Protaminy jsou nízkomolekulární základní proteiny v jádrech spermií většiny skupin zvířat. Tvoří frakci hlavního proteinu ve spermatu zralých ryb .
Protaminy slouží k uspořádání chromatinu v jádrech spermií a nahrazují v něm histony .
V jádrech somatických buněk a vajíček je DNA spojena s histony . Chromatin prekurzorů spermií, spermatogonie , obsahuje bazické histony spojené s kyselou DNA, avšak během spermatogeneze ve stadiu spermatid jsou histony odstraněny z jádra a DNA je vázána protaminy za vzniku nukleoprotaminů .
To umožňuje chromatinu mnohem hustěji kondenzovat a zmenšit velikost jádra spermie. Na rozdíl od chromatinu s účastí histonů je chromatin s účastí protaminů neaktivní - v jádře spermií nejsou možné transkripční procesy .
Molekulová hmotnost protaminů je 4-12 kDa , rybí protaminy obsahují až 35 aminokyselinových zbytků, protaminy ptáků a savců - nejčastěji 50-60 aminokyselinových zbytků. Protaminy bezobratlých jsou stále špatně pochopeny, ale je známo, že protaminy měkkýšů, na rozdíl od protaminů obratlovců, které obsahují velké množství (u některých ryb až 90 %) argininu, obsahují také významné množství lysinu . Charakteristickým rysem složení savčích protaminů je poměrně vysoký obsah cysteinu (s obsahem argininu 47-61%), což vede k tvorbě disulfidových můstků se síťováním monomerních protaminů.
U kostnatých ryb jsou protaminy zastoupeny velkým množstvím forem - např . u pstruhů bylo nalezeno šest různých protaminů s blízkou sekvencí aminokyselin .
Protaminy spermií většiny druhů savců jsou reprezentovány jedinou formou P1, v délce od 35 (opice Semnopithecus priam ) do 69 ( possum Pseudochirops cupreus ) aminokyselinových zbytků [1] , jedinou výjimkou jsou v současnosti lidé a myši, které syntetizují protaminové formy - krátký P1 (51 aminokyselinových zbytků u obou druhů) a dlouhý P2 (102, resp. 107 zbytků). Lidský i myší protamin P2 prochází posttranslační modifikací , štěpením na fragmenty [2] , [3] s následným zesítěním s disulfidovými můstky na cysteinových zbytcích.
Přitom téměř všichni savci mají oba geny kódující protaminy P1 a P2, ale gen P2 je exprimován slabě [4]
Aminokyselinová sekvence lidského protaminu P1 [5]
disulfidové můstky:
Aminokyselinová sekvence lidského protaminu P2 [6]
10 20 30 40 50 MVRYRVRSLS ERSHEVYRQQ LHGQEQGHHG QEEQGLSPEH VEVYERTHGQ 60 70 80 90 100 SHYRRRHCSR RRLHRIHRRQ HRSCRRRKRR SCRHRRRHRR GCRTRKRTCR RH ![]() |
---|