Betropin 1

Betropin-1 je protein , který je u lidí kódován genem BEST1 . [1] [2] [3] Může souviset s vitiliformní makulární degenerací .

Funkce

BEST1 patří do rodiny aniontových kanálů aktivovaných vápníkem bez obsahu tropinu, která zahrnuje BEST2, BEST3 a BEST4. Bestropiny jsou transmembránové (TM) proteiny, které sdílejí homologní oblast s vysokým obsahem aromatických zbytků, včetně invariantního motivu Arg-Phe-Pro (RFP). Předpokládá se, že betropiny působí jako chloridové kanály , které mohou také sloužit jako regulátory intracelulární vápníkové signalizace. [čtyři]

Bylo prokázáno, že betropin 1 je propustný pro chlorid, thiokyanát , bikarbonát , glutamát a GABA . Betropin 1 zprostředkovává uvolňování GABA, nedávno se ukázalo, že je zodpovědný za tonickou inhibici v buňkách cerebellum granule [ 5] a byl spojován s patologií Alzheimerovy choroby . [6]

Struktura genu

V betropinu sdílejí geny konzervovanou genovou strukturu s téměř jednotně velkými 8 exony kódovanými doménou RFP-TM a vysoce konzervovanými hranicemi exon-intron. Každý ze 4 besttropinových genů má 3 primární jedinečné konce různé délky. [3] [7] [8]

Ve dvou nezávislých studiích bylo prokázáno, že BEST1 reguluje transkripční faktor spojený s mikroftalmií. [9] [10]

Interakce

Bylo prokázáno, že Betropin 1 interaguje s PPP2CA. [jedenáct]

Antagonisté

• Verteporfin [12]

Poznámky

1. ↑ Stone EM, Nichols BE, Streb LM, Kimura AE, Sheffield VC Genetická vazba vitelliformní makulární degenerace (Bestova choroba ) na chromozom 11q13   // Nature Genetics  : časopis. - 1993. - Červen ( roč. 1 , č. 4 ). - S. 246-250 . - doi : 10.1038/ng0792-246 . — PMID 1302019 .
2. ↑ Barro Soria R., Spitzner M., Schreiber R., Kunzelmann K. Bestrophin 1 umožňuje Ca 2+ aktivovaný Cl − vodivost v epitelu  (anglicky)  // Journal of Biological Chemistry  : journal. - 2006. - září ( roč. 284 , č. 43 ). - S. 29405-29412 . - doi : 10.1074/jbc.M605716200 . — PMID 17003041 .
3. ↑ 1 2 Entrez Gen: BEST1 bestrophin 1 . Archivováno z originálu 6. března 2010. (neurčitý)
4. ↑ Hartzell HC, Qu Z., Yu K., Xiao Q., Chien LT Molekulární fyziologie bestrofinů: multifunkční membránové proteiny spojené s nejlepší chorobou a jinými retinopatiemi  //  Fyziologické přehledy : deník. - 2008. - Duben ( roč. 88 , č. 2 ). - S. 639-672 . - doi : 10.1152/physrev.00022.2007 . — PMID 18391176 .
5. ↑ Lee S., Yoon BE, Berglund K., Oh SJ, Park H., Shin HS, Augustine GJ, Lee CJ Channel-mediated tonic GABA release from glia   // Science . - 2010. - Listopad ( roč. 330 , č. 6005 ). - str. 790-796 . - doi : 10.1126/science.1184334 . — PMID 20929730 .
6. ↑ Jo Seonmi , Yarishkin Oleg , Hwang Yu Jin , Chun Ye Eun , Park Mijeong , Woo Dong Ho , Bae Jin Young , Kim Taekeun , Lee Jaekwang , Chun Heejung , Park Hyun Jung , Lee Da Yong , Hong Jinpyo , Kim Hye Yun Oh Soo-Jin , Park Seung Ju , Lee Hyo , Yoon Bo-Eun , Kim YoungSoo , Jeong Yong , Shim Insop , Bae Yong Chul , Cho Jeiwon , Kowall Neil W , Ryu Hoon , Hwang Eunmi , Kim Daesoo , Lee C Justin. GABA z reaktivních astrocytů zhoršuje paměť u myších modelů Alzheimerovy choroby  // Nature Medicine. - 2014. - 29. června ( roč. 20 , č. 8 ). - S. 886-896 . — ISSN 1078-8956 . - doi : 10,1038/nm.3639 .
7. ↑ Stöhr H., Marquardt A., Nanda I., Schmid M., Weber BH Tři nové lidské geny podobné VMD2 jsou členy evoluční vysoce konzervované rodiny RFP-TM  //  European Journal of Human Genetics : deník. - 2002. - Duben ( roč. 10 , č. 4 ). - str. 281-284 . - doi : 10.1038/sj.ejhg.5200796 . — PMID 12032738 .
8. ↑ Tsunenari T., Sun H., Williams J., Cahill H., Smallwood P., Yau KW, Nathans J. Strukturně-funkční analýza bestrofinové rodiny aniontových kanálů  //  Journal of Biological Chemistry  : journal . - 2003. - říjen ( roč. 278 , č. 42 ). - S. 41114-41125 . - doi : 10.1074/jbc.M306150200 . — PMID 12907679 .
9. ↑ Esumi N., Kachi S., Campochiaro PA, Zack DJ VMD2 promotor vyžaduje pro svou aktivitu in vivo dvě proximální místa E-boxu a je regulován rodinou MITF-TFE  //  Journal of Biological Chemistry  : journal. - 2007. - Sv. 282 , č.p. 3 . - S. 1838-1850 . - doi : 10.1074/jbc.M609517200 . — PMID 17085443 .
10. ↑ Hoek KS, Schlegel NC, Eichhoff OM, Widmer DS, Praetorius C., Einarsson SO, Valgeirsdottir S., Bergsteinsdottir K., Schepsky A., Dummer R., Steingrimsson E. Nové cíle MITF identifikované pomocí dvoukrokového DNA microarray strategie  //  Pigment Cell & Melanoma Research : deník. - 2008. - Sv. 21 , č. 6 . - str. 665-676 . - doi : 10.1111/j.1755-148X.2008.00505.x . — PMID 19067971 .
11. ↑ Marmorstein LY, McLaughlin PJ, Stanton JB, Yan L., Crabb JW, Marmorstein AD Bestrophin fyzikálně a funkčně interaguje s protein fosfatázou 2A  //  Journal of Biological Chemistry  : journal. - 2002. - Sv. 277 , č.p. 34 . - S. 30591-30597 . - doi : 10.1074/jbc.M204269200 . — PMID 12058047 .
12. ↑ Rao P.R. Identifikace nových selektivních antagonistů pro protein Bestophin-1 pomocí homologního modelování a molekulárního dokování. International Journal of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences 2012; 4(S4):195-200. . Datum přístupu: 17. ledna 2015. Archivováno z originálu 14. července 2014. (neurčitý)

Literatura

• White K., Marquardt A., Weber BH VMD2 mutace u vitelliformní makulární dystrofie (Best disease) a dalších makulopatií  //  Lidská mutace : deník. - 2000. - Sv. 15 , č. 4 . - S. 301-308 . - doi : 10.1002/(SICI)1098-1004(200004)15:4<301::AID-HUMU1>3.0.CO;2-N . — PMID 10737974 .
• Nordström S., Barkman Y. Hereditární makulární degenerace (HMD) ve 246 případech vysledována k jednomu genovému zdroji ve středním Švédsku  //  Hereditas : deník. - 1977. - Sv. 84 , č. 2 . - S. 163-176 . - doi : 10.1111/j.1601-5223.1977.tb01394.x . — PMID 838599 .
• Forsman K., Graff C., Nordström S., a kol. Gen pro Bestovu makulární dystrofii se nachází na 11q13 ve švédské  rodině  // Genetika : deník. — Genetic Society of America, 1992. - Sv. 42 , č. 3 . - S. 156-159 . - doi : 10.1111/j.1399-0004.1992.tb03229.x . — PMID 1395087 .
• Stöhr H., Marquardt A., Rivera A. a kol. Genová mapa oblasti Bestovy viteliformní makulární dystrofie v chromozomu 11q12-q13.1   // Genome Research : deník. - 1998. - Sv. 8 , č. 1 . - str. 48-56 . - doi : 10.1101/gr.8.1.48 . — PMID 9445487 .
• Petrukhin K., Koisti MJ, Bakall B. a kol. Identifikace genu zodpovědného za Best makulární dystrofii  (anglicky)  // Nature Genetics  : journal. - 1998. - Sv. 19 , č. 3 . - str. 241-247 . - doi : 10.1038/915 . — PMID 9662395 .
• Pennisi E. Nalezen nový gen pro dědičnou makulární degeneraci  (anglicky)  // Science. - 1998. - Sv. 281 , č.p. 5373 . — S. 31 . - doi : 10.1126/science.281.5373.31 . — PMID 9679014 .
• Marquardt A., Stöhr H., Passmore LA a kol. Mutace v novém genu, VMD2, kódujícím protein neznámých vlastností způsobují juvenilní viteliformní makulární dystrofii (Bestova choroba  )  // Human Molecular Genetics : deník. - Oxford University Press , 1998. - Sv. 7 , č. 9 . - S. 1517-1525 . - doi : 10.1093/hmg/7.9.1517 . — PMID 9700209 .
• Caldwell GM, Kakuk LE, Griesinger IB a kol. Mutace genu pro bestophin u pacientů s Best vitelliformní makulární dystrofií  (anglicky)  // Genomics  : journal. - Academic Press , 1999. - Sv. 58 , č. 1 . - S. 98-101 . doi : 10.1006 / geno.1999.5808 . — PMID 10331951 .
• Bakall B., Marknell T., Ingvast S. a kol. Mutační spektrum bestrofinového proteinu – funkční důsledky  // Human Genetics  : journal  . - 1999. - Sv. 104 , č. 5 . - str. 383-389 . - doi : 10.1007/s004390050972 . — PMID 10394929 .
• Allikmets R., Seddon JM, Bernstein PS, a kol. Hodnocení nejlepšího genu onemocnění u pacientů s věkem podmíněnou makulární degenerací a jinými makulopatiemi  (anglicky)  // Human Genetics  : journal. - 1999. - Sv. 104 , č. 6 . - str. 449-453 . - doi : 10.1007/s004390050986 . — PMID 10453731 .
• Palomba G., Rozzo C., Angius A. a kol. Nová spontánní missense mutace v genu VMD2 je příčinou nejlepšího sporadického případu makulární dystrofie  // American  Journal of Ophthalmology : deník. - 2000. - Sv. 129 , č. 2 . - str. 260-262 . - doi : 10.1016/S0002-9394(99)00327-X . — PMID 10682987 .
• Loterie AJ, Namperumalsamy P , Jacobson SG, et al. Mutační analýza 3 genů u pacientů s Leberovou kongenitální amaurózou   // JAMA Oftalmologie : deník. - 2000. - Sv. 118 , č. 4 . - str. 538-543 . - doi : 10.1001/archopht.118.4.538 . — PMID 10766140 .
• Loterie AJ, Munier FL, Fishman GA a kol. Alelické variace v genu VMD2 u nejlepších onemocnění a věkem podmíněné makulární degenerace  // Investigativní  oftalmologie a vizuální věda : deník. - 2000. - Sv. 41 , č. 6 . - S. 1291-1296 . — PMID 10798642 .
• Krämer F., White K., Pauleikhoff D., a kol. Mutace v genu VMD2 jsou spojeny s juvenilní vitelliformní makulární dystrofií (Best disease) a dospělou viteliformní makulární dystrofií, ale ne s věkem podmíněnou makulární degenerací  // European Journal of Human  Genetics : deník. - 2000. - Sv. 8 , č. 4 . - str. 286-292 . - doi : 10.1038/sj.ejhg.5200447 . — PMID 10854112 .
• Marmorstein AD, Marmorstein LY, Rayborn M. a kol. Bestophin, produkt genu Best vitelliformní makulární dystrofie (VMD2), se lokalizuje na bazolaterální plazmatické membráně retinálního pigmentového epitelu  (anglicky)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal. - 2001. - Sv. 97 , č. 23 . - S. 12758-12763 . - doi : 10.1073/pnas.220402097 . — PMID 11050159 .
• Marchant D., Gogat K., Boutboul S. a kol. Identifikace nových mutací genu VMD2 u pacientů s nejlepší vitelliformní makulární dystrofií   // Human Mutation : deník. - 2001. - Sv. 17 , č. 3 . — S. 235 . doi : 10.1002 / humu.9 . — PMID 11241846 .
• Eksandh L., Bakall B., Bauer B. a kol. Bestova viteliformní makulární dystrofie způsobená novou mutací (Val89Ala) v genu VMD2  //  Oftalmický genet. : deník. - 2001. - Sv. 22 , č. 2 . - str. 107-115 . - doi : 10.1076/opge.22.2.107.2226 . — PMID 11449320 .
• Sun H., Tsunenari T., Yau KW, Nathans J.  Protein viteliformní makulární dystrofie definuje novou rodinu chloridových kanálů  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal. - 2002. - Sv. 99 , č. 6 . - S. 4008-4013 . - doi : 10.1073/pnas.052692999 . — PMID 11904445 .
• Xiao Q., Yu K., Cui YY, Hartzell HC Dysregulation of human bestrophin-1 by ceramide-ducted dephosphorylation  (anglicky)  // J Physiol. : deník. - 2009. - Sv. 587 , č.p. 18 . - str. 4379-4391 . doi : 10.1113 / jphysiol.2009.176800 . — PMID 19635817 .
• Xiao Q., Prussia A., Yu K., Cui YY, Hartzell HC Regulace bestrofinových Cl kanálů vápníkem: role C konce  (anglicky)  // J Gen Physiol. : deník. - 2008. - Sv. 132 , č.p. 6 . - str. 681-692 . - doi : 10.1085/jgp.200810056 . — PMID 19029375 .

Slovníky a encyklopedie	Britannica (online)