Manhattan časová osa

Manhattan plot ( angl.  Manhattan plot ) - typ bodového grafu , který obvykle zobrazuje mnoho hodnot, z nichž většina se blíží nule. Často se používá při hledání genomových asociací (GWAS) . [1] Při zpracování výsledků GWAS jsou na ose X vyznačeny genomové souřadnice. Osa y ukazuje opak logaritmu P-hodnoty pro každý jednotlivý nukleotidový polymorfismus . Protože polymorfismy, které mají nejvyšší asociaci se studovaným znakem, mají nejmenší P-hodnotu, jejich hodnota v grafu bude mít maximální hodnotu.

Graf dostal své jméno podle své podobnosti s panoramatem Manhattanu s vysokými mrakodrapy tyčícími se nad množstvím nižších budov.

Poznámky

  1. Eric Reed, Sara Nunez, David Kulp, Jing Qian, Muredach P. Reilly. Průvodce celogenomovou asociační analýzou a postanalytickým dotazováním  // Statistics in Medicine. — 2015-12-10. - T. 34 , č.p. 28 . — S. 3769–3792 . — ISSN 1097-0258 . - doi : 10.1002/sim.6605 . Archivováno z originálu 1. července 2017.