Translokázy jsou samostatnou třídou enzymů , které katalyzují přenos iontů nebo molekul přes membrány nebo jejich separaci v membránách. Tato třída enzymů byla vytvořena z dříve náležejících k jiným třídám enzymů. [jeden]
ATP syntáza - dříve enzym patřil do třetí třídy a byl pojmenován podle nomenklatury - ATP fosfohydroláza, ale název neodpovídá povaze enzymu, protože k hydrolýze ATP prakticky nedochází.
Pro enzymy přesunuté do třídy translokáz zůstaly zachovány dřívější systematické názvy.
Enzymy 7. třídy katalyzují přenos molekul nebo iontů přes membrány ve spojení s dalšími reakcemi.
Například při přenosu protonů z mitochondriální matrice do mezimembránového prostoru přes komplex I elektronového transportního řetězce (7.1.1.2) je ubichinon redukován na ubichinol a reakce je popsána následujícím schématem [2] :
NADH + CoQ + 6H + [ strana 1 ] = NAD + + CoQH 2 + 7H + [ strana 2 ]Druhým příkladem je ATP syntáza , která katalyzuje reakci přenosu protonů z mezimembránového prostoru mitochondrie do matrice za vzniku molekuly ATP z ADP a anorganického fosfátu, reakce je popsána schématem [3] :
ADP + Ph n + 4 H + [strana 1] → ATP + H20 + 4 H + [strana 2]Enzymy si zachovaly systematické názvy označující jejich bývalou třídu.
V závislosti na transportovaných iontech nebo molekulách v sedmé třídě se rozlišuje šest podtříd.
EC 7.1 - enzymy, které katalyzují translokaci protonů vodíku H + ;
EC 7.2 - enzymy, které katalyzují translokaci anorganických kationtů a jejich chelátů;
EC 7.3 - enzymy katalyzující translokaci anorganických aniontů;
EC 7.4 - enzymy, které katalyzují translokaci aminokyselin a peptidů;
EC 7.5 - enzymy, které katalyzují translokaci sacharidů a jejich derivátů;
EC 7.6 - enzymy, které katalyzují translokaci jiných sloučenin.
Rozdělení do podtříd je založeno na reakcích, které poskytují hnací sílu pro translokaci:
EC 7._.1 - enzymy, které katalyzují translokační reakce spojené s redoxními reakcemi;
EC 7._.2 - enzymy, které katalyzují translokační reakce spojené s hydrolýzou nukleosidtrifosfátu;
EC 7._.3 - enzymy katalyzující translokační reakce spojené s hydrolýzou difosfátů;
EC 7._.4 - enzymy, které katalyzují translokační reakce spojené s dekarboxylační reakcí.
Enzymy této třídy nezahrnují kanály (póry), které mění konformaci mezi otevřeným a uzavřeným stavem v reakci na jakoukoli akci, stejně jako transportéry, které nejsou závislé na reakcích katalyzovaných enzymem.
Kromě již popsané ATP syntázy a komplexu NADH dehydrogenázy zahrnuje sedmá třída enzymů:
Chinol: ferricytochrom c - oxidoreduktáza (EC 7.1.1.8 ), enzym často označovaný jako komplex cytochromu bc 1 nebo komplex III, je třetím komplexem v řetězci transportu elektronů. Je přítomen v mitochondriích všech aerobních eukaryot a ve vnitřních membránách většiny bakterií.
Cytochrom c oxidáza (EC 7.1.1.9 ) nebo komplex IV elektronového transportního řetězce je koncová oxidáza aerobního respiračního elektronového transportního řetězce, která katalyzuje přenos elektronů z cytochromu c na kyslík za vzniku vody .
Na + /K + -výměnná ATPáza (EC 7.2.2.13 ) je enzym plazmatické membrány, všudypřítomný v živočišných buňkách, který katalyzuje odtok tří Na + a přítok dvou K + do hydrolyzovaného ATP. Podílí se na vytváření elektrického potenciálu plazmatické membrány.
H + / K + -výměnná ATPáza (EC 7.2.2.19 ) je enzym žaludeční sliznice, který katalyzuje odtok jednoho H + a přítok jednoho K + v důsledku hydrolýzy ATP.
Transportéry polárních aminokyselin (EC 7.4.2.1 ), nepolárních aminokyselin (EC 7.4.2.2 ), mitochondriálního proteinu (EC 7.4.2.3 ), využívající k transportu hydrolýzu ATP.
Xenobiotický nosič (EC 7.6.2.2 ) - enzymy grampozitivních bakterií a eukaryotických buněk exportují řadu léčiv s neobvyklou specifitou, pokrývají různé skupiny nepříbuzných látek, přičemž ignorují některé látky, které jsou strukturou blízce příbuzné. V jedné eukaryotické buňce může být přítomno několik různých enzymů. Mnohé z nich také transportují konjugáty glutathion-lék (viz EC 7.6.2.3 , transportér glutathion- S -konjugátu typu ABC ), zatímco jiné také vykazují určitou aktivitu "flippasy".
Acyl-CoA transportér (EC 7.6.2.4 ) je živočišný a kvasinkový enzym, který transportuje acyl-CoA mastné kyseliny do az peroxisomů. U lidí je spojován se Zellwegerovým syndromem .