáza Kaspáza 3

[17]

Některé z rolí, které hrají kaspázy

V apoptóze

Apoptóza je forma programované buněčné smrti, kdy buňka prochází morfologickými změnami, které minimalizují její účinek na okolní buňky, aby se zabránilo vyvolání imunitní reakce. Buňka se smršťuje a kondenzuje – cytoskelet je zničen, jaderný obal je rozebrán a dochází k fragmentaci DNA. To způsobí, že buňky vytvoří uzavřená tělíska nazývaná „vezikuly“, aby se zabránilo uvolňování buněčných složek do extracelulárního prostředí. Kromě toho se mění obsah fosfolipidů v buněčné membráně, což činí umírající buňku náchylnější k fagocytárnímu napadení a využití [18] .

Apoptopické kaspázy se dělí na:

Jakmile dojde k aktivaci iniciačních kaspáz, spustí se řetězová reakce, která vede k aktivaci několika dalších efektorových kaspáz. Exekutorské kaspázy degradují přes 600 buněčných komponent [19] , aby vyvolaly morfologické změny během apoptózy.

Příklady kaspázových kaskád, které se vyskytují během apoptózy:

  1. Signální dráha vnitřní (mitochondriální) apoptózy : Během buněčného stresu se mitochondriální cytochrom c uvolňuje do cytosolu. Tato molekula se váže na adaptorový protein ( APAF-1 ), který rekrutuje iniciační kaspázu 9 (prostřednictvím interakce CARD-CARD). Výsledkem je tvorba kaspázy, která aktivuje multiproteinový komplex zvaný apoptozom . Po aktivaci iniciačních kaspáz, jako je kaspáza 9, dochází ke štěpení a aktivaci dalších efektorových kaspáz. To vede k degradaci buněčných složek během apoptózy.
  2. Vnější signální dráha apoptózy : Kaspázová kaskáda je také aktivována extracelulárními ligandy prostřednictvím receptorů smrti umístěných na buněčném povrchu. Toho je dosaženo prostřednictvím tvorby polyproteinového signálního komplexu smrti (DISC), který rekrutuje a aktivuje prokaspázu. Například FasL ligand se váže na FasR receptor na extracelulárním povrchu receptoru; vazba aktivuje domény smrti v cytoplazmatickém konci receptoru. Adaptérový protein FADD bude získávat (prostřednictvím interakce mezi doménami smrti a doménami smrti) pro-kaspázu 8 prostřednictvím domény DED. Tyto proteiny FasR , FADD a prokaspáza 8 tvoří signální komplex indukující smrt (DISC), ve kterém je aktivována kaspáza 8. 6 a kaspáza 7), určený ke zničení buněčných komponent, jak je znázorněno níže na zobecněném diagramu [20] .

Při pyroptóze

Pyroptóza je forma programované buněčné smrti, která svou povahou vyvolává imunitní odpověď . Je morfologicky odlišná od jiných typů buněčné smrti – buňky bobtnají, praskají a uvolňují prozánětlivý buněčný obsah. K tomu dochází v reakci na řadu podnětů, včetně mikrobiálních infekcí , stejně jako srdečních záchvatů (jako jsou ty, které se vyskytují při infarktu myokardu ) [21] . Kaspáza 1 , kaspáza 4 a kaspáza 5 u lidí a kaspáza 1 a kaspáza 11 u myší hrají důležitou roli při indukci buněčné smrti během pyroptózy. Tento proces omezuje život a dobu proliferace intracelulárních a extracelulárních patogenů.

Zapojení kaspázy 1 do pyroptózy

Aktivace kaspázy 1 je zprostředkována repertoárem proteinů, což umožňuje detekovat řadu patogenních ligandů. Některé mediátory aktivace kaspázy 1 jsou: NOD-like receptory (NLR), AIM2-like receptory ( ALRs) , Pyrin a IFI16 [22] . Tyto proteiny umožňují aktivaci kaspázy 1 vytvořením aktivačního multiproteinového komplexu nazývaného inflammasom .

Například na leucin bohatá repetice podobná NOD, NLRP3, je citlivá na odtok draselných iontů z buňky. Tato buněčná iontová nerovnováha vede k oligomerizaci molekul NLRP3 za vzniku multiproteinového komplexu zvaného NLRP3 inflammasom. Prokaspáza 1 je přivedena do těsné blízkosti jiné molekuly prokaspázy a dochází k další dimerizaci a autoproteolytickému štěpení [22] .

Některé patogenní signály, které vedou k pyroptóze způsobené aktivací kaspázy 1, jsou uvedeny níže:

  • DNA v buněčném cytosolu se váže na receptory podobné AIM2 a způsobuje pyroptózu
  • Aparát bakteriálního sekrečního systému typu III (nacházející se v bakteriích Yersinia , Salmonella a Shigella [23] ) se váže na NOD podobnou repetici bohatou na leucin nazývanou NAIP (NAIP1 u lidí a NAIP4 u myší).
Pyroptóza způsobená aktivací kaspázy 4 a kaspázy 5 u lidí a kaspázy 11 u myší

Tyto kaspázy mají schopnost vyvolat přímou pyroptózu, když molekuly lipopolysacharidu (LPS) (nacházející se v buněčné stěně gramnegativních bakterií ) vstoupí a jsou identifikovány v cytoplazmě hostitelské buňky. Například kaspáza 4 působí jako receptor a je aktivována proteolyticky bez potřeby inflamasomu nebo bez aktivace kaspázy 1 [22] .

Nejdůležitějším downstream substrátem pro pyroptopické kaspázy je gasdermin D (GSDMD) [24] .

Role v zánětu

Zánět je ochranná reakce organismu v důsledku negativního působení škodlivého podnětu, jako je poškození tkáně nebo bakteriální infekce , a je zaměřena na obnovení rovnovážného (normálního) homeostatického stavu [19] .

Kaspáza 1, kaspáza 4, kaspáza 5 a kaspáza 11 jsou považovány za zánětlivé kaspázy [7] .

  • Kaspáza 1 je klíčová v aktivaci prozánětlivých cytokinů; působí jako signály imunitním buňkám a vytvářejí příznivé prostředí pro nábor imunitních buněk v místě poranění. Kaspáza 1 proto hraje zásadní roli ve vrozeném imunitním systému . Enzym je zodpovědný za zpracování cytokinů , jako je pro-ILβ a pro-IL18, a také za jejich sekreci (uvolňování) [22] .
  • Kaspáza 4 a 5 u lidí a kaspáza 11 u myší mají jedinečnou roli jako receptor, pomocí kterého se vážou na LPS, molekulu, která se hojně vyskytuje na buněčných površích gramnegativních bakterií. Vazba může vést ke zpracování a sekreci cytokinů IL-lp a IL-18 aktivací kaspázy 1; tento následný efekt je stejný, jak je popsáno výše. To také vede k sekreci dalšího zánětlivého cytokinu, který není zpracován. Molekula cytokinu se nazývá pro-IL1α. Existují také důkazy o zánětlivé kaspáze podporující sekreci cytokinů kaspázou 11; k procesu dochází inaktivací membránového kanálu, který blokuje sekreci IL-1β [22] .
  • Kaspázy mohou také vyvolat zánětlivou reakci na transkripční úrovni. Existují důkazy, že tato zánětlivá reakce podporuje transkripci nukleárního faktoru-KB ( NF-KB ), transkripčního faktoru , který pomáhá přepisovat zánětlivé cytokiny, jako je IFN , TNF , IL-6 a IL-8. Například kaspáza 1 aktivuje kaspázu 7, která zase štěpí poly(ADP-ribóza)polymerázu , která aktivuje transkripci genů řízených NF-κB [19] .

Objev kaspázy

Robert Horvitz původně stanovil důležitost kaspáz v apoptóze a zjistil, že gen ced-3 je nutný pro buněčnou smrt, ke které došlo během vývoje háďátka C. elegans . Horwitz a kolega Junying Yuan v roce 1993 objevili, že protein kódovaný genem ced-3 je cysteinová proteáza s podobnými vlastnostmi jako savčí enzym konvertující interleukin-1-beta (ICE) (nyní známý jako kaspáza 1). V té době byl ICE jedinou známou kaspázou [25] . Následně byly identifikovány další savčí kaspázy, kromě těch, které se nacházejí v organismech, jako je ovocná muška Drosophila melanogaster .

Vědci se v roce 1996 rozhodli pro nomenklaturu kaspázy. V mnoha případech byla konkrétní kaspáza identifikována současně více než jednou laboratoří; z nichž každý pak dal proteinům jiné jméno. Například kaspáza 3 byla různě známá jako CPP32, apopain a Yama. Proto byly kaspázy očíslovány v pořadí, v jakém byly identifikovány [26] . Proto byl ICE přejmenován na kaspázu 1. ICE byl první savčí kaspázou, která byla charakterizována díky své podobnosti s genem smrti hlístic ced-3, ale zdá se, že hlavní úlohou tohoto enzymu je spíše zprostředkovávat zánět než buněčnou smrt.

Evoluce

U zvířat je apoptóza indukována kaspázami, zatímco u hub a rostlin je apoptóza indukována arginin- a lysin-specifickou kaspázou podobnou proteázou zvanou metakaspáza. Hledání homologie odhalilo blízkou homologii mezi kaspázami a kaspázovými proteiny Reticulomyxa (jednobuněčný organismus). Fylogenetická studie ukazuje, že k divergenci sekvencí kaspáz a metakaspáz došlo před divergenci eukaryot [27] .

Viz také

Literatura

Odkazy

  1. ↑ Wilson KP, Black JA, Thomson JA a kol. Struktura a mechanismus interleukin-1 beta konvertujícího enzymu  (anglicky)  // Nature : journal. - 1994. - Červenec ( roč. 370 , č. 6487 ). - str. 270-275 . - doi : 10.1038/370270a0 . — PMID 8035875 .
  2. ↑ Saleh, Maya; Vaillancourt, John P; Graham, Rona K; Huyck, Matthew; Srinivasula, Srinivasa M; Alnemri, Emad S; Steinberg, Martin H; Nolan, Vikki; Baldwin, Clinton T; Hotchkiss, Richard S; Buchman, Timothy G; Zehnbauer, Barbara A; Hayden, Michael R; Farrer, Lindsay A; Roy, Sophie; Nicholson, Donald W. Diferenciální modulace reakce na endotoxiny polymorfismy lidské kaspázy-12  //  Nature: journal. - 2004. - Sv. 429 , č.p. 6987 . - S. 75-9 . - doi : 10.1038/nature02451 . — PMID 15129283 .
  3. ↑ Rathore, S.; Datta, G.; Kaur, I.; Malhotra, P.; Mohmmed, A. Narušení buněčné homeostázy vyvolává stres organel a spouští apoptózu, jako jsou dráhy buněčné smrti u parazita malárie  (anglicky)  // Cell Death & Disease : journal. - 2015. - 2. července ( roč. 6 , č. 7 ). —P.e1803 . _ - doi : 10.1038/cddis.2015.142 . — PMID 26136076 .
  4. ↑ Shalini, S.; Dorstyn, L.; Dawar, S.; Kumar, S. Staré, nové a vznikající funkce kaspáz  // Cell Death & Differentiation  : journal  . - 2015. - 1. dubna ( roč. 22 , č. 4 ). - str. 526-539 . — ISSN 1350-9047 . - doi : 10.1038/cdd.2014.216 . — PMID 25526085 .
  5. ↑ 1 2 3 Goodsell, David S. The Molecular Perspective: Caspases  //  The Oncologist : journal. - 2000. - 1. října ( ročník 5 , č. 5 ). - str. 435-436 . — ISSN 1083-7159 . - doi : 10.1634/theonkolog.5-5-435 . — PMID 11040280 .
  6. ↑ McIlwain, David R.; Berger, Thorsten; Mak, Tak W. Caspase Functions in Cell Death and Disease  //  Cold Spring Harbor Perspectives in Biology: journal. - 2013. - 1. dubna ( ročník 5 , č. 4 ). — P. a008656 . — ISSN 1943-0264 . - doi : 10.1101/cshperspect.a008656 . — PMID 23545416 .
  7. ↑ 12 Lorenzo ; Galluzzi; Lopez-Soto, Alejandro; Kumar, Šarad; Kroemer, Guido. Kaspázy spojují signalizaci buněčné smrti s organickou homeostázou  (anglicky)  // Imunita : journal. - Cell Press , 2016. - 16. února ( roč. 44 , č. 2 ). - str. 221-231 . — ISSN 1074-7613 . - doi : 10.1016/j.immuni.2016.01.020 . — PMID 26885855 .
  8. ↑ Jänicke, Reiner U.; Sohn, Dennis; Totzke, Gudrun; Schulze-Osthoff, Klaus. Caspase-10 v myši nebo ne? (anglicky)  // Science . - 2006. - Červen ( roč. 312 , č. 5782 ). - S. 1874 . - doi : 10.1126/science.312.5782.1874a . — PMID 16809511 .
  9. ↑ Stowe, Irma; Lee, Bettina; Kayagaki, Nobuhiko. Kaspáza-11: vyzbrojení stráží proti bakteriální infekci  (anglicky)  // Immunological Reviews: journal. - 2015. - Sv. 265 , č.p. 1 . - str. 75-84 . - doi : 10.1111/imr.12292 . — PMID 25879285 .
  10. ↑ Koenig, Ulrich; Eckhart, Leopold; Tschachler, Erwin. Důkaz, že kaspáza-13 není lidský, ale bovinní gen  //  Biochemické a biofyzikální výzkumné sdělení : deník. - 2001. - Sv. 285 , č.p. 5 . - S. 1150-1154 . - doi : 10.1006/bbrc.2001.5315 . — PMID 11478774 .
  11. ↑ Vanden Berghe T., Linkermann A., Jouan-Lanhouet S., Walczak H., Vandenabeele P. Regulated necrosis: the expanding network of non-apoptotic cell death pathways  // Nature Reviews  . Molekulární buněčná biologie  : časopis. - 2014. - únor ( roč. 15 , č. 2 ). - S. 135-147 . doi : 10.1038 / nrm3737 . — PMID 24452471 .
  12. ↑ Denecker, Geertrui; Ovaere, Petra; Vandenabeele, Petr; Declercq, Wim. Kaspáza-14 odhaluje svá tajemství  // The  Journal of Cell Biology : deník. - 2008. - 11. února ( roč. 180 , č. 3 ). - str. 451-458 . — ISSN 0021-9525 . - doi : 10.1083/jcb.200709098 . — PMID 18250198 .
  13. ↑ 12 Shi, Yigong . Caspase Activation  (anglicky)  // Cell  : journal. - Cell Press , 2004. - 25. června ( roč. 117 , č. 7 ). - S. 855-858 . — ISSN 0092-8674 . - doi : 10.1016/j.cell.2004.06.007 . — PMID 15210107 .
  14. ↑ Lahm, Armin; Paradisi, Andrea; Green, Douglas R; Melino, Gerry. Interakce mezi doménami smrti při apoptóze  // Cell Death and Differentiation  : journal  . - 2003. - Sv. 10 , č. 1 . - str. 10-2 . - doi : 10.1038/sj.cdd.4401203 . — PMID 12655289 .
  15. ↑ Kumar, S. Funkce kaspázy v programované buněčné smrti  // Cell Death and Differentiation  : journal  . - 2006. - Sv. 14 , č. 1 . - str. 32-43 . - doi : 10.1038/sj.cdd.4402060 . — PMID 17082813 .
  16. ↑ Riedl, Stefan J.; Shi, Yigong. Molekulární mechanismy regulace kaspáz během apoptózy  // Nature Reviews Molecular Cell Biology  : journal  . - 2004. - Listopad ( ročník 5 , č. 11 ). - S. 897-907 . - doi : 10.1038/nrm1496 . — PMID 15520809 .
  17. ↑ Lavrik, I.; Krueger, A.; Schmitz, I.; Baumann, S.; Weyd, H.; Krammer, P.H.; Kirchhoff, S. Aktivní heterotetramer kaspázy-8 se tvoří na CD95 DISC  //  Cell Death & Differentiation  : journal. - 2003. - 1. ledna ( roč. 10 , č. 1 ). - S. 144-145 . — ISSN 1350-9047 . - doi : 10.1038/sj.cdd.4401156 . — PMID 12655304 .
  18. ↑ Elmore, Susan. Apoptóza: Přehled programované buněčné smrti  //  Toxikologická patologie : deník. - 2007. - 1. června ( roč. 35 , č. 4 ). - str. 495-516 . — ISSN 0192-6233 . - doi : 10.1080/01926230701320337 . — PMID 17562483 .
  19. ↑ 1 2 3 Sollberger, Gabriel; Strittmatter, Gerhard E.; Garstkiewicz, Marta; Sand, Jennifer; Pivo, Hans-Dietmar. Kaspáza-1: Inflammasom a dál  //  Vrozená imunita: časopis. - 2014. - 1. února ( roč. 20 , č. 2 ). - str. 115-125 . — ISSN 1753-4259 . doi : 10.1177 / 1753425913484374 . — PMID 23676582 .
  20. ↑ Creagh, Emma M. Caspase crosstalk: integrace apoptotických a vrozených imunitních signálních drah  //  Trends in Immunology : deník. - Cell Press , 2014. - Prosinec ( roč. 35 , č. 12 ). - S. 631-640 . - doi : 10.1016/j.it.2014.10.004 . — PMID 25457353 .
  21. ↑ Bergsbaken, Tessa; Fink, Susan L.; Cookson, Brad T. Pyroptosis: hostitelská buněčná smrt a zánět  (anglicky)  // Nature Reviews Microbiology  : journal. - 2009. - Sv. 7 , č. 2 . - str. 99-109 . - doi : 10.1038/nrmicro2070 . — PMID 19148178 .
  22. ↑ 1 2 3 4 5 Eldridge, Matthew JG; Shenoy, Avinash R. Antimikrobiální záněty: jednotná signalizace proti různým bakteriálním patogenům  //  Current Opinion in Microbiology: journal. — Elsevier , 2015. — Sv. 23 . - str. 32-41 . - doi : 10.1016/j.mib.2014.10.008 . — PMID 25461570 .
  23. ↑ Green ER , Mecsas J. Bakteriální sekreční systémy: Přehled.  (anglicky)  // Microbiology Spectrum. - 2016. - únor ( díl 4 , č. 1 ). - doi : 10.1128/mikrobiolspec.VMBF-0012-2015 . — PMID 26999395 .
  24. ↑ On, Wan-ting; Wang, Haoqiang; Hu, Lišejník; Chen, Pengda; Wang, Xin; Huang, Zhe; Yang, Zhang-Hua; Zhong, Chuan-Qi; Han, Jiahuai. Gasdermin D je vykonavatelem pyroptózy a je nezbytný pro sekreci interleukinu-1β   // Cell Research : deník. - 2015. - 1. prosince ( roč. 25 , č. 12 ). - S. 1285-1298 . — ISSN 1001-0602 . - doi : 10.1038/cr.2015.139 . — PMID 26611636 .
  25. ↑ Yuan, J. a kol. Gen buněčné smrti C. elegans ced-3 kóduje protein podobný savčímu enzymu konvertujícímu beta interleukin-1  (anglicky)  // Cell  : journal. - Cell Press , 1993. - Sv. 75 , č. 4 . - S. 641-652 . - doi : 10.1016/0092-8674(93)90485-9 . — PMID 8242740 .
  26. ↑ Alnemri ES; Emad S. a kol. Nomenklatura  lidské ICE/CED-3 proteázy  // Buňka . - Cell Press , 1996. - Sv. 87 , č. 2 . — S. 171 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)81334-3 . — PMID 8861900 . Archivováno z originálu 17. prosince 2012.
  27. ↑ Klim, Joanna; Gladki, Arkadiusz; Kucharczyk, Róza; Zielenkiewicz, Urszula; Kacznowski, Szymon. Rekonstrukce stavu předků apoptózy u společného předka eukaryot  // G3  : Geny, genomy, genetika : deník. - 2018. - 27. dubna ( roč. 8 , č. 6 ). - S. 2121-2134 . — ISSN 2160-1836 . - doi : 10.1534/g3.118.200295 . — PMID 29703784 .

Externí odkazy

Poznámky

  1. ↑ 1 2 Funkční CASP12 je exprimován pouze u některých jedinců afrického původu, zatímco jedinci asijského nebo kavkazského původu vyjadřují pouze nefunkční zkrácenou formu. [2]
  2. ↑ 1 2 3 CASP4 a CASP5 jsou považovány za lidské ortology CASP11, který byl nalezen u myší a potkanů, ale ne u lidí. [9]
  Přejděte na položku Wikidata  Slovníky a encyklopedie
 Proteázy : Cysteinové (thiolové) proteázy ( EC 3.4.22)
Kalpain
  • CAPN1
  • CAPN2
  • CAPN3
  • CAPN5
  • CAPN6
  • CAPN7
  • CAPN8
  • CAPN9
  • CAPN10
  • CAPN11
  • CAPN12
  • CAPN13
  • CAPN14
  • CAPNS1
  • CAPNS2
kaspáza
katepsin
Pochází z rostlin
(ovoce)
Odpočinek
  • Clostripain
  • Autofagin