Bromodoména

Bromodoména  je vysoce konzervovaná proteinová doména s přibližně 110 aminokyselinovými zbytky , která specificky váže ε-aminoacetylové skupiny lysinových zbytků v proteinech . Bromodoména se skládá ze 4 α-helixů uspořádaných do levotočivého svazku. K rozpoznání acetyllysinu dochází prostřednictvím dvou konzervovaných smyček, ZA a BC [1] .

Podle předběžných odhadů kóduje lidský genom 61 bromodomén ve 46 proteinech [2] . Bromodomény byly nalezeny v členech superrodiny DNA helikáz , stejně jako v proteinech zapojených do modifikace histonů a remodelace chromatinu , jako jsou histon acetyltransferázy [1] .

Jsou známy savčí proteiny , které obsahují dvojité bromodomény: jedná se o proteiny BET ( bromodoména a extraterminální doména ) rodiny BRD2, BRD3 a BRD4 . V kvasinkách a rostlinách nebyly dosud nalezeny proteiny se dvěma bromodoménami [1] .  

Poznámky

1. ↑ 1 2 3 Belkina AC , Denis GV BET doménové koregulátory u obezity, zánětu a rakoviny.  (anglicky)  // Recenze přírody. rakovina. - 2012. - Sv. 12, č. 7 . - S. 465-477. doi : 10.1038 / nrc3256 . — PMID 22722403 .
2. ↑ Filippakopoulos P. , Picaud S. , Mangos M. , Keates T. , Lambert JP , Barsyte-Lovejoy D. , Felletar I. , Volkmer R. , Müller S. , Pawson T. , Gingras AC , Arrowsmith S CH , Knapp Rozpoznání histonů a rozsáhlá strukturální analýza rodiny lidských bromodomén  . (anglicky)  // Cell. - 2012. - Sv. 149, č.p. 1 . - S. 214-231. - doi : 10.1016/j.cell.2012.02.013 . — PMID 22464331 .