Membránové proteiny

Membránové proteiny jsou proteiny , které jsou zabudovány nebo spojeny s buněčnou membránou nebo membránou buněčné organely . Asi 25 % všech proteinů jsou membránové proteiny. [jeden]

Klasifikace

Membránové proteiny lze klasifikovat podle topologických nebo biochemických principů. Topologická klasifikace je založena na tom, kolikrát protein prochází lipidovou dvojvrstvou. Podle tohoto kritéria se proteiny dělí na monotopické , bitopické a polytopické :

• monotopické proteiny interagují s jedním povrchem membrány a neprocházejí jí;
• bitopické pronikají membránou a interagují s oběma jejími povrchy;
• polytopní pronikají membránou několikrát (mnohonásobná interakce s lipidy).

Monotopické označuje periferní proteiny, zatímco jiné jsou integrální.

Topologická klasifikace

Ve vztahu k membráně se membránové proteiny dělí na poly- a monotopické.

• Polytopické nebo transmembránové proteiny zcela překlenují membránu, a tak interagují s oběma stranami lipidové dvojvrstvy. Transmembránovým fragmentem proteinu je zpravidla alfa helix sestávající z hydrofobních aminokyselin (možná od 1 do 20 takových fragmentů). Pouze v bakteriích , stejně jako v mitochondriích a chloroplastech , mohou být transmembránové fragmenty organizovány jako struktura beta-listu (od 8 do 22 závitů polypeptidového řetězce).
• Integrální monotopické proteiny jsou trvale uloženy v lipidové dvojvrstvě, ale jsou spojeny s membránou pouze na jedné straně, aniž by pronikaly na opačnou stranu.

Biochemická klasifikace

Podle biochemické klasifikace se membránové proteiny dělí na integrální a periferní .

• Integrální membránové proteiny jsou pevně zabudovány v membráně a lze je z lipidového prostředí odstranit pouze pomocí detergentů nebo nepolárních rozpouštědel. Ve vztahu k lipidové dvojvrstvě mohou být integrální proteiny transmembránové polytopické nebo integrální monotopické.
• Proteiny periferní membrány jsou monotopické proteiny. Jsou buď vázány slabými vazbami na lipidovou membránu, nebo jsou spojeny s integrálními proteiny hydrofobními, elektrostatickými nebo jinými nekovalentními silami. Na rozdíl od integrálních proteinů tedy disociují z membrány, když jsou ošetřeny vhodným vodným roztokem (např. nízké nebo vysoké pH, vysoká koncentrace soli nebo chaotropní činidlo). Tato disociace nevyžaduje zničení membrány.

Membránové proteiny mohou být zabudovány do membrány v důsledku mastných kyselin nebo prenylových zbytků nebo glykosylfosfatidylinositolu připojeného k proteinu během jejich posttranslační modifikace .

Odkazy

1. ↑ Stevens TJ a Arkin IT (2000) Mají složitější organismy ve svých genomech větší podíl membránového proteinu?, Proteins , sv. 39 (4): 417-420

• [www.xumuk.ru/encyklopedia/2502.html Biologické membrány]