Hammerhead ribozym

Hammerhead ribozymy  jsou malé samořezné RNA , které mají konzervovanou sekvenci a nacházejí se v některých viroidech a jsou spojeny se satelitními RNA některých rostlinných virů . [2]

Hammerhead ribozymy byly poprvé objeveny v rostlinných viroidech ; takové ribozymy katalyzovaly sekvenčně specifické štěpení fosfodiesterových vazeb v molekulách RNA díky své specifické terciární struktuře . [3] [4] Sekundární konstrukce připomíná hlavu kladiva .  kladivoun .

Vlastní replikace

Tento ribozym je schopen sebereplikace. Replikace probíhá jako rotující kolo [5] . RNA je vroubkovaná v počátečním bodě valivého kruhu. Volné deoxynukleotidy se začnou vázat na uvolněný 3'-konec tohoto řetězce. Jak se dceřiné vlákno RNA prodlužuje, 5' konec je vytěsněn z rodičovského kruhu. Když se 3' a 5' konce setkají ve stejném bodě, syntéza RNA se zastaví a dceřiný kruh se oddělí od mateřského kruhu.

Odkazy

• Sekundární struktura Hammerhead ribozymu . Wiki virtuální laboratoře . - (Snímky). Staženo: 2009-15-10. Archivováno z originálu 19. března 2012. (Ruština)

• O nevýznamnosti energetického odhadu při modelování RNA - studie na Wikiversity o modelování terciární struktury pomocí kladívkového ribozymu jako příkladu

• Terciární struktura viroidního ribozymu chrysanthemum chlorotic mottle viroidního organismu, předpovězená pomocí softwaru RNAInSpace na YouTube Borisov, S.S. Jakovlev. Aplikace teorie her na problém skládání ribonukleové kyseliny . (Ruština)

• Modelová trajektorie skládání viroidního ribozymu organismu Chrysanthemum chlorotic mottle viroid, předpovězená pomocí softwaru RNAInSpace na YouTube Borisov, S.S. Jakovlev. Aplikace teorie her na problém skládání ribonukleové kyseliny . (Ruština)

Viz také

• Ribozym obsahující vlásenku
• Počáteční bod replikace
• Spojování

Poznámky

1. ↑ Martick M., Scott WG Terciální kontakty vzdálené od aktivního místa připravují ribozym pro katalýzu  // Buňka  :  časopis. - Cell Press , 2006. - Vol. 126 , č.p. 2 . - S. 309-320 . - doi : 10.1016/j.cell.2006.06.036 . — PMID 16859740 .
2. ↑ Forster AC, Symons RH Samoštěpení plus a mínus RNA viroidu a strukturální model pro aktivní místa  // Buňka  :  časopis. - Cell Press , 1987. - Sv. 49 , č. 2 . - str. 211-220 .
3. ↑ Prody GA, Bakos JT, Buzayan JM, Schneider IR, Bruening G. Autolytic Processing of Dimeric Plant Virus Satellite RNA  //  Science : journal. - 1986. - Sv. 231 , č.p. 4745 . - S. 1577-1580 . - doi : 10.1126/science.231.4745.1577 .
4. ↑ Hutchins CJ, Rathjen PD, Forster AC, Symons RH Samoštěpení plus a minus RNA transkriptů avokádového viroidu sunblotch  // Nucleic Acids Res  . : deník. - 1986. - Sv. 14 , č. 9 . - S. 3627-3640 .
5. ↑ Flores R, Navarro JA, de la Peña M, Navarro B, Ambrós S, Vera A. Viroidy s ribozymy kladivouna: některé jedinečné strukturální a funkční aspekty s ohledem na ostatní členy skupiny  // Biol. Chem.. - 1999. - T. 380 , č. 7-8 . - S. 849-854 .