Proteoformy ( anglicky proteoforms ) - proteinové skupiny nebo druhy proteinů , které vznikají v důsledku modifikací proteinů: substituce aminokyselin (polymorfismus jedné aminokyseliny) (SAP), alternativní sestřih (AS) a posttranslační modifikace (PTM), jako je fosforylace . Termín „druh proteinu“ nebo „proteoforma“ označuje nejmenší jednotku proteomu, tj. polypeptid , který má jedinečnou sekvenci a nese jedinečný soubor posttranslačních modifikací [1] .
Cílem hlavní fáze projektu Human Proteome bylo doplnit hlavní proteom o informace o formách proteinů vzniklých různými modifikacemi, jako je přítomnost nesynonymních jednonukleotidových polymorfismů v genomu, alternativní procesy sestřihu a posttranslační modifikace. Výsledkem bylo, že namísto hlavního proteomu získaného v pilotní fázi, kdy jednomu genu odpovídal pouze jeden (master) protein, byla v hlavní fázi projektu analyzována celá řada možných proteoforem kódovaných jedním genem. Jeden gen může kódovat až 100 proteinů (tj. několik milionů proteoforem v měřítku organismu) nebo několik desítek tisíc pro lidský chromozom 18 . Hlavní fáze projektu Human Proteome umožní kriticky zhodnotit existující bioinformatické prediktivní algoritmy a případně vyvinout nové algoritmy založené na experimentálních datech pro detekci nekanonických proteoforem [2] .