Proteinová doména je prvkem terciární struktury proteinu , což je poměrně stabilní a nezávislá substruktura proteinu, jejíž skládání probíhá nezávisle na zbývajících částech. Doména obvykle obsahuje několik prvků sekundární struktury . Domény podobné strukturou se nacházejí nejen v příbuzných proteinech (například v hemoglobinech různých zvířat), ale také ve zcela odlišných proteinech.
Poměrně často jsou doménám přiřazena samostatná jména, protože jejich přítomnost přímo ovlivňuje biologické funkce vykonávané proteinem - například kalmodulin Ca2 + - vazebná doména , homeodoména , zodpovědná za vazbu na DNA v různých transkripčních faktorech atd.
Vzhledem k tomu, že domény jsou zcela „autonomní“ ve formování své struktury a plnění své funkce, je možné pomocí genetického inženýrství „přišít“ doménu patřící jiné k jednomu z proteinů (a vytvořit tak chimérický protein ). Taková chiméra s trochou štěstí spojí funkce obou proteinů. Například fúzí DNA-vazebné domény Cas9 s různými regulačními doménami bylo možné získat umělé transkripční faktory (crisprTF), které jsou selektivně nasměrovány do požadovaných oblastí genomu pomocí na míru vyrobených „RNA průvodců“ [1] [2] [3] . Doménu Cas9 lze také použít ke konstrukci umělých restrikčních endonukleáz , represorů a enzymů modifikujících epigenom , jako jsou DNA metylázy a demethylázy.