Očistné klystýry se provádějí s cílem očistit a propláchnout tlusté střevo , odstranit zácpu nebo fekální obstrukci, léčit jakoukoli otravu nebo intoxikaci, před některými chirurgickými operacemi, porodem. Na rozdíl od léčivých a nutričních klystýrů je u čistících klystýrů vstřikovaný roztok zpočátku určen k erupci a jeho vstřebávání je nežádoucí.
Tekutina zaváděná řitním otvorem do konečníku působí mechanicky a tepelně na střeva, zlepšuje peristaltiku střev a uvolňuje stolici .
Teplota vstřikované kapaliny závisí na účelu: