Reakční mechanismus

Aktuální verze stránky ještě nebyla zkontrolována zkušenými přispěvateli a může se výrazně lišit od verze recenzované 25. prosince 2014; kontroly vyžadují 9 úprav .

Reakčním mechanismem  je podrobný popis procesu přeměny reaktantů na produkty, včetně co nejúplnějšího popisu složení, struktury, geometrie, energie a dalších vlastností meziproduktů , přechodných stavů a ​​produktů. Popis mechanismu často obsahuje označení týkající se pohybu elektronů v částicích, které doprovázejí přechod z produktů na reaktanty. Přijatelný reakční mechanismus musí být v souladu s experimentálními daty, například stereochemie reakce, její stechiometrie , kinetická rovnice atd. Hovoříme o přijatelném mechanismu, protože není neobvyklé, že údaje vyhovují několika možným mechanismům. získané. U většiny reakcí není znám úplný soubor údajů potřebných ke stanovení přesného mechanismu a navrhované mechanismy jsou založeny na neúplných údajích [1] . Z tohoto důvodu lze buď navrhnout, nebo vyvrátit dříve navržený reakční mechanismus. Tvrzení o důkazu reakčního mechanismu se zdá být nesprávné.

Klasifikace mechanismů

Podle pravidel výběru spinů se rozlišují reakční mechanismy zakázané a povolené spiny. Reakční mechanismus je zakázaný, pokud některý z elementárních stupňů reakce probíhá se změnou spinového stavu reagujících částic vzhledem k produktům nebo meziproduktům. Pokud je během reakce zachován spinový stav zúčastněných částic, nazývá se mechanismus jako spin-allowed. Je třeba poznamenat, že termín "spin-zakázaný" není absolutní a zohlednění spin-orbital , spin-spin a dalších interakcí při popisu reakčního mechanismu odstraňuje zákaz zachování spinu. Tyto mechanismy si mohou navzájem konkurovat, což vede k různým reakčním produktům [2] . Pravděpodobnost kroku se zakázanou rotací je vždy menší než jedna a v tomto smyslu prohrává na krok s povolenou rotací [3] . Konečná kinetika a termodynamika reakce však závisí nejen na pravděpodobnosti přechodu v kritickém bodě, ale také na velikosti bariéry, kterou je třeba překonat. Mechanismus zakázaný spin byl navržen k popisu různých reakcí, včetně reakcí v oblasti anorganické [4] , bioanorganické [5] a organokovové chemie [6] . Pozoruhodným příkladem procesu se zakázaným odstřeďováním je interkombinační konverze, zatímco příkladem procesu s povoleným odstřeďováním je vnitřní konverze.

Označení mechanismů

V současné době se k označení reakčních mechanismů nejčastěji používá zápis navržený Christopherem Ingoldem v knize „Structure and Mechanism in Organic Chemistry“ . Ingold rozdělil mechanismy do několika hlavních typů a některé označil určitou zkratkou: adice ( A / Ad ), eliminace ( E ), substituce ( S ), přesmyky atd. Podle tohoto systému patřily reakce také k různým skupiny svou povahou stádium vzniku nebo zániku vazby. Tak byly izolovány nukleofilní , elektrofilní a radikálové reakce. Byly označeny symboly N , E a R , které byly umístěny jako dolní index za typem reakce. Například elektrofilní adiční reakce byly zkráceny A E nebo Ad E [7] .

V roce 1988 IUPAC navrhl novou konvenci pojmenování mechanismů. Vychází z popisu základních úkonů vytváření a rušení vazeb. Tyto akty jsou označeny jako A a D , v tomto pořadí, a jsou psány společně, pokud je proces koordinovaným adičním-štěpením, nebo odděleny znaménkem "+", pokud tyto dva akty probíhají jako samostatné stupně reakce. Pro přechodné situace, kdy meziprodukt žije velmi krátkou dobu (kratší než je doba difúze ), ale déle, než nastane oscilační pohyb v molekule , se místo znaménka „+“ používá znaménko „*“ [8] .

Indexy N a E se používají spolu se symboly A a D , pokud se reakce účastní nukleofilní/nukleofugní nebo elektrofilní/elektrofugní skupiny. Index R se používá pro homolytické (radikální) nejjednodušší změny v molekule. Podobné indexy, psané malými písmeny, se používají v případech, kdy k elementárnímu aktu dochází v tzv. periferních atomech, tedy atomech, které přímo netvoří vazbu A–B, vznikající nebo přerušované. Podobně platí pravidla pro cyklické systémy a další složitější případy. Vzhledem k tomu, že tento přístup implikuje záznam každého zlomu a každého vytvoření vazby, nabylo zde tradiční označení mechanismů (podle Ingolda) poněkud těžkopádnou podobu [8] .

Ingold IUPAC
S N 2 A N D N
S N 1 D N + A N
S E 1 D E + A E
E1 D N + D H (nebo D N + D E )
E2 A xh D H D N
E1cB A n D E + D N (nebo A xh D H + D N )

IUPAC sám potřebu nové notace vysvětlil tím, že Ingoldova nomenklatura nemá za úkol popisovat mechanismy, ale označovat typ transformace, v důsledku čehož mohou nastat nejednoznačné situace, kdy např. Ingoldova notace S E 2 se používá jak pro jednostupňovou aromatickou substituci, tak pro dvoustupňovou reakci na alifatickém atomu uhlíku [9] .

Poznámky

  1. Zlatá kniha IUPAC - Mechanismus reakce . Datum přístupu: 24. prosince 2014. Archivováno z originálu 25. prosince 2014.
  2. Jeremy N. Harvey. Spin-zakázané reakce: výpočetní vhled do mechanismů a kinetiky  //  Wiley Interdisciplinary Reviews: Computational Molecular Science. — 2014-01-01. — Sv. 4 , iss. 1 . — S. 1–14 . — ISSN 1759-0884 . doi : 10.1002 / wcms.1154 . Archivováno z originálu 11. září 2016.
  3. Aleksandr O. Lykhin, Danil S. Kaliakin, Gwen E. dePolo, Alexander A. Kuzubov, Sergej A. Varganov. Nenadiabatická teorie přechodových stavů: Aplikace na mezisystémové křížení v aktivních místech proteinů kov-síra  (anglicky)  // International Journal of Quantum Chemistry. — 2016-05-15. — Sv. 116 , iss. 10 . — S. 750–761 . — ISSN 1097-461X . - doi : 10.1002/qua.25124 . Archivováno z originálu 11. září 2016.
  4. Dmitrij A. Fedorov, Spencer R. Pruitt, Kristopher Keipert, Mark S. Gordon, Sergej A. Varganov. Ab Initio Multiple Spawning Method for Intersystem Crossing Dynamics: Spin-Forbidden Transitions between3B1and1A1Stases of GeH2 (EN) // The Journal of Physical Chemistry A. — 2016-04-27. - T. 120 , č.p. 18 . — S. 2911–2919 . - doi : 10.1021/acs.jpca.6b01406 .
  5. Danil S. Kaliakin, Ryan R. Zaari, Sergej A. Varganov. Vliv vazby H2 na pravděpodobnost nenadiabatického přechodu mezi singletovými a tripletovými stavy [NiFe -Hydrogenase Active Site] (EN) // The Journal of Physical Chemistry A. - 2015-01-30. - T. 119 , č.p. 6 . — S. 1066–1073 . doi : 10.1021 / jp510522z .
  6. Jeremy N Harvey, Rinaldo Poli, Kevin M Smith. Pochopení reaktivity komplexů přechodných kovů zahrnujících více spinových stavů  // Coordination Chemistry Reviews. — 2003-03-01. -T . 238-239 . — S. 347–361 . - doi : 10.1016/S0010-8545(02)00283-7 .
  7. Olah GA Komentáře k „Doporučením IUPAC pro reprezentaci reakčních mechanismů“   // Acc . Chem. Res. - 1990. - Sv. 23 , č. 2 . - str. 31-32 . doi : 10.1021 / ar00170a001 .
  8. 1 2 Systém Guthrie DR pro symbolickou reprezentaci reakčních mechanismů (Doporučení 1988  )  // Pure & Appl. Chem. - 1989. - Sv. 61 , č. 1 . - str. 23-56 . - doi : 10.1351/pac198961010023 .
  9. Guthrie RD, Jencks WP Doporučení IUPAC pro reprezentaci reakčních mechanismů   // Acc . Chem. Res. - 1989. - Sv. 22 , č. 10 . - str. 343-349 . - doi : 10.1021/ar00166a001 .