HRY (USA)

Aktuální verze stránky ještě nebyla zkontrolována zkušenými přispěvateli a může se výrazně lišit od verze recenzované 4. prosince 2019; kontroly vyžadují 3 úpravy .
HRY
Typ Software pro výpočetní chemii
Vývojář Iowa State University Quantum Chemistry Group
Zapsáno v Fortran
Operační systém Linux , FreeBSD , Unix a operační systémy podobné UNIXu , Microsoft Windows , Mac OS X
Nejnovější verze 20130501.1 ( 1. května 2013 )
Licence bezplatnou licenci
webová stránka msg.chem.iastate.edu/gam…

GAMESS (US) je program balíku výpočetní kvantové chemie. [1] [2] [3] Zkratka znamená G general A tomic and Molecular Electronic S structure S ystem . Vývoj původního kódu začal v roce 1977 jako součást projektu National Resources for Computations in Chemistry [4] . V roce 1981 se objevily dvě stabilní větve GAMESS: GAMESS (USA) a GAMESS (UK) , od té doby se vyvíjejí samostatně a dnes se tyto dva programy poměrně výrazně liší. Projekt GAMESS podporují členové Gordon Research Group na Iowa State University.

Funkce

Souhrnná tabulka pro řadu základních funkcí GAMESS
(C - ukládání integrálů, D - přímý výpočet AO integrálů , p - paralelní provádění, F - použití fragmentovaných MO)
SCFTYP= RHF ROHF UHF GVB MCSCF
Energie CDpF CDp CDp CDp CDpF
Analytický gradient CDpF CDp CDp CDp CDpF
Numerické hesenské CDpF CDp CDp CDp CDp
Analytický hesián CDp CDp - CDp CDp
energie MP2 CDpF CDp CDp - CDp
Přechod MP2 CDpF Dp CDp - -
CI energie CDp CDp - CDp CDp
Gradient CI CD - - - -
CC energie CDpF - - - -
Energie EOM CD - - - -
DFT energie CDpF CDp CDp - -
gradient dft CDpF CDp CDp - -
energie MOPAC Ano Ano Ano Ano -
Přechod MOPAC Ano Ano Ano - -

GAMESS (US) je schopen provádět výpočty MO pomocí mnoha metod výpočetní kvantové chemie, včetně Hartree-Fockovy metody , teorie funkcionálních funkcí hustoty (DFT), teorie valenčních vazeb (GVB) a multikonfiguračního samokonzistentního pole (MCSCF). Korekci elektronové korelační energie po proceduře autokonzistence lze provést pomocí konfigurační interakce (CI), Möller-Plessetovy perturbační teorie druhého řádu . Rozpouštědlový efekt lze zohlednit v rámci modelů SCRF, PCM nebo modelovat pomocí tzv. „účinné fragmenty“. Relativistické korekce lze také zohlednit pomocí různých metod, jako je Douglas-Krollova aproximace třetího řádu.

Vzhledem k tomu , že molekulární mechanika není v programu implementována, kombinované výpočty používají k výpočtu mechanické části balíček TINKER . Metodu fragmentárního MO lze použít k výpočtu velkých systémů jejich rozdělením na „fragmenty“.

Vztah s jinými programy

GAMESS uloží výpočet do textového souboru speciálního formátu. Souřadnice uložené v tomto souboru mohou být transformovány programem OpenBabel . Molekulární orbitaly lze vizualizovat pomocí programů jako Molekel nebo wxMacMolPlt . 

Kompatibilita a dostupnost

US GAMESS běží na všech operačních systémech kompatibilních s POSIX , OS X a Windows. Binární balíčky pro Mac OS X , MacOS 7-9 a Microsoft Windows jsou k dispozici na oficiálních stránkách . Sun Solaris UltraSPARC / x86 / x86-64 , IBM BlueGene , AIX POWER / PowerPC , Linux x86/x86-64, Cray X1/XT Unicos , Fujitsu PrimePower Solaris , HP PA-RISC /x86 HP-UX a NEC SUPER platformy jsou také podporované -UX [5] .

Zdrojový kód US GAMESS je distribuován zdarma za podmínky nekomerčního použití programu.

Viz také

Poznámky

  1. Computational Chemistry , David Young, Wiley-Interscience, 2001. Příloha AA2.3 str. 334, GAMESS
  2. M. W. Schmidt a kol. General Atomic and Molecular Electronic Structure System  (anglicky)  // J. Compput. Chem. : deník. - 1993. - Sv. 14 . - S. 1347-1363 . - doi : 10.1002/jcc.540141112 .
  3. MS Gordon a MW Schmidt, Pokroky v teorii elektronové struktury: GAMESS o dekádu později , v Theory and Applications of Computational Chemistry, prvních 40 let , CE Dykstra, G. Frenking. KS Lim a GE Scusaria, Elsevier, Amsterdam, 2005.
  4. Gordon Research Group. GAMESS Manuál (Úvod) . Získáno 15. listopadu 2021. Archivováno z originálu dne 29. března 2012.
  5. GAMESS Registrace: stáhnout . Získáno 14. února 2010. Archivováno z originálu 27. února 2010.

Externí odkazy