NevGen

NevGen nebo NevGen je jeden ze světových předpovědních projektů haploskupin , vyvinutý pod vedením srbského projektu DNA a Poreklo Society of srbských genealogů . Autory jsou Aco Nevsky (pseudonym) a Miloš Cetkovich-Gentula. Program vznikl v květnu 2014 jako desktopová aplikace pro potřeby srbských genealogů, od konce roku 2015 existuje i online verze programu. NevGen používá fitness počítač a také bayesovský -  alelový frekvenční přístup k předpovědi, která haploskupina odpovídá haplotypuY-STR. Při výpočtu pravděpodobností větvení navíc využívá vzájemné závislosti hodnot různých značek STR. Neustálý pokrok a četné vědecké práce, ve kterých byl uplatněn, z něj dělají jednoho z nejznámějších prediktorů haploskupin Y-DNA na světě.

Aplikace ve vědě

Používá se v následujících vědeckých pracích (seznam lze rozšířit):

• Dogan S., Babic N., Gurkan C., Goksu A., Marjanovic D., Hadziavdic V. Distribuce Y-chromozomálních haploskupin v kantonu Tuzla v Bosně a Hercegovině: Studie shody využívající čtyři různé algoritmy přiřazení in silico založené na Y -STR data  (anglicky)  // Homo : journal. - 2016. - Sv. 67 , č. 6 . - str. 471-483 . - doi : 10.1016/j.jchb.2016.10.003 .

• Szargut M., Ossowski A., Kuś M., Zielińska G., Rębacz-Maron E. Predikce haploskupiny pomocí různých nástrojů založených na Y-STR ve vzorcích z United Republic of Tanzania  (anglicky)  : journal. - 2016. - doi : 10.13140/RG.2.2.25831.04003 .

• Mustafin KK, Alborova IE, Semenov AS, Višněvskij VP Analýza haploskupiny pro středověký ruský pohřeb ze 16.–17. století v Radoneži (oblast Moskvy)  (anglicky)  // Studia Slavica et Balcanica Petropolitana : časopis. - 2018. - Sv. 24 , č. 2 . - S. 169-180 . - doi : 10.21638/spbu19.2018.209 .

• Diepenbroek M., Cytacka S., Szargut M., Arciszewska J., Zielińska G., Ossowski A. Analýza mužské specifické oblasti lidského chromozomu Y vrhá světlo na historické události v nacisty okupovaném východním Polsku  (anglicky)  // International journal právního lékařství: časopis. - 2018. - S. 395-409 . - doi : 10.1007/s00414-018-1943-0 .

• Poriswanish N., Neumann R., Wetton JH, Wagstaff J., Larmuseau MH, Jobling MA, květen, CA Rekombinační aktivní body v rozšířené lidské pseudoautozomální doméně předpovězené z map dvouřetězcových zlomů a charakterizované zkříženou analýzou založenou na spermatu  (eng. )  // genetika PLoS : deník. - 2018. - Sv. 14 , č. 10 . - doi : 10.1371/journal.pgen.1007680 .

• Kačar T., Stamenković G., Blagojević J., Krtinić J., Mijović D., Marjanović D. Genetická data chromozomu Y definovaná 23 krátkými tandemovými repeticemi v srbské populaci na Balkánském poloostrově  (anglicky)  // Annals of human biology : deník. - 2019. - Sv. 46 , č. 1 . - str. 77-83 . – doi : 10.1080/03014460.2019.1584242 .

• Al-Snan NR, Messaoudi SA, Khubrani YM, Wetton JH, Jobling MA, Bakhiet M. Genetická variace na 27 y-strs ve čtyřech oblastech Bahrajnu  //  bioRxiv: journal. - 2019. - doi : 10.1101/787341 .

• Kiesler KM, Andreaggi KS, Ring JD, Taylor CR, Marshall CK, Vallone PM Sekvenování úplných mitochondriálních genomů pro vzorky populace NIST  (nedefinováno)  // Forensic Science International: Genetics Supplement Series. - 2019. - S. 452-453 .

• López-Ramírez YL, Aguilar-Velázquez JA, López-Armenta M., Ruiz-Hernández M., Rangel-Villalobos H. Paternální linie a forenzní parametry založené na 23 Y-STR (Powerplex® Y23) u mužů Mestizo z Mexico City  ( anglicky)  // International journal of legal medicine: journal. - 2019. - S. 199-202 . - doi : 10.1007/s00414-019-02183-1 .

• Szargut M., Diepenbroek M., Zielińska G., Cytacka S., Arciszewska J., Jałowińska K., Ossowski A. Je MPS vždy odpovědí? Použití dvou metod založených na PCR pro Y-chromozomální haplotypizaci ve vysoce a středně degradovaném kostním materiálu  // Forensic Science International:  Genetics : deník. - 2019. - S. 181-189 . - doi : 10.1016/j.fsigen.2019.07.016 .

• Daniels-Higginbotham J., Gorden EM, Farmer SK, Spatola B., Damann F., Bellantoni N., Parson W. Testování DNA odhaluje domnělou identitu JB55, upíra z 19. století pohřbeného v Griswold,   Connecticut / - 2019. - S. 1-11 . - doi : 10.3390/genes10090636 .

• Jannuzzi J., Ribeiro J., Alho C., Arão G., Cicarelli R., Corrêa H., Mota MF Mužské linie v brazilských populacích a výkonnost nástrojů pro predikci haploskupin  // Forensic Science International:  Genetics : deník. - 2020. - Sv. 44 . - doi : 10.1016/j.fsigen.2019.102163 .

• Fóthi E., Gonzalez A., Fehér T. a kol. Genetická analýza mužských maďarských dobyvatelů: evropské a asijské otcovské linie dobyvatelských maďarských kmenů  (anglicky)  // Archaeol Anthropol Sci : journal. - 2020. - Sv. 12 , č. 31 . - str. 77-83 . - doi : 10.1007/s12520-019-00996-0 .

Viz také

• Genealogický test DNA
• Společnost srbských genealogů "Poreklo"

Odkazy

• Srbský projekt DNA
• Diverzifikované genetické dědictví  (Srb.)